Construção in silico de uma vacina multi-epítopo contra o gênero Rickettsia através de imunoinformática

• Ano de defesa: 2023
• Autor(a) principal: FELICE, Andrei Giacchetto
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal do Triângulo Mineiro; Instituto de Ciências da Saúde - ICS::Curso de Medicina; Brasil; UFTM; Programa de Pós-Graduação em Medicina Tropical e Infectologia
• Palavras-chave em Português: Rickettsia.; Proteínas.; Bioinformática.; Vacinas.; Proteins.; Bioinformatic.; Vaccines.; CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::BIOLOGIA GERAL
• Link de acesso: http://bdtd.uftm.edu.br/handle/123456789/1806

O gênero Rickettsia, pertencente ao filo das Proteobacterias, é composto principalmente por quatro grupos de microrganismos: o grupo tifo, o grupo Spotted fever, grupo ancestral e o grupo transicional. Essas espécies são causadoras de doenças de importância para a saúde pública como por exemplo tifo epidêmico, tifo murino, febre maculosa das Montanhas Rochosas e febre maculosa do Mediterrâneo. Apesar do aumento no número de casos, ainda não existe uma vacina contra as doenças causadas por esse gênero. Este trabalho visa o desenvolvimento in silico de uma vacina multi-epítopo com potencial imune contra o gênero Rickettsia. Então, oito proteínas previamente identificadas como potenciais candidatas a vacinais contra essas bactérias, passaram por um processo de predição de epítopos ligantes às moléculas do complexo de histocompatibilidade, do tipo I e II, e depois por análises de qualidade quanto à sua antigenicidade, alergenicidade e toxicidade. Aqueles que passaram por essa filtragem foram unidos com linkers e um adjuvante para formar uma única proteína quimérica multi-epítopo, a qual passou pela predição da estrutura tridimensional e posterior análise de docking molecular contra o receptor do tipo Toll Like-4, presente nas células do hospedeiro. Por fim, a proteína foi testada quanto a simulação da sua resposta imune através de machine learning. Um total de vinte e seis epítopos imunogênicos, sendo 13 ligantes para cada tipo das moléculas do complexo de histocompatibilidade, foram ligados para a construção da proteína multi-epítopo. A proteína apresentou ótimos parâmetros imunogênicos e não foi considerada tóxica e nem alérgica ao hospedeiro. Além disso, apresentou uma boa estimulação de células imunes, com potencial geração de células de memória. As validações in silico sugerem uma vacina com eficácia contra a ação dessas bactérias e devem ser validadas in vitro.