O filoma de Schistosoma mansoni

• Ano de defesa: 2010
• Autor(a) principal: Larissa Lopes Silva Scholte
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Minas Gerais; Brasil; ICB - INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLOGICAS; Programa de Pós-Graduação em Genética; UFMG
• Palavras-chave em Português: Genética; Schistosoma mansoni; Esquistossomose; Anotação funcional; Filogenômica
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/1843/39068

Schistosoma mansoni é um parasito platelminto da classe Trematoda e é um dos agentes etiológicos da esquistossomose, uma das doenças infecciosas e parasitárias mais prevalentes no mundo, sendo endêmica em 76 países e territórios onde aproximadamente 210 milhões de pessoas encontram-se infectadas e outras 779 mil vivem em áreas de risco de infecção. O proteoma predito deste parasito foi publicado recentemente e contém mais de 13.000 proteínas. Contudo, mais de 40% permanece sem função predita ou caracterização experimental. Em virtude do exposto, o presente trabalho teve como objetivo principal aprimorar a anotação do genoma de S. mansoni utilizando a abordagem filogenética para a predição de ortólogos. A reconstrução da história evolutiva de todas as proteínas codificadas no genoma de S. mansoni foi realizada através de um pipeline automático, como implementado no PhylomeDB (http://phylomedb.org), um banco de dados de filomas. O filoma resultante possui 8.818 árvores filogenéticas obtidas a partir da análise comparativa de 13.285 proteínas de S. mansoni com os potenciais homólogos em 16 outros organismos, incluindo uma planta, fungos, nematóides, artrópodes, urocordados, cefalocordados e vertebrados. Utilizando a abordagem filogenética para a predição de ortólogos foi possível transferir anotação funcional (termos GO) para 5.507 proteínas de S. mansoni, das quais 946 eram anotadas previamente como “proteínas hipotéticas” ou “proteínas expressas” que correspondem a proteínas cuja função é completamente desconhecida. Além de promover uma melhora significativa na predição funcional do proteoma de S. mansoni, os resultados desta análise provêm informações importantes sobre a evolução do genoma deste parasito, como a identificação de duplicações gênicas que podem estar relacionadas a especificidades morfológicas ou fisiológicas deste organismo. Todos os alinhamentos de sequências, árvores filogenéticas e anotação funcional serão disponibilizadas através dos bancos de dados PhylomeDB (http://phylomedb.org) e SchistoDB (http://schistodb.net), fornecendo uma vasta fonte de informações para a comunidade científica