Identificação da microbiota cecal de duas linhagens de galinha caipira e associação com consumo alimentar residual

• Ano de defesa: 2020
• Autor(a) principal: Cavalcante, Shilton Reino
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
• Palavras-chave em Português: 16S sequencing; Chicken; Consumo; Feed intake; Frango; Microbiota; Sequenciamento 16S
• Link de acesso: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/11/11139/tde-21052020-132258/

As linhagens de galinha Caipirão e Caipirinha são tidas como linhagens caipira, com objetivo de criação extensionista esses animais apresentam características produtivas inferiores, como ganho de peso e rendimento de carcaça, quando comparados a linhagens de comerciais. As tecnologias de sequenciamento veem proporcionando novas linhas de pesquisas na avicultura, como por exemplo a metagenômica. O estudo de metagenômica tem como objetivo estudar a diversidade microbiológica intestinal das aves e assim torna-se uma ferramenta alternativa para melhorar o desempenho dos animais, além de conhecer quais microrganismos podem contribuir para futuros probióticos. Neste trabalho o objetivo foi de estudar a diversidade e abundância da microbiota cecal nas linhagens de galinha caipira (Caipirão e Caipirinha), selecionando os animais com base no consumo alimentar residual (CAR). Os resultados obtidos condizem com a literatura, ambas as linhagens apresentam como filos dominantes os firmicutes, bacteriodota e Euryarchaeota com aproximadamente 35%, 27% e 24% da comunidade microbiológica cecal. As análises de diversidade alpha e beta não houveram diferença significativa, apontando semelhança entre os grupos. As análises de microrganismos diferencialmente abundante foram realizadas pelo pacote EdgaR com Limma+Voom. A linhagem Caipirão não apresentou microrganismo diferencialmente abundante, já a linhagem Caipirinha o microrganismo Ruminococcus lactaris foi considerado significativamente mais abundante ao grupo com menor valor de CAR, ao p-valor de 0,05 e log de Fold change 1,33, assim tornando esse microrganismo um candidato ao bem-estar e produção animal.