Taxonomia e reclassificação de estirpes do gênero Azospirillum e Nitrospirillum pertencentes ao Centro de Recursos Biológicos Johanna Döbereiner

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2022
Autor(a) principal: Ferreira, Natália dos Santos lattes
Orientador(a): Zilli, Jerri Édson lattes
Banca de defesa: Zilli, Jerri Édson lattes, Coelho, Irene da Silva lattes, Reis, Veronica Massena lattes, Bach, Evelise lattes, Moreira, Fatima Maria de Souza lattes
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Agronomia - Ciência do Solo
Departamento: Instituto de Agronomia
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/20209
Resumo: O Centro de Recursos Biológicos Johanna Döbereiner - CRB-JD, é uma coleção de culturas pertencente ao Centro Nacional de Pesquisa em Agrobiologia (CNPAB), existe oficialmente desde 1960, é mundialmente conhecido por manter uma alta diversidade de bactérias fixadoras de nitrogênio, além de conter espécies microbianas com potencial para serem utilizadas em benefício da sociedade brasileira. Hoje seu acervo abriga cerca de (53) leveduras, (64) fungos filamentosos, (6060) bactérias de diversos gêneros. Grande parte da Coleção foi identificada por meio de características bioquímicas e morfológicas. No entanto, com base nos métodos moleculares atualmente aceitos na análise do genoma, ainda faltam informações taxonômicas sobre as cepas. Diante disso, o presente trabalho propôs, por meio de análise molecular, caracterizar uma parte da coleção de germoplasma para os gêneros Azospirillum e Nitrospirillum. Ambos os gêneros possuem rizobactérias promotoras do crescimento vegetal com capacidade de fixar nitrogênio atmosférico e produzir compostos benéficos para as plantas e estão presentes em diferentes condições edafoclimáticas. As análises moleculares foram baseadas em caracterizações filogenéticas combinadas (16S rRNA, recA); genômica (identidade nucleotídica média (ANI) com valores de circunscrição de 96% e linha de corte de hibridização digital DNA-DNA (dDDH) de 70%, proteoma central). As análises funcionais são definidas apenas para as espécies de Azospirillum, são baseadas em caracterizações fenotípicas e bioquímicas. Este trabalho originou duas propostas de reclassificação taxonômica, definidas como Azospirillum baldaniorum Sp245T e Azospirillum argentinense Az39T , anteriormente classificadas como espécies pertencentes a Azospirillum brasilense. Além da classificação filogenética das cepas dos gêneros Azospirillum e Nitrospirillum, evidenciando a alta diversidade entre cepas das espécies de ambos os gêneros, sugerindo a existência de novas espécies e acrescentando informações ao banco de dados desta coleção de estirpes erroneamente classificadas pertencentes a outros gêneros.