Detalhes bibliográficos
| Ano de defesa: |
2023 |
| Autor(a) principal: |
Patrocínio, Helmut Kennedy Azevedo do |
| Orientador(a): |
Lima, João Paulo Matos Santos |
| Banca de defesa: |
Não Informado pela instituição |
| Tipo de documento: |
Dissertação
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| Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
| Idioma: |
por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal do Rio Grande do Norte
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| Programa de Pós-Graduação: |
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOINFORMÁTICA
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Brasil
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| Palavras-chave em Português: |
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| Área do conhecimento CNPq: |
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| Link de acesso: |
https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/58152
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Resumo: |
A Síndrome de Guillain-Barré (SGB) e a esclerose múltipla são doenças autoimunes associadas a resposta imunológica contra autoantígenos do sistema nervoso periférico (SNP) e central, respectivamente. A maioria dos estudos sobre a imunopatologia da SGB investigam a reação cruzada entre antígenos de gangliosídeos da bainha de mielina e carboidratos da bactéria Campylobacter jejuni. Entretanto, a SGB apresenta um espectro de subtipos e, particularmente, a forma desmielinizante possui poucas evidências de relação com C. jejuni ou de autoimunidade contra gangliosídeos. Já a imunopatologia da esclerose múltipla é mais conhecida e diversos autoantígenos proteicos foram relatados. Como o vírus EpsteinBarr (EBV) pode representar um fator de risco potencial tanto para a esclerose múltipla quanto para a forma desmielinizante da SGB, a presente investigação visa identificar resíduos cruciais entre potenciais epítopos de linfócitos T CD4+ do EBV e proteínas do sistema nervoso como um meio de sugerir como a infecção por este vírus pode contribuir para a patogênese de doenças. Bancos de dados biológicos foram usados para a seleção de proteínas abundantes no sistema nervoso, proteínas imunogênicas do EBV e haplótipos de HLA. Também foram utilizadas ferramentas computacionais para predição de peptídeos ligantes do HLA e de imunogenicidade. Um algoritmo em linguagem Python foi desenvolvido para comparação de identidade entre os resíduos dos nonâmeros. Foram encontradas 10 proteínas do sistema nervoso e 28 do EBV, as quais foram usadas na predição de peptídeos ligantes de 21 HLAs comuns na população mundial. Foram localizados ao todo 1411 haplótipos, os quais se distribuem entre 51 pares de HLAs. Os nonâmeros das proteínas do EBV e proteínas da mielina foram combinados em pares e comparados quanto a identidade em resíduos críticos para a interação com o receptor de células T (TCR). Para tal comparação foram propostos três critérios de seleção de acordo com a relevância de cada contato para interação TCR-peptídeo-MHC. O contato principal deve estar localizado na posição P5, enquanto as posições P2, P3 e P8 são secundárias e P4, P6 e P7 são terciárias. A proteína Periaxina, que nunca foi estudada como fonte de autoantígenos, apresentou a maior quantidade de pares de nonâmeros entre as proteínas do SNP, 35. Quatro pares de nonâmeros de APLP1, dois de CNP e dois da MBP ligam-se a alelos do haplótipo DR-15, conhecido como fator de risco para a esclerose múltipla. A nova abordagem aqui proposta baseada na identidade de sequência em resíduos críticos de contato do TCR revelou que vários peptídeos derivados de proteínas do sistema nervoso e do EBV compartilham identidade nesses resíduos, sugerindo a possibilidade de reatividade cruzada entre eles. Os pares de nonâmeros aqui encontrados podem subsidiar a investigação de autoantígenos em experimentos laboratoriais. |
