Análise intersticial de complexos pMHC para predição de afinidade de ligação

• Ano de defesa: 2017
• Autor(a) principal: Freitas, Martiela Vaz de
• Orientador(a): Vieira, Gustavo Fioravanti
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Palavras-chave em Português: Complexo pMHC; Peptídeos
• Palavras-chave em Inglês: Binding; Volume; PMHC Complex; Peptide
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/10183/216513

O MHC é uma molécula apresentadora que possui um papel importante tanto na apresentação de peptídeos próprios como não-próprios, para que todo o sistema imune possa diferenciar a produção normal de proteínas de uma célula, da produção de proteínas de uma célula infectada por um patógeno. Existem duas vias de apresentação de antígenos: a via de Classe I, que apresenta peptídeos endógenos e a via de Classe II que apresenta preferencialmente peptídeos exógenos. Este trabalho atém-se à via de Classe I, pelo fato de que a própria estrutura deste MHC facilita o processo de modelagem. Isso se deve às características de sua fenda, que possui um espaço de apresentação fechado nas extremidades, permitindo apenas a acomodação de peptídeos menores (entre 8 e 12 aminoácidos). Aqui, buscou-se analisar estruturalmente a interação entre o peptídeo e o MHC, para inferir se um peptídeo é um ligante ou não. A capacidade de ligação de um peptídeo ao MHC é um ponto crucial para a imunogenicidade do mesmo. Até então a maioria das ferramentas que pretendem realizar a predição deste fenômeno são baseadas apenas na análise da sequência de aminoácidos.