Detalhes bibliográficos
| Ano de defesa: |
2020 |
| Autor(a) principal: |
Teixeira, Diego Gomes |
| Orientador(a): |
Jeronimo, Selma Maria Bezerra |
| Banca de defesa: |
Não Informado pela instituição |
| Tipo de documento: |
Tese
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| Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
| Idioma: |
por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal do Rio Grande do Norte
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| Programa de Pós-Graduação: |
PROGRAMA DE PÓS-GRADUAÇÃO EM BIOQUÍMICA
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Brasil
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| Palavras-chave em Português: |
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| Link de acesso: |
https://repositorio.ufrn.br/handle/123456789/30763
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Resumo: |
O vírus Chikungunya (CHIKV) é um Alphavirus, transmitido por mosquitos, que reemergiu nos últimos vinte anos. A infecção por CHIKV pode evoluir com um amplo espectro de sintomas, variando de infecção assintomática, doença leve à doença grave, como artrite debilitante ou encefalites. O objetivo do presente estudo foi investigar a expressão gênica global associada a diferentes desfechos da infecção pelo CHIKV no primeiro surto ocorrido no Rio Grande do Norte em 2016. Amostras de sangue total foram coletadas de pessoas infectadas e de pessoas não expostas a CHIKV. Infecção por CHIKV foi determinada considerando os ensaios por RT-qPCR ou sorológicos. Entre as pessoas estudadas, 4 estavam na fase aguda, 6 na fase de recuperação ou sintomas leves, e 2 eram de pessoas com infecção assintomáticas. O RNA-seq foi realizado a partir de amostras de sangue total, e os fragmentos sequenciados foram mapeados por alinhamento aos genomas humano ou do CHIKV. As bibliotecas tiveram uma média de 96% de mapeamento para regiões de genes do genoma humano. Três amostras de pessoas na fase aguda continham sequências que foram mapeadas ao genoma do CHIKV. O número de genes diferencialmente expressos (GDEs) entre os transcriptomas dos grupos Assintomático, Agudo e Não-Agudo foram, respectivamente, 490, 1463 e 370. Os DEGs do grupo Agudo estavam associados à resposta do interferon tipo I com a superexpressão de STAT1, STAT2 e uma série de outros genes estimulados por interferon (ISGs), como RSDA2 e IRF7. Já a quantidade de ISGs diferencialmente expressos pelo grupo de pessoas com infecção assintomática é reduzo, o que pode está relacionado a uma resposta fraca por interferon de tipo I. Um outro destaque dentre o conjunto de GDEs das pessoas assintomáticas, é a subexpressão do gene codificante da Granzima A (GZMA), um dos principais promotores da inflamação na artrite. As análises de enriquecimento com termos do Gene Ontology, utilizando os GDEs, mostram que o grupo de pessoas na fase aguda da doença apresentam alta expressão em genes relacionados ao processo de eliminação do vírus, resposta inflamatória e controle da replicação celular. Uma análise de de enriquecimento por anotação funcional do Ingenuity Pathway Analysis mostra que os GDEs no grupo de pessoas assintomáticas estão envolvidos na repressão da ativação de leucócitos e na diminuição do movimento celular de monócitos e leucócitos. Nossos achados sugerem que um estado inflamatório está presente durante a infecção aguda por CHIKV sintomático, enquanto há uma diminuição nesses marcadores durante a infecção assintomática. |
