Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: |
2019 |
Autor(a) principal: |
VASCONCELOS, Maria Eduarda Ferraz |
Orientador(a): |
PEDROSA-HARAND, Andrea |
Banca de defesa: |
Não Informado pela instituição |
Tipo de documento: |
Dissertação
|
Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
Idioma: |
por |
Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Pernambuco
|
Programa de Pós-Graduação: |
Programa de Pos Graduacao em Biologia Vegetal
|
Departamento: |
Não Informado pela instituição
|
País: |
Brasil
|
Palavras-chave em Português: |
|
Link de acesso: |
https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/46189
|
Resumo: |
Sequências repetitivas são responsáveis por grandes diferenças entre os genomas, pois variam mais rapidamente que sequências únicas. Além disso, eventos de recombinação entre sequências repetitivas similares podem levar a rearranjos cromossômicos. No gênero Phaseolus, o grupo Leptostachyus, com três espécies incluindo P. leptostachyus e P. macvaughii, apresenta cariótipo disploide devido a uma inserção cêntrica, além de várias translocações. O objetivo do trabalho foi investigar a fração de DNA repetitivo dessas duas espécies e analisar sua possível relação com a ocorrência de rearranjos. Para isso, suas sequências repetitivas foram comparadas com as de outras 11 espécies, três delas cariotipicamente estáveis. As sequências foram agrupadas por similaridade no RepeatExplorer e a ferramenta Tarean foi usada para identificação de DNAs satélites. As principais sequências foram localizadas in situ. Os elementos Ty3/gypsy, mais especificamente a linhagem Chromovirus, foram os mais abundantes em Phaseolus e tiveram uma distribuição cromossômica preferencialmente pericentromérica. A variação na abundância das principais linhagens de elementos transponíveis entre espécies de Leptostachyus foi similar à variação entre as mesmas e as demais espécies do gênero, sugerindo rápido turnover no grupo. Os DNAs satélites compartilhados revelaram padrões de distribuição cromossômica diferentes entre as espécies, confirmando sua rápida evolução no genoma. A distribuição atípica de um dos satélites se mostrou compatível com uma possível associação desse com os rearranjos cromossômicos frequentes no grupo. |