Detecção molecular de arbovirus emergentes: West Nile, Saint Louis e Mayaro

• Ano de defesa: 2021
• Autor(a) principal: Rolo, Carolina de Araújo
• Orientador(a): Campos, Gubio Soares
• Banca de defesa: Campos, Gubio Soares , Pires, Acássia Benjamim Leal, Pacheco, Luis Gustavo Carvalho
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal da Bahia
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-graduação em Biotecnologia (PPGBiotec)
• Departamento: Instituto de Ciências da Saúde - ICS
• País: Brasil
• Palavras-chave em Português: Diagnóstico; Arbovírus; RT-qPCR; Emerging arboviruses; Diagnosis
• Área do conhecimento CNPq: CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS::MICROBIOLOGIA::MICROBIOLOGIA MEDICA
• Link de acesso: https://repositorio.ufba.br/handle/ri/34685

As arboviroses são doenças virais transmitidas por vetores artrópodes, especialmente mosquitos do gênero Aedes e Culex. Estas doenças estão dispersas por todo o mundo e causam grandes impactos na saúde e na economia. No Brasil existem diversas arboviroses em circulação, como zika (ZIKV) e dengue (DENV). Algumas arboviroses são consideradas emergentes, como mayaro (MAYV), vírus da encefalite de Saint Louis (SLEV) e vírus do oeste do Nilo (WNV). Apesar de terem sido detectadas no Brasil e terem potencial para causar epidemias, estas arboviroses ainda não se disseminaram dentro do território brasileiro. Por conta de características geográficas e sociais, o Brasil apresenta o ambiente ideal para dispersão de arboviroses. Diante deste contexto, foram desenvolvidos ensaios de PCR em tempo real (qPCR) para detecção dos vírus SLEV e MAYV. Para padronização do qPCR foi empregado um plasmídeo contendo as sequências dos referidos vírus e, a partir destas sequências, foram desenhados os iniciadores e sondas. Para o ensaio de MAYV foi possível obter 96,39% de eficiência e, no que diz respeito a sensibilidade, detecção de uma cópia de RNA viral. Quanto ao ensaio de SLEV, foi obtida uma eficiência de 104,67% e sensibilidade para detecção de uma cópia de RNA viral. Em relação a especificidade, ambos os ensaios se mostraram específicos para os vírus de interesse. Os ensaios padronizados para SLEV e MAYV apresentaram eficiência, especificidade e sensibilidade dentro dos padrões determinados para qPCR, sendo adequado seu uso na rotina diagnóstica laboratorial.