Semi-supervised learning methods for unsupervised domain adaptation in medical imaging segmentation

• Ano de defesa: 2019
• Autor(a) principal: Ballester, Pedro Lemos
• Orientador(a): Barros, Rodrigo Coelho
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: eng
• Instituição de defesa: Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul
• Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação
• Departamento: Escola Politécnica
• País: Brasil
• Palavras-chave em Português: Aprendizado Profundo; Adaptação de Domínio; Aprendizado Semi-Supervisionado
• Palavras-chave em Inglês: Self-Ensembling; Deep Learning; Domain Adaptation; Semi-Supervised Learning
• Área do conhecimento CNPq: CIENCIA DA COMPUTACAO::TEORIA DA COMPUTACAO
• Link de acesso: http://tede2.pucrs.br/tede2/handle/tede/8843

Aplicações com aprendizado de máquina possuem diversas suposições sobre o cenário em que são colocadas. Uma suposição comum é a de que o ambiente de teste segue a mesma distribuição dos dados de treino. Essa suposição é sistematicamente quebrada em cénarios do mundo real; a diferença entre essas distribuições é conhecida como domain shift. Adaptação de domínio não-supervisionada visa mitigar esse problema impulsionando o conhecimento dos modelos com dados do ambiente de teste. Uma das áreas mais sensíveis a domain shift é a de imagens médicas. Devido a heterogeneidade das distribuições de dados das máquinas de aquisição de imagens, os modelos tendem a variar sua performance preditiva quando lidam com imagens vindas de máquinas sem nenhum exemplo no conjunto de treino. Este trabalho propõe duas contribuições. Primeiramente, o uso de self ensembling em adaptação de domínio para segmentação de imagens médicas para segmentação de substância cinzenta na medula espinhal é introduzido. Em seguida, baseado no sucesso do self-ensembling, outros trabalhos recentes da literatura de aprendizado semi-supervisionado são adaptados para o contexto apresentado, nominalmente, unsupervised data augmentation e MixMatch. Foram conduzidos estudos de ablação e experimentos para compreensão do comportamento dos métodos e comparação dos seus melhores resultados. Os resultados indicam uma melhoria em relação a treinamento puramente supervisionado, além de demonstrar que os métodos recentes de aprendizado semi-supervisionado são promissores para o campo de adaptação de domínio em segmentação de imagens médicas.