Rotavirus A in Mozambique: Undernutrition, risk factors, and vaccine effectiveness (Rotarix®) in children under five years old with diarrhea

Bibliographic Details
Main Author: CHISSAQUE, Assucênio Hortêncio
Publication Date: 2023
Language: eng
Source: Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
Download full: http://hdl.handle.net/10362/167486
Summary: Resumo Introdução: Moçambique introduziu a vacina contra rotavírus (Rotarix®) em Setembro de 2015. No entanto, ainda existe escassez de dados sobre a epidemiologia do Rotavírus A (RVA) e ainda não foi determinada a sua efectividade. O principal objectivo desta tese é analisar a frequência do RVA, potenciais factores de risco (sociodemográficos e clínicos) em quatro províncias nos períodos pré (2015) e pós-vacinal (2016-2019) e estimar a efectividade da vacina contra a hospitalização em crianças Moçambicanas. Métodos: Trata-se de uma análise transversal e caso-controlo de base hospitalar da Vigilância Nacional de Diarreias (ViNaDia) e Diarrhoeal Disease Surveillance nas províncias de Maputo, Sofala, Zambézia e Nampula nos anos 2015-2019. As medidas antropométricas foram utilizadas para calcular os índices de peso para idade, peso para altura e altura para idade por meio de Z-Scores. As amostras de fezes foram testadas por ELISA e as positivas foram submetidas a caracterização molecular. As variáveis qualitativas foram descritas através de frequências e para testar associações usou-se o teste qui-quadrado ou Exacto de Fisher. Os modelos de regressão logística múltipla foram usados para estimar os odds-ratios ajustados. A efectividade da vacina (EV) ajustada foi calculada para pelo menos uma dose de vacina versus zero doses usando regressão logística não condicional, onde EV = (1 – aOR) x 100%. Resultados: A frequência da infecção pelo RVA reduziu de 42,7% para 12,2% entre os períodos pré e pós-vacinal em crianças desnutridas. A chance de infecção foi maior em crianças de 0-11 meses (p<0.001), residentes em Maputo (p=0.019) em relação a Sofala e em agregados com ≥5 membros (p=0.029). Adicionalmente, foi observada uma alta proporção de crianças desnutridas HIV-positivas e coinfetadas com RVA (7,4%). A análise da província de Nampula não estratificada pelo estado nutricional verificou uma ligeira redução da frequência de RVA de 34,9% para 21,8% entre os períodos pré e pós-vacinal, a fonte de água para beber esteve associada com a infeção pelo RVA (p< 0.001) no período pré-vacinal enquanto que no pós-vacinal encontram-se associações com a idade (p= 0.028), o ano (p=0.004) e o contato com animais (p=0.048). A frequência foi maior em crianças parcialmente vacinadas (40,7%, 11/27) e os genótipos G1P[8] (29,1%, 16/55) e G9P[4] (18,2%, 10/55) foram os mais comuns em crianças vacinadas. A EV ajustada em crianças de 6 a 11 meses foi de 52,0% (95% CI, -11, 79) e -24,0% (95% CI, -459, 62) entre crianças de 12 a 23 meses. A EV parece ser menor em crianças com desnutrição crónica do que em crianças sem desnutrição crónica (14,0% (95% CI, -138, 66) vs. 59% (95% CI, -125, 91)). Conclusão: A introdução da vacina contribuiu para redução da frequência da infeção por RVA. Foram identificados determinantes importantes para a infeção pelo RVA como: idade das crianças, proveniência, agregados numerosos, água canalizada e contacto com animais. A frequência da infeção foi maior em crianças vacinadas menores de 12 meses vacinadas. A efetividade da vacina foi muito baixa e parece reduzir em crianças com desnutrição crónica e mais velhas. Estes resultados mostram a necessidade da realização de estudos de seguimento para crianças com tripla condição (RVA, desnutrição e HIV) e pesquisas que permitam compreender os fatores relacionados com a infecção em crianças vacinadas e a sua resposta imunológica as vacinas.
id RCAP_bda702e736800d496afd18b33bcce17b
oai_identifier_str oai:run.unl.pt:10362/167486
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
repository_id_str https://opendoar.ac.uk/repository/7160
spelling Rotavirus A in Mozambique: Undernutrition, risk factors, and vaccine effectiveness (Rotarix®) in children under five years old with diarrheaSaúde públicaDoenças tropicaisDesnutriçãoRotavírusCriançasVacinaçãoMoçambiqueDomínio/Área Científica::Ciências MédicasResumo Introdução: Moçambique introduziu a vacina contra rotavírus (Rotarix®) em Setembro de 2015. No entanto, ainda existe escassez de dados sobre a epidemiologia do Rotavírus A (RVA) e ainda não foi determinada a sua efectividade. O principal objectivo desta tese é analisar a frequência do RVA, potenciais factores de risco (sociodemográficos e clínicos) em quatro províncias nos períodos pré (2015) e pós-vacinal (2016-2019) e estimar a efectividade da vacina contra a hospitalização em crianças Moçambicanas. Métodos: Trata-se de uma análise transversal e caso-controlo de base hospitalar da Vigilância Nacional de Diarreias (ViNaDia) e Diarrhoeal Disease Surveillance nas províncias de Maputo, Sofala, Zambézia e Nampula nos anos 2015-2019. As medidas antropométricas foram utilizadas para calcular os índices de peso para idade, peso para altura e altura para idade por meio de Z-Scores. As amostras de fezes foram testadas por ELISA e as positivas foram submetidas a caracterização molecular. As variáveis qualitativas foram descritas através de frequências e para testar associações usou-se o teste qui-quadrado ou Exacto de Fisher. Os modelos de regressão logística múltipla foram usados para estimar os odds-ratios ajustados. A efectividade da vacina (EV) ajustada foi calculada para pelo menos uma dose de vacina versus zero doses usando regressão logística não condicional, onde EV = (1 – aOR) x 100%. Resultados: A frequência da infecção pelo RVA reduziu de 42,7% para 12,2% entre os períodos pré e pós-vacinal em crianças desnutridas. A chance de infecção foi maior em crianças de 0-11 meses (p<0.001), residentes em Maputo (p=0.019) em relação a Sofala e em agregados com ≥5 membros (p=0.029). Adicionalmente, foi observada uma alta proporção de crianças desnutridas HIV-positivas e coinfetadas com RVA (7,4%). A análise da província de Nampula não estratificada pelo estado nutricional verificou uma ligeira redução da frequência de RVA de 34,9% para 21,8% entre os períodos pré e pós-vacinal, a fonte de água para beber esteve associada com a infeção pelo RVA (p< 0.001) no período pré-vacinal enquanto que no pós-vacinal encontram-se associações com a idade (p= 0.028), o ano (p=0.004) e o contato com animais (p=0.048). A frequência foi maior em crianças parcialmente vacinadas (40,7%, 11/27) e os genótipos G1P[8] (29,1%, 16/55) e G9P[4] (18,2%, 10/55) foram os mais comuns em crianças vacinadas. A EV ajustada em crianças de 6 a 11 meses foi de 52,0% (95% CI, -11, 79) e -24,0% (95% CI, -459, 62) entre crianças de 12 a 23 meses. A EV parece ser menor em crianças com desnutrição crónica do que em crianças sem desnutrição crónica (14,0% (95% CI, -138, 66) vs. 59% (95% CI, -125, 91)). Conclusão: A introdução da vacina contribuiu para redução da frequência da infeção por RVA. Foram identificados determinantes importantes para a infeção pelo RVA como: idade das crianças, proveniência, agregados numerosos, água canalizada e contacto com animais. A frequência da infeção foi maior em crianças vacinadas menores de 12 meses vacinadas. A efetividade da vacina foi muito baixa e parece reduzir em crianças com desnutrição crónica e mais velhas. Estes resultados mostram a necessidade da realização de estudos de seguimento para crianças com tripla condição (RVA, desnutrição e HIV) e pesquisas que permitam compreender os fatores relacionados com a infecção em crianças vacinadas e a sua resposta imunológica as vacinas.Abstract Introduction: Mozambique introduced the monovalent rotavirus vaccine (Rotarix®) in September 2015. However, data on the epidemiology of RVA is lacking and the vaccine’s effectiveness has not been determined since its introduction. This thesis aims to analyze the frequency of RVA, potential risk factors (sociodemographic and clinical) in four provinces before (2015) and after (2016-2019) and the vaccine's introduction and estimate its effectiveness in preventing hospitalization in Mozambican children. Methods: This is a hospital-based descriptive cross-sectional and case-control analysis of Vigilância Nacional de Diarreias (ViNaDia) and Diarrhea Disease Surveillance in Maputo, Sofala, Zambézia, and Nampula provinces between 2015-2019. Anthropometric measurements were used to calculate weight-for-age, weight-for-height, and height-for-age indices using Z-Scores. Stool samples were tested for RVA by ELISA, and all positive samples were submitted to molecular characterization. Qualitative variables were described through frequencies and the Chi-square or Fisher's exact test was used to test the association. Multiple logistic regression models were used to estimate adjusted odds-ratios. Adjusted vaccine effectiveness (VE) was calculated for at least one dose of vaccine versus zero doses using unconditional logistic regression, where VE = (1 – aOR) x 100%. Results: The frequency of RVA infection reduced from 42.7% to 12.2% between pre and post-vaccine periods in undernourished children. The probability of infection was higher in children aged 0-11 months (p<0.001), residents in Maputo (p= 0.019), and in households with ≥5 members (p= 0.029). In addition, was observed a high proportion of undernourished HIV-positive children co-infected with RVA (7.4%). The analysis of the Nampula province, not stratified by nutritional status, showed a slight reduction from 34.9% to 21.8% between the pre and post-vaccine periods, the source of drinking water was associated with infection by RVA (p=0.029) in pre-vaccine period; however, in the post-vaccine period was found associations with age (p=0.028), year (p=0.004), and contact with animals (p=0.048). RVA frequency was higher in partially vaccinated children (40.7%, 11/27), and G1P[8] (29.1%, 16/55) and G9P[4] (18.2%, 10/55) genotypes were the most common in vaccinated children. The adjusted VE of at least one dose in children aged 6 to 11 months was 52.0% (95% CI: -11, 79) and -24.0% (95% CI: -459, 62) among children between 12 to 23 months. VE appeared to be lower in children with chronic malnutrition than in children without chronic malnutrition (14% (95% CI: -138, 66) vs. 59% (95% CI: -125, 91)). Conclusion: The introduction of the vaccine reduced the frequency of RVA infection. Important determinants for RVA infection have been identified such as children's age, geographical location, numerous household members, piped water, and contact with animals. The frequency of infection was higher in vaccinated children younger than 12 months. The vaccine's effectiveness was found to be lower and seems to reduce in children with chronic malnutrition and older ones. Factors such as malnutrition and increased age seem to reduce the vaccine's effectiveness. These results highlight the need to carry out follow-up studies on children with the triple condition (RVA, malnutrition, and HIV) and research that allows for an understanding of factors related to infection in vaccinated children and their immune response to vaccines.DEUS, Nilsa Olívia Razão deGONÇALVES, LUZIARUNCHISSAQUE, Assucênio Hortêncio2024-05-17T08:07:54Z2023-062023-062023-06-01T00:00:00Zdoctoral thesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10362/167486TID:101678193enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)instname:FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiainstacron:RCAAP2024-05-22T18:21:38Zoai:run.unl.pt:10362/167486Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireinfo@rcaap.ptopendoar:https://opendoar.ac.uk/repository/71602025-05-28T17:52:03.397758Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) - FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiafalse
dc.title.none.fl_str_mv Rotavirus A in Mozambique: Undernutrition, risk factors, and vaccine effectiveness (Rotarix®) in children under five years old with diarrhea
title Rotavirus A in Mozambique: Undernutrition, risk factors, and vaccine effectiveness (Rotarix®) in children under five years old with diarrhea
spellingShingle Rotavirus A in Mozambique: Undernutrition, risk factors, and vaccine effectiveness (Rotarix®) in children under five years old with diarrhea
CHISSAQUE, Assucênio Hortêncio
Saúde pública
Doenças tropicais
Desnutrição
Rotavírus
Crianças
Vacinação
Moçambique
Domínio/Área Científica::Ciências Médicas
title_short Rotavirus A in Mozambique: Undernutrition, risk factors, and vaccine effectiveness (Rotarix®) in children under five years old with diarrhea
title_full Rotavirus A in Mozambique: Undernutrition, risk factors, and vaccine effectiveness (Rotarix®) in children under five years old with diarrhea
title_fullStr Rotavirus A in Mozambique: Undernutrition, risk factors, and vaccine effectiveness (Rotarix®) in children under five years old with diarrhea
title_full_unstemmed Rotavirus A in Mozambique: Undernutrition, risk factors, and vaccine effectiveness (Rotarix®) in children under five years old with diarrhea
title_sort Rotavirus A in Mozambique: Undernutrition, risk factors, and vaccine effectiveness (Rotarix®) in children under five years old with diarrhea
author CHISSAQUE, Assucênio Hortêncio
author_facet CHISSAQUE, Assucênio Hortêncio
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv DEUS, Nilsa Olívia Razão de
GONÇALVES, LUZIA
RUN
dc.contributor.author.fl_str_mv CHISSAQUE, Assucênio Hortêncio
dc.subject.por.fl_str_mv Saúde pública
Doenças tropicais
Desnutrição
Rotavírus
Crianças
Vacinação
Moçambique
Domínio/Área Científica::Ciências Médicas
topic Saúde pública
Doenças tropicais
Desnutrição
Rotavírus
Crianças
Vacinação
Moçambique
Domínio/Área Científica::Ciências Médicas
description Resumo Introdução: Moçambique introduziu a vacina contra rotavírus (Rotarix®) em Setembro de 2015. No entanto, ainda existe escassez de dados sobre a epidemiologia do Rotavírus A (RVA) e ainda não foi determinada a sua efectividade. O principal objectivo desta tese é analisar a frequência do RVA, potenciais factores de risco (sociodemográficos e clínicos) em quatro províncias nos períodos pré (2015) e pós-vacinal (2016-2019) e estimar a efectividade da vacina contra a hospitalização em crianças Moçambicanas. Métodos: Trata-se de uma análise transversal e caso-controlo de base hospitalar da Vigilância Nacional de Diarreias (ViNaDia) e Diarrhoeal Disease Surveillance nas províncias de Maputo, Sofala, Zambézia e Nampula nos anos 2015-2019. As medidas antropométricas foram utilizadas para calcular os índices de peso para idade, peso para altura e altura para idade por meio de Z-Scores. As amostras de fezes foram testadas por ELISA e as positivas foram submetidas a caracterização molecular. As variáveis qualitativas foram descritas através de frequências e para testar associações usou-se o teste qui-quadrado ou Exacto de Fisher. Os modelos de regressão logística múltipla foram usados para estimar os odds-ratios ajustados. A efectividade da vacina (EV) ajustada foi calculada para pelo menos uma dose de vacina versus zero doses usando regressão logística não condicional, onde EV = (1 – aOR) x 100%. Resultados: A frequência da infecção pelo RVA reduziu de 42,7% para 12,2% entre os períodos pré e pós-vacinal em crianças desnutridas. A chance de infecção foi maior em crianças de 0-11 meses (p<0.001), residentes em Maputo (p=0.019) em relação a Sofala e em agregados com ≥5 membros (p=0.029). Adicionalmente, foi observada uma alta proporção de crianças desnutridas HIV-positivas e coinfetadas com RVA (7,4%). A análise da província de Nampula não estratificada pelo estado nutricional verificou uma ligeira redução da frequência de RVA de 34,9% para 21,8% entre os períodos pré e pós-vacinal, a fonte de água para beber esteve associada com a infeção pelo RVA (p< 0.001) no período pré-vacinal enquanto que no pós-vacinal encontram-se associações com a idade (p= 0.028), o ano (p=0.004) e o contato com animais (p=0.048). A frequência foi maior em crianças parcialmente vacinadas (40,7%, 11/27) e os genótipos G1P[8] (29,1%, 16/55) e G9P[4] (18,2%, 10/55) foram os mais comuns em crianças vacinadas. A EV ajustada em crianças de 6 a 11 meses foi de 52,0% (95% CI, -11, 79) e -24,0% (95% CI, -459, 62) entre crianças de 12 a 23 meses. A EV parece ser menor em crianças com desnutrição crónica do que em crianças sem desnutrição crónica (14,0% (95% CI, -138, 66) vs. 59% (95% CI, -125, 91)). Conclusão: A introdução da vacina contribuiu para redução da frequência da infeção por RVA. Foram identificados determinantes importantes para a infeção pelo RVA como: idade das crianças, proveniência, agregados numerosos, água canalizada e contacto com animais. A frequência da infeção foi maior em crianças vacinadas menores de 12 meses vacinadas. A efetividade da vacina foi muito baixa e parece reduzir em crianças com desnutrição crónica e mais velhas. Estes resultados mostram a necessidade da realização de estudos de seguimento para crianças com tripla condição (RVA, desnutrição e HIV) e pesquisas que permitam compreender os fatores relacionados com a infecção em crianças vacinadas e a sua resposta imunológica as vacinas.
publishDate 2023
dc.date.none.fl_str_mv 2023-06
2023-06
2023-06-01T00:00:00Z
2024-05-17T08:07:54Z
dc.type.driver.fl_str_mv doctoral thesis
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10362/167486
TID:101678193
url http://hdl.handle.net/10362/167486
identifier_str_mv TID:101678193
dc.language.iso.fl_str_mv eng
language eng
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
instname:FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia
instacron:RCAAP
instname_str FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
collection Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
repository.name.fl_str_mv Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) - FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia
repository.mail.fl_str_mv info@rcaap.pt
_version_ 1833597021661954048