Detalhes bibliográficos
| Ano de defesa: |
2022 |
| Autor(a) principal: |
Freitas, Gezianne Lopes de |
| Orientador(a): |
Não Informado pela instituição |
| Banca de defesa: |
Não Informado pela instituição |
| Tipo de documento: |
Dissertação
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| Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
| Idioma: |
por |
| Instituição de defesa: |
Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: |
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| Link de acesso: |
https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/47/47132/tde-29032022-110813/
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Resumo: |
O uso de amostragens não invasivas, como as fezes, permitiu que questões que não podem ser respondidas por meio de métodos convencionais fossem abordadas. Após a coleta, a amostra não invasiva precisa ser preservada e, atualmente o número de protocolos para preservar o DNA de amostras não invasivas tem crescido, fazendo com que haja inconsistências quanto aos protocolos utilizados e sua eficiência. Extrair DNA de amostras coletadas de forma não invasiva pode ser desafiador, e, para que estes estudos sejam validados é necessário que esta etapa seja feita de maneira eficiente, uma vez que a extração do material genético com qualidade garante a quantidade e a viabilidade do DNA para que este possa ser amplificado. Nesta revisão, trazemos os principais métodos de preservação e de extração de DNA fecal de primatas não humanos usados nos últimos 10 anos afim de facilitar a escolha dos pesquisadores quanto à eficiência e custo benefício destes métodos para a realização de trabalhos futuros. A pesquisa sistemática foi realizada em quatro banco de dados (PubMed, Web of Science, ScienceDirect e Scopus) usando 4 variações dos termos de pesquisa (Primates AND fecal samples AND dna extraction NOT humans) e recuperando 229 artigos, publicados entre 2011 e 2021. Após a fase da elegibilidade foi realizada a análise pelas autoras através do Rayyan e 46 artigos foram selecionados. Os resultados mostraram que RNAlater foi o método de preservação mais usado por países desenvolvidos. O protocolo que combina um curto período de armazenamento em etanol com subsequente dessecação usando sílica (Nsubuga et al. 2004) com eficiência comprovada e um melhor custo benefício e o etanol (70-100%) foram os métodos mais utilizado pelos demais países. O kit comercial QIAmp Stool Mini Kit (QIAGEN) apresentou melhores resultados para a realização da extração do DNA fecal nos estudos avaliados seguido por outros kits comercias. No entanto, mais estudos precisam ser realizados afim de validar o uso do RNAlater para a preservação de DNA fecal além de estudos comparativos entre os kits comerciais de extração de DNA disponíveis atualmente no mercado para analisar sua viabilidade e custo benefício |
