Análise de vias gênicas reguladas pelo gene HOXB2 em glioblastoma

• Ano de defesa: 2021
• Autor(a) principal: Bonfa, Natália Volgarine Scaraboto
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
• Palavras-chave em Português: ChiP-seq and PCHi-C; Chip-seq e PCHi-C; Fator de transcrição; Gene regulation; Genes HOX; Glioblastoma; HOX genes; Regulação gênica; RNA-seq; Transcription factor
• Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/17/17135/tde-28012022-113542/

Os genes HOX compõem um subgrupo da família Homeobox que são caracterizados pelo alto grau de conservação entre fungos, plantas e animais. Em mamíferos, existem 39 genes HOX distribuídos em quatro grupos ou clusters: HOXA, HOXB, HOXC e HOXD, localizados nos cromossomos 2, 7, 17 e 12, respectivamente. Os genes HOX são fatores de transcrição que atuam durante o desenvolvimento embrionário, regulando processos biológicos fundamentais como: proliferação, diferenciação, migração, angiogênese e apoptose. Vários estudos têm demonstrado também um papel importante dos genes HOX na tumorigênese, envolvendo um perfil de expressão tecido-específico em diferentes tipos tumorais. Análises previamente realizadas mostraram que o gene HOXB2 é up-regulado em glioblastoma (GBM), e que o seu nível de expressão é um fator significativo no tempo de sobrevida dos pacientes. Neste trabalho, nós demonstramos com ensaios in vitro que o gene HOXB2 regula a proliferação celular, senescência e apoptose em linhagens de glioblastoma. Ensaios de NGS elucidaram, ainda, potenciais alvos do gene HOXB2 e indicaram a sua atuação sobre várias vias biológicas importantes no contexto tumoral. Não obstante, foi demonstrada a organização do genoma em linhagem de glioblastoma frente às interações do HOXB2 em promotores e enhancers. Trata-se de um estudo original que traz à luz informações relevantes sobre o papel do gene HOXB2 na regulação da tumorigênese do Glioblastoma.