Análise genômica de Streptomyces olindensis DAUFPE 5622 e de suas vias crípticas para a obtenção de novos metabólicos secundários de interesse biotecnológico.

• Ano de defesa: 2015
• Autor(a) principal: Torres, Maria Alejandra Ferreira
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
• Palavras-chave em Português: Cluster biosintético; Streptomyces; Anotação de genoma; Biosynthetic Cluster; Cosmomicina D; Cosmomycin D; Genome annotation; Genome mining; Overexpression of regulator genes; Super-expressão de genes reguladores
• Link de acesso: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-10052016-090949/

Os compostos de origem microbiana tem readquirido interesse pela biodisponibilidade, especificidade de alvo e diversidade química, mas as vias biosintéticas permanecem crípticas em condições de cultura. Uma estratégia para expressa-las é a super-expressão de genes ativadores. O laboratório de Bio-Produtos no ICB na USP tem trabalhado com Streptomyces olindensis produtor da Cosmomicina D uma molécula com atividade antitumoral de interesse devido ao padrão de glicosilação. O genoma de S. olindensis foi sequenciado e submetido ao NCBI (JJOH00000000) e utilizando o software antiSMASH foram identificados 33 clusters envolvidos na produção de metabolitos secundários. Encontraram-se clusters gênicos para a produção de metabolitos como Melanina, Geosmina, entre outros. Além, foi realizada uma analise de genômica comparativa para caracterizar e anotar as 22 vias biossintéticas desconhecidas em S. olindensis. Finalmente, escolheram-se a via do aminociclitol e um Policetídeo Tipo I para a super-expressão de genes reguladores levando a detecção do composto sob condições de cultura.