Inovações em técnicas de alinhamentos múltiplos e predições de genes

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2012
Autor(a) principal: Onuchic, Vitor Ferreira
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114557/
Resumo: Neste trabalho foram abordados dois problemas: alinhamento de sequências e predição de genes. Estes dois problemas, apesar de serem distintos, tem grande relação entre si. Assim, uma proposta deste trabalho foi uma técnica, baseada em transformações de consistência, que permite a integração entre os modelos pair HMM (utilizado para alinhamento entre pares de sequências) e GHMM (utilizado em predição de genes), de maneira que as predições de genes para um conjunto de sequências genômicas sejam consistentes com o alinhamento entre essas sequências. Além disso, apresentamos dois novos algoritmos relacionados à predição de genes utilizando GHMMs