Identificação de variantes de splicing de ENTPD5 e seus impactos na sobrevida de pacientes com câncer

• Ano de defesa: 2020
• Autor(a) principal: Campos, Rafael Paschoal de
• Orientador(a): Lenz, Guido
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Palavras-chave em Português: Glicosilação de proteínas; Splicing de RNA; Câncer
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/10183/257943

NTPDase5 é uma nucleotidase do retículo endoplasmático que desempenha um importante papel na proteostase como reguladora da N- glicosilação de proteínas e também afeta indiretamente os níveis de ATP intracelular, regulando o metabolismo. Essa enzima foi identificada pela primeira vez em hamster como um proto-oncogene que é ativado após uma deleção pontual que causa uma mudança de fase de leitura e resulta em uma proteína truncada. Proteínas semelhantes em tamanho à NTPDase5 truncada de hamster foram detectadas em amostras humanas através de western blotting usando anti-soro contra o homólogo de hamster, mas um oncogene humano nunca foi descrito. Pesquisando variantes de transcrição no banco de dados GenBank e usando dados do TCGA (The Cancer Genome Atlas), descobrimos que ENTPD5 tem pelo menos 13 variantes de splicing. Foi predito que duas delas geram proteínas truncadas que são semelhantes em tamanho à oncoproteína de hamster. Identificamos três eventos de splicing principais no gene ENTPD5: aceptores alternativos para o éxon 6, salto de éxon e terminadores alternativos. Além disso, também investigamos o impacto dos eventos de splicing em cânceres humanos e descobrimos que o salto do éxon 11 - o evento que leva a proteínas truncadas de tamanho semelhante ao do oncogene do hamster - não afeta a taxa de risco da maioria dos tumores e foi, na verdade, um fator de proteção nos únicos dois estudos nos quais foi significativo. Detectamos que dois principais terminadores alternativos são responsáveis pela maioria dos transcritos em cânceres humanos e que, enquanto um deles contém um importante domínio funcional conservado, a sequência do outro possui um alvo potencial para regulação negativa por miR-215. Também conseguimos identificar quatro padrões principais de impacto do ENTPD5 na sobrevida de pacientes com câncer. Nossos resultados lançam luz sobre uma incerteza de duas décadas sobre a origem das proteínas NTPDase5 truncadas e contribuem na caracterização dos impactos da NTPDase5 em cânceres humanos.