Detecção do rice stripe necrosis virus por rt-pcr em tempo real e avaliação de resistência em genótipos de arroz (oryza sativa l.)

• Ano de defesa: 2023
• Autor(a) principal: Moz, Brenda
• Orientador(a): Bertolini, Edson
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Palavras-chave em Português: Arroz; Orizicultura; Doença de planta; Método de análise
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/10183/278861

O arroz (Oryza sativa L.) é um dos cereais mais produzidos no mundo. Cultivado em todos os continentes, desempenha papel significativo na nutrição e na segurança alimentar da população. O Brasil está entre os dez maiores produtores mundiais do grão, sendo o primeiro fora do continente Asiático. A ocorrência de doenças limita a produtividade e a qualidade das sementes e grãos da cultura. No Rio Grande do Sul, estado com maior área semeada de arroz, diversas doenças apresentam importância econômica. O enrolamento foliar é uma doença emergente no cultivo do arroz, causado pelo rice stripe necrosis virus (RSNV). O vírus é transmitido exclusivamente pelo plasmodioforomiceto Polymyxa graminis, habitante do solo, onde suas estruturas de resistência podem permanecer por décadas. Seus sintomas são facilmente confundidos com fitotoxidez por herbicidas, dificultando a correta diagnose e as recomendações de medidas de manejo e controle. A prevenção é a medida de controle ideal para doenças causadas por vírus e, atualmente, não se conhecem genótipos resistentes ou tolerantes a virose e nem ferramentas de detecção precoces, confiáveis e sensíveis. Dessa forma, o objetivo do trabalho foi desenvolver um protocolo molecular de RT-PCR em tempo real associado a métodos diretos de preparação de amostras para detectar o vírus, além da identificação de genótipos resistentes ou tolerantes ao vírus. Foram desenhados iniciadores, sonda TaqMan e desenvolvido um protocolo de detecção do RSNV utilizando métodos diretos de preparação de amostras. As análises in silico e in vitro demonstraram a especificidade e correto funcionamento dos iniciadores e da sonda, obtendo amplificação em amostras vegetais naturalmente infectadas e de solo com a presença do vetor. Foram observadas diferenças na resistência ou tolerância ao RSNV entre as cultivares e híbrido testados. . Nas cultivares IRGA 424 RI e BRS Pampa CL não foram observados sintomas e nem foi detectada a presença do vírus. As cultivares SCS 121 CL e SCS 122 Miura apresentaram maior carga viral. Os trabalhos desenvolvidos foram de fundamental importância para traçar as melhores estratégias de manejo e controle, implicando em redução do uso de insumos de forma inadequada, protegendo o ecossistema e minimizando os custos de produção.