Evolutionary forces shaping genomes : from whales to viruses

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Mora, Yuri Belisario Yépez
Orientador(a): Bortolini, Maria Cátira
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: eng
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Palavras-chave em Inglês:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/10183/276156
Resumo: Neste trabalho de tese, integramos investigações sobre as adaptações evolutivas de mamíferos aquáticos à hipóxia e a dinâmica evolutiva do SARS-CoV-2, enfatizando a natureza dinâmica da exploração científica em meio a desafios globais urgentes. Apesar da importância estabelecida de HIF1α e genes associados no mecanismo molecular de resposta à hipóxia, seu papel na adaptação evolutiva de mamíferos aquáticos permanece incompletamente compreendido. Nossa abordagem de genes candidatos analisou 11 genes críticos na via de sinalização de HIF1α em mamíferos aquáticos, revelando evidências de seleção negativa e regimes seletivos relaxados em cetáceos, juntamente com a identificação de uma variante única de glutamina 68 na proteína HIF3α exclusiva de cetáceos. Concomitantemente, investigamos a história evolutiva da cepa Gamma e suas linhagens derivadas (P.1.1 e P.1.2) de SARS-CoV-2, detectando 194 locais sob seleção positiva em 12 genes/ORFs. Notavelmente, alguns locais diagnósticos para Gamma careciam de uma assinatura de seleção positiva, sugerindo evasão da seleção purificadora, enquanto análises de redes revelaram haplótipos em expansão únicos para P.1.1 e P.1.2, incluindo o surgimento de novidades adaptativas como o alelo 3509Y em ORF1a. Discutimos como fenômenos como epistasia e pleiotropia antagônica podem limitar o surgimento de novos alelos em linhagens de SARS-CoV-2, mantendo a infectividade em humanos e fornecendo capacidades de resposta rápida contra as respostas imunes do hospedeiro. Esta abordagem interdisciplinar destaca a interconexão de estudos evolutivos em diversos contextos biológicos e destaca a importância da investigação científica dinâmica no enfrentamento dos desafios globais contemporâneos.