Avaliação da biodiversidade da ictiofauna em ecossistemas estuarinos do litoral de São Paulo utilizando DNA ambiental e RNA ambiental metabarcoding como biomarcadores

• Ano de defesa: 2024
• Autor(a) principal: Nitzsche, Natascha Mozaner [UNESP]
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
• Palavras-chave em Português: eDNA; eRNA; Conservação
• Link de acesso: https://hdl.handle.net/11449/259870

A avaliação da distribuição e abundância das espécies é imprescindível para estudos sobre a biodiversidade e para o desenvolvimento de políticas voltadas para sua conservação, especialmente em ambientes vulneráveis como os estuários. Nesse contexto, o DNA ambiental (eDNA) e o RNA ambiental (eRNA) metabarcoding surgem como técnicas não-invasivas para o levantamento de espécies, a partir de ácidos nucleicos isolados de amostras ambientais. O presente trabalho se propõe a avaliar a aplicabilidade de eDNA e eRNA em estudos metabarcoding para o levantamento de espécies de peixes em duas regiões de estuário do litoral norte paulista, do rio Escuro (Ubatuba) e do rio Juqueriquerê (Caraguatatuba). Coletamos amostras de água a partir de um gradiente de salinidade em três porções de cada estuário nos meses de agosto de 2023 (inverno) e fevereiro de 2024 (verão), filtrando parte do conteúdo para eRNA e parte para eDNA. Para obtenção dos ácidos nucleicos, DNA e RNA, todo o material passou por etapas de extração de material genético, purificação, amplificação do gene de rRNA 12S e posteriormente encaminhados para sequenciamento Illumina. Obtivemos sucesso de sequenciamento de 18 amostras, sendo 10 do rio Juqueriquerê (eDNA) e 8 do rio Escuro (eDNA e eRNA), com a identificação total de 93 espécies considerando ambos os rios, incluindo peixes, mamíferos, anfíbios e aves. A partir dos principais parâmetros de diversidade avaliados, o rio Escuro apresentou uma maior abundância de espécies quando comparado ao rio Juqueriquerê, com informações principalmente fornecidas pelos dados de eDNA. No rio Juqueriquerê também houve a identificação de espécies invasoras como a tilápia-do-nilo e o bagre-africano. A partir de nossas análises, constatamos que o eRNA e o eDNA tem potencial de serem amplamente utilizados como ferramentas para o monitoramento de fauna, e o uso combinado de métodos, incluindo os tradicionais, diminui as limitações de cada técnica e representam de forma acurada a composição de espécies, principalmente com eRNA e sua detecção de organismos ativos, representando um retrato fiel da fauna viva em determinado espaço-tempo.