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Detecção de variantes germinativas no plasma de cadelas com neoplasias mamárias por sequenciamento de nova geração

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2020
Autor(a) principal: Oliveira, Jéssica Rodrigues de
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/204621
Resumo: O câncer de mama é uma das neoplasias malignas mais incidentes em mulheres e cadelas. Em mulheres, sabe-se que mutações patogênicas herdadas nos genes de alta penetrância podem estar associadas ao risco elevado da doença, à resistência a terapias e ao prognóstico reservado ou ruim. Em cadelas, existem muitos dados divergentes sobre o envolvimento dos genes de alta penetrância (BRCA1 e BRCA2) com a carcinogênese mamária e sobre a verdadeira patogenicidade das variantes detectadas. Dessa forma, o objetivo principal deste estudo foi detectar variantes germinativas nos genes de alta e moderada penetrância associados ao câncer de mama em mulheres no plasma de cadelas por meio do sequenciamento de nova geração (NGS). Para tanto, foram coletadas vinte amostras de sangue provenientes de dez cadelas recém diagnosticadas com neoplasias de glândula mamária (RD), cinco cadelas mastectomizadas (MAST) e cinco cadelas sem neoplasia (CTR). Posteriormente, foram realizadas as etapas de extração do DNA livre circulante (plasmático), construção da biblioteca utilizando um painel de genes específicos associados ao câncer de mama em mulheres, incluindo os genes BRCA1, BRCA2, CDH1, STK11, TP53, PALB2 e ATM, e, por fim, análise bioinformática para detecção de variantes: polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs), deleções e inserções (indels). Foram detectadas 218 variantes no total, sendo 32,56% (n=71) em regiões codificantes e 13,76% (n=30) classificadas como de moderado impacto, a maioria do tipo missense. Dentre os genes de alta penetrância, o gene BRCA2 foi o que mais apresentou variantes, sendo identificados onze SNPs e dois indels, dessas, destacaram-se p.Thr1425Pro e p.Leu2307del, que foram classificadas como possivelmente patogênicas pelos programas de predição in silico. Em relação aos genes de moderada penetrância, foi identificado um quantitativo menor de variantes, quando comparados aos genes de alta penetrância e, dentre os genes avaliados, o PALB2 merece evidência, pois foram detectadas duas novas variantes possivelmente patogênicas: p.Ala949Val e p.Pro590_Val595delinsLeu. Assim, o sequenciamento de nova geração permitiu identificar grande quantidade de variantes, ainda de significado incerto, nos genes de predisposição ao câncer de mama, e essa condição parece ser semelhante em mulheres. São necessários estudos adicionais para validar as variantes identificadas em cadelas com câncer de mama para que, futuramente, seja possível proporcionar tratamento personalizado às pacientes.