Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: |
2021 |
Autor(a) principal: |
Santos, Ingrid Nayara Marcelino [UNIFESP] |
Orientador(a): |
Não Informado pela instituição |
Banca de defesa: |
Não Informado pela instituição |
Tipo de documento: |
Dissertação
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Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
Idioma: |
por |
Instituição de defesa: |
Universidade Federal de São Paulo
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Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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Departamento: |
Não Informado pela instituição
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País: |
Não Informado pela instituição
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Palavras-chave em Português: |
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Link de acesso: |
https://repositorio.unifesp.br/handle/11600/65834
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Resumo: |
As infecções associadas a dispositivos ortopédicos (ODRIs) são causadas principalmente por Staphylococcus spp. formadores de biofilme, incluindo Staphylococcus aureus e Staphylococcus coagulase negativo (CoNS). Nosso objetivo foi caracterizar a capacidade de formação de biofilme, virulência e o perfil de sensibilidade em isolados de Staphylococcus spp recuperados de fluido de sonicação de ODRIs, por métodos fenotípicos e moleculares. Foram coletados e analisados dados clínicos e microbiológicos de 32 pacientes, com ODRIs, entre os quais os implantes foram retirados e submetidos a sonicação. Os micro-organismos foram identificados pela técnica de dessorção em vôo de espectrometria de massa por ionização a laser assistida por matriz (MALDI-TOF MS). O teste de susceptibilidade antimicrobiana foi realizado por disco difusão e a técnica de microdiluição em caldo foram utilizadas para avaliar a concentração inibitória mínima (CIM) para a vancomicina. Os resultados foram interpretados de acordo com o European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) e Brazilian Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (BrCAST) (2020). A detecção do gene, mecA e icaAB foi realizada por reação em cadeia da polimerase (PCR). Foi realizado o ensao qualitativo para avaliação da produção de biofilme em superfícies abióticas. No estudo realizada comparações de resultados utilizado o cálculo estatístico para o coeficiente de Kappa. O sequenciamento do genoma completo (SGC) foi feito usando a plataforma Illumina MiSeq. No geral, 32 Staphylococcus spp. foram isolados, S. aureus em 50% (16/32), S. epidermidis em 25% (8/32) e S. haemolyticus em 16% (6/32). Todos os isolados de S. aureus foram resistentes a meticilina e mecA positivos. Entre os SCoN a resistência foi observada foi de 56,2%. Na avaliação qualitativa da capacidade de formação de biofilme dos isolados em superfícies abióticas, 75% (N = 24/32) dos isolados foram fortes produtores de biofilme. A concordância entre detecção do gene icaAB e formação de biofilme pelo coeficiente de Kappa foi fraca. A análise de sequenciamento mostrou que entre 3 cepas de S. aureus, duas eram ST 5 e uma ST105. Os Sccmec encontrados foram tipo I, II e V. Os três isolados pertenciam ao CC5. Os genes de resistência e virulência de S. aureus foram detectados incluindo múltiplos genes codificadores de AMEs, mecA, blaZ, fnbA, sdrC, sdrD, sdrE, ebp. Entre os SCoN, notou-se uma grande variabilidade quando a presença de genes de que expressam aderência (MSCRAMMs), sendo os genes mais frequentemente identificados foram, atl, ebp e ebh A realização do SGC nestes isolados forneceu informações importantes e mais completas com relação a presença de múltiplos genes de resistência e de virulência, incluindo os genes associados a formação de biofilme. Este estudo oferece ferramentas para a melhor compreensão dos mecanismos envolvidos na patogênese destas infecções. |