Predição de doença do enxerto contra hospedeiro aguda baseada no perfil de expressão gênica. Estudo prospectivo

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2009
Autor(a) principal: Arantes, Adriano de Moraes [UNIFESP]
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/39361
Resumo: Introdução: Transplante alogênico de células tronco hematopoéticas (TCTH) é uma importante terapia para doenças hematológicas, mas o sucesso de uma porção de transplantes é limitado pela doença do enxerto versus hospedeiro(GVHD). Os fatores de risco conhecidos para GVHD agudo (aGVHD) não fornecem uma estimativa precisa do risco individual e não auxiliam na individualização da terapia. Até o momento, não existe método diagnóstico que permita predizer aGVHD. A identificação de pacientes que desenvolverão aGVHD poderia permitir a individualização da terapia para uns e evitaria imunossupressão intensa para outros. Objetivos: Revelar um classificador molecular preditivo de aGVHD. Descobrir genes diferencialmente expressos e analisar eventos precoces que desencadeiam aGVHD. Explorar categorias funcionais e tipos celulares relacionados ao desenvolvimento de aGVHD. Casuística e métodos: Foram isolados, amplificados, marcados e co-hidridados com lâminas de microarray contendo 22.000 sondas, amostras de RNA mensageiro de 89 pacientes submetidos a TCTH HLA-idêntico mieloablativo ou de toxicidade reduzida, obtido de células mononucleares periféricas durante a enxertia medular. Os pacientes foram divididos em grupo treino e grupo teste, um modo utilizado para construir um modelo que discrimine pacientes com e sem aGVHD, e para testar o modelo em amostras independentes. Os genes informativos foram selecionados utilizando recursive feature elimination, seguido de sete diferentes algoritmos de classificação multivariados para estabelecer o classificador molecular no grupo treino. Os genes diferencialmente expressos entre amostras de pacientes com e sem GVHD foram submetidos a análise de enriquecimento das vias funcionais e agrupados de acordo com o perfil de expressão com células e tecidos através do SymAtlas. Resultados: Encontramos um classificador molecular composto de 233 genes nas amostras do grupo treino, que foram selecionados baseados na mais precisa classificação. No grupo teste da amostra, cerca de 80% dos pacientes puderam ser classificados. Para estes pacientes, o classificador mostrou uma acurácia preditiva de 75% (sensibilidade de 71% e especificidade de 78%). Analisando a anotação funcional dos genes diferencialmente expressos, observamos que em pacientes que desenvolveram aGVHD, houve aumento de expressao de genes da resposta antimicrobiana, transporte de gases, metabolismo de hemoglobina, além das alarminas. Nestas amostras também observamos a diminuição da expressão da IL1 e outros genes envolvidos na via do NF-kB. Vários genes super-expressos no periodo precoce do aGVHD foram associados a células precursoras. Conclusões: Nossos resultados mostram que um classificador molecular é capaz de identificar pacientes sob alto risco de desenvolver aGVHD. Estabelecer métodos de diagnóstico preditivo para aGVHD é o primeiro passo para a individualização da estratégia terapêutica após TCTH. Além disso, os resultados da análise de enriquecimento funcional e a expressão de genes em diferentes populações celulares, sugerem que eventos precoces envolvendo múltiplas populações de células precursoras possam predefinir a interação futura entre o enxerto em desenvolvimento e o paciente.