Remontagem de Genomas: uma Avaliação das Técnicas de novo e por Comparação

• Ano de defesa: 2012
• Autor(a) principal: Sousa Júnior, Sérgio Ronaldo Alves de
• Orientador(a): Cheung, Luciana Montera
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Palavras-chave em Português: Genoma - processamento de dados; Genomes - data processing; Sequenciamento de Nucleotídeo; Nucleotide Sequence; Código Genético; Genetic Code; Bioinformática; Bioinformatics; Biologia Molecular - processamento de dados; Molecular Biology - data processing
• Link de acesso: https://repositorio.ufms.br/handle/123456789/1660

As técnicas de sequenciamento de nova geração são alternativas ao método Sanger de sequenciamento. Essas técnicas produzem um grande volume de reads por ciclo de execução. Muitas vezes, esses reads precisam ser remontados seguindo alguma técnica de remontagem a m de se obter um genoma completo. Abordamos neste trabalho as técnicas de remontagem de novo e remontagem por comparação, avaliando os resultados produzidos por ambas. Como a anotação de um genoma e um processo que depende da remontagem do genoma, deve ser criteriosa a escolha de uma ferramenta para tal m.