Detalhes bibliográficos
| Ano de defesa: |
2016 |
| Autor(a) principal: |
Lima, Rodolpho Gheleri de Oliveira |
| Orientador(a): |
Almeida Jr, Nalvo Franco de |
| Banca de defesa: |
Não Informado pela instituição |
| Tipo de documento: |
Dissertação
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| Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
| Idioma: |
por |
| Instituição de defesa: |
Não Informado pela instituição
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: |
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| Link de acesso: |
https://repositorio.ufms.br/handle/123456789/2969
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Resumo: |
Este trabalho descreve o desenvolvimento de duas ferramentas computacionais: um pipeline para analise de expressao diferencial de genes e outra para a visualizaçao grafica de resultados de expressao diferencial, chamada DEPICTViz, que agrega ao resultado da analise de expressao diferencial informações de interaçao funcional de proteinas. O pipeline desenvolvido realiza o mapeamento de reads no genoma de referencia, a ordenação dos reads mapeados, a construção e uniao de transcritos e a analise de expressao diferencial. A ferramenta DEPICTViz foi desenvolvida para a visualização de experimentos de expressao diferencial de genes e interação de proteinas. DEPICTViz foi testada com sucesso em varios estudos de caso. |
