Estudos genômico-moleculares para características morfométricas e de variabilidade gênica em equinos

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2022
Autor(a) principal: Bastos, Marisa Silva lattes
Orientador(a): Costa, Raphael Bermal
Banca de defesa: Costa, Raphael Bermal, Fonseca, Larissa Fernanda Simielli, Silva, Josineudson Augusto de Vasconcelos, Souza, Fábio Ricardo Pablos de, Santana, Annaiza Braga Bignardi
Tipo de documento: Tese
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Universidade Federal da Bahia
Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Zootecnia (PPGZOO)
Departamento: Escola de Medicina Veterinária e Zootecnia
País: Brasil
Palavras-chave em Português:
PCR
Área do conhecimento CNPq:
Link de acesso: https://repositorio.ufba.br/handle/ri/40592
Resumo: A baixa variabilidade genética pode prejudicar diversos aspectos produtivos e reprodutivos em equídeos. Processos de recombinação gênica, como o crossing-over, podem aumentar a variabilidade genética ao promover trocas ente partes dos cromossomos homólogos durante a meiose. Entre as proteínas envolvidas no crossing- over destacamos o papel da PRDM9 que determina os pontos de quebra da sequência de DNA (hotspots) através de uma estrutura chave denominada domínio de dedos de zinco, do inglês zinc fingers (ZF). Modificações nas sequências desses domínios ZF promovem formação de diferentes hotspot de recombinação ao longo do DNA. Assim, esse estudo teve como objetivo descrever a diversidade de arranjos de domínios de zinco e distribuição de alelos do gene PRDM9 em 26 raças de equinos. Para obtenção do DNA foram utilizadas amostras de pelos de 95 animais. A amplificação do gene de interesse foi realizada utilizando primers específicos e os produtos da amplificação foram qualificados, quantificados e então sequenciados. Para a análise e identificação dos polimorfismos, as sequências obtidas foram visualizadas com os programas CodonCode Aligner. Foram encontrados 14 novos domínios ZF, 19 alelos e 19 genótipos. O alelo 1 assim como o seu genótipo homozigoto (1|1) apresentaram maiores frequências (0,889 e 0,775, respectivamente). Os resultados permitem a condução de manejo reprodutivo de animais cujo genótipo do PRDM9 seja menos frequente em populações com pouca variabilidade genética. Promovem-se novas recombinações e auxilia-se no aumento de sua variabilidade. Adiciona-se a isso o fato de o gene ter papel importante no processo evolutivo, podendo essas informações contribuírem para o melhor entendimento desse mecanismo.