Inferência funcional de genes hipotéticos da ilha simbiótica da estirpe CPAC 15 de Bradyrhizobium japonicum

Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: 2024
Autor(a) principal: Ferreira, Everton Geraldo Capote
Orientador(a): Não Informado pela instituição
Banca de defesa: Não Informado pela instituição
Tipo de documento: Dissertação
Tipo de acesso: Acesso aberto
Idioma: por
Instituição de defesa: Não Informado pela instituição
Programa de Pós-Graduação: Não Informado pela instituição
Departamento: Não Informado pela instituição
País: Não Informado pela instituição
Palavras-chave em Português:
Link de acesso: https://repositorio.uel.br/handle/123456789/11401
Resumo: Resumo: A fixação biológica do nitrogênio (FBN) na soja (Glycine max (L) Merr) ocorre através da simbiose com bactérias (rizóbios), como a espécie Bradyrhizobium japonicum, seu principal simbionte Recentemente após o sequenciamento do genoma da estirpe CPAC 15 de Bradyrhizobium japonicum, utilizada como inoculante comercial em soja, observou-se a presença de aproximadamente 5% de genes codificando para proteínas hipotéticas Neste contexto, o estudo teve como objetivo a análise da expressão de genes localizados dentro da ilha simbiótica e que codificam para proteínas hipotéticas e que possam estar relacionadas à FBN e a atividade saprofítica A inferência funcional foi realizada com base em busca de similaridades com diversos bancos de dados e programas de predições de estruturas como peptídeos sinais, localização celular, domínios conservados, entre outros A avaliação da expressão gênica foi realizada através de RT-qPCR com indução com genisteína em meio de cultivo com a bactéria, por aproximadamente, 48 horas As análises de similaridade com o banco de dados RefSeq demonstrou que todas as proteínas hipotéticas estavam distribuídas em vários genomas de diferentes espécies do gênero Bradyrhizobium Os resultados obtidos por RT-qPCR demonstraram que todos os genes hipotéticos selecionados obtiveram elevados níveis de expressão em presença de genisteína em relação ao controle, o metanol A maioria dos genes codificando para proteínas hipotéticas inferidos funcionalmente estava relacionada ao transporte de substâncias, vias metabólicas de aminoácidos e degradação de compostos, e possivelmente então, podendo ser úteis na atividade saprofítica da estirpe e na FBN em si