[en] COMPUTATIONAL STUDIES OF THE INTERACTION OF PORPHYRINS AND THEIR IRON COMPLEXES WITH HUMAN SERUM ALBUMIN

• Ano de defesa: 2008
• Autor(a) principal: TEOBALDO RICARDO CUYA GUIZADO
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: MAXWELL
• Palavras-chave em Português: [pt] HIDROFOBICIDADE; [pt] SOLVATACAO; [pt] DINAMICA MOLECULAR; [pt] PROTOPORFIRINA IX; [pt] HEME; [pt] BIOFISICA; [en] HYDROPHOBICITY; [en] SOLVATION; [en] MOLECULAR DYNAMICS; [en] PROTOPORPHYRIN IX; [en] HEME; [en] BIOPHYSICS
• Link de acesso: https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=12201&idi=1; https://www.maxwell.vrac.puc-rio.br/colecao.php?strSecao=resultado&nrSeq=12201&idi=2; http://doi.org/10.17771/PUCRio.acad.12201

[pt] A aparição do HIV na década de 80 e de outros vírus presentes no sangue dos doadores, assim como a expansão de doenças como a hepatite C, tem estimulado as pesquisas para desenvolver substitutos do sangue. Pesquisas recentes têm sido realizadas em derivados artificiais da albumina de soro humano (human serum albumin - HSA) associados com heme, representando uma linha promissora nesse sentido. No presente trabalho, fazemos um estudo computacional da ligação do heme e de seu precursor, a protoporfirina IX, com a HSA, com o objetivo de conhecer os aminoácidos que contribuem à estabilidade da ligação, a natureza do sítio de ligação, a formação de possíveis sítios secundários de ligação e a influência das porfirinas na estrutura global da proteína. Para conseguir este objetivo ut ilizamos técnicas de cálculo quântico usando a Teoria do Funcional de Densidade, Docking Molecular e Dinâmica Molecular. Finalmente fazemos um estudo da correlação existente entre as diferentes regiões da HSA e de como este padrão muda na presença das porfirinas. Para este propósito usamos os coeficientes de correlação generalizada baseados na formulação de Kraskov. Com base nestas informações, discutimos a contribuição que poderiam fornecer nossos cálculos para a reengenharia do HSA, no sentido de fornecer- lhe características de hemoproteínas.