Análise dos genes HPGD e SLCO2A1 em pacientes com Paquidermoperiostose
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Publication Date: | 2024 |
Format: | Master thesis |
Language: | por |
Source: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
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Summary: | Introdução: A Osteoartropatia hipertrófica primária (PHO) ou Paquidermoperiostose (PDP) é uma doença genética rara que afeta ossos e pele. Casos com variantes alélicas patogênicas (VAP) germinativas nos genes SLCO2A1 e HPGD apresentam padrão de herança autossômica recessiva enquanto que a etiologia da forma de herança autossômica dominante foi, muito recentemente, associada com VAP germinativas, em heterozigose, no gene SLCO2A1. A penetrância da PHO em indivíduos heterozigotos para este gene é desconhecida uma vez que a avaliação clínica destes casos é, ainda, muito limitada. Casos autóctones do Brasil com PHO foram raramente reportados na literatura contrastando com inúmeros relatos e séries de pacientes reportados em outros continentes, principalmente da Ásia. Nenhuma avaliação dos genes HPGD (2008) e SLCO2A1 (2012) foi conduzida em casos com PHO no Brasil desde a associação deles com a doença. Objetivos: a. Descrever o fenótipo e investigar VAP germinativas nos genes HPGD e SLCO2A1 de quatro pacientes não relacionados com diagnóstico de PHO; b. promover o rastreamento e aconselhamento genético de familiares sob risco; c. expandir informações sobre o fenótipo e a penetrância de PHO em portadores de VAP em heterozigose. Métodos: Sequenciamento Sanger das regiões codificadoras e fronteiras íntron-éxon dos genes HPGD e SLCO2A1. Resultados: Os quatro pacientes não relacionados apresentavam a forma clínica completa de PHO pela presença combinada de paquidermia, com cutis verticis girata (CVG), periostose pronunciada de ossos longos e baqueteamento digital. A idade média de aparecimento dos primeiros sintomas, ao diagnóstico clínico e genético foram, respectivamente 18,5 ± 2,7 anos (16-22), 22 ± 3,4 anos (18-26) e 47,5 ± 7,8 anos (38-57). O tempo médio decorrido entre os primeiros sintomas até o diagnóstico clínico foi de 3,5 ± 1,7y (1-5). Três casos-índices eram membros de famílias brasileiras, sendo duas delas do interior do Estado de Minas Gerais e outra da fronteira entre este Estado e o de São Paulo enquanto o quarto paciente era um imigrante palestino. História de consanguinidade da geração parental foi evidente em dois casos e, aparentemente negativa, em um dos casos do Estado de Minas Gerais e no palestino, regiões/populações historicamente associadas com prevalência aumentada de consanguinidade. Em geral, todos pacientes foram submetidos a pelo menos um procedimento cirúrgico pela PHO. VAPs diferentes, em homozigose, foram identificadas no gene SLCO2A1: caso 1 (c.563 A>G; p.Q188R; éxon 4); caso 2 (c.1259G>T, p.C420F; rs 387907295; éxon 9); caso 3 (c.526G>A; p.A176T; éxon 4) e caso 4 (c.310G>T; p.G104*; éxon 3). As VAPs encontradas nos casos 1 e 3 são novas, a do caso 2 foi previamente descrita, em homozigose, em caso com PHO enquanto a variante nonsense somente havia sido relatada em 5 indivíduos, todos em heterozigose, a partir de bancos genômicos populacionais. Avaliação clínica e/ou radiológica foi conduzida em 14 familiares heterozigotos das 3 famílias brasileiras e fenótipo brando com paquidermia e periostose leve foi documentada na mãe do caso 2 (86 anos) e no pai (73 anos) do caso 3 enquanto hipocratismo digital leve foi identificado em três membros da geração parental nas idades de 72, 73 e 81 anos. Conclusão: Duas novas variantes patogênicas e outra, pela primeira vez, em homozigose, foram associadas ao fenótipo de PHO, ampliando o registro de VAP no gene SLCO2A1. Um padrão de herança autossômica recessiva foi definido para os quatro casos-índices com forma completa de PHO. A análise expandida do fenótipo de familiares heterozigotos para VAP no gene SLCO2A1 resultou na identificação de forma frusta e indolente de PHO em quatro idosos. Nossos achados, em associação com evidências recentes revisitadas, ressaltam a existência de um mecanismo adicional de herança autossômica dominante associado ao gene SLCO2A1, que resultam em penetrância global baixa e, aparentemente, crescente com a idade, além de heterogeneidade clínica, com predominância de fenótipos mais brandos do que vistos em pacientes portadores de VAP em homozigose ou em heterozigose composta. Estudos com casuísticas maiores poderão ampliar o conhecimento sobre a penetrância e o fenótipo de casos heterozigotos para VAP no gene SLCO2A1 |
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Análise dos genes HPGD e SLCO2A1 em pacientes com PaquidermoperiostoseAnalysis of HPGD and SLCO2A1 genes in patients with pachydermoperiostosisCutis verticis girataCutis verticis gyrataDiagnóstico molecularGene SLCO2A1Molecular diagnosisOsteoartropatia hipertrófica primáriaPachydermoperiostosisPaquidermoperiostosePrimary hypertrophicSequenciamento genéticoSequencingIntrodução: A Osteoartropatia hipertrófica primária (PHO) ou Paquidermoperiostose (PDP) é uma doença genética rara que afeta ossos e pele. Casos com variantes alélicas patogênicas (VAP) germinativas nos genes SLCO2A1 e HPGD apresentam padrão de herança autossômica recessiva enquanto que a etiologia da forma de herança autossômica dominante foi, muito recentemente, associada com VAP germinativas, em heterozigose, no gene SLCO2A1. A penetrância da PHO em indivíduos heterozigotos para este gene é desconhecida uma vez que a avaliação clínica destes casos é, ainda, muito limitada. Casos autóctones do Brasil com PHO foram raramente reportados na literatura contrastando com inúmeros relatos e séries de pacientes reportados em outros continentes, principalmente da Ásia. Nenhuma avaliação dos genes HPGD (2008) e SLCO2A1 (2012) foi conduzida em casos com PHO no Brasil desde a associação deles com a doença. Objetivos: a. Descrever o fenótipo e investigar VAP germinativas nos genes HPGD e SLCO2A1 de quatro pacientes não relacionados com diagnóstico de PHO; b. promover o rastreamento e aconselhamento genético de familiares sob risco; c. expandir informações sobre o fenótipo e a penetrância de PHO em portadores de VAP em heterozigose. Métodos: Sequenciamento Sanger das regiões codificadoras e fronteiras íntron-éxon dos genes HPGD e SLCO2A1. Resultados: Os quatro pacientes não relacionados apresentavam a forma clínica completa de PHO pela presença combinada de paquidermia, com cutis verticis girata (CVG), periostose pronunciada de ossos longos e baqueteamento digital. A idade média de aparecimento dos primeiros sintomas, ao diagnóstico clínico e genético foram, respectivamente 18,5 ± 2,7 anos (16-22), 22 ± 3,4 anos (18-26) e 47,5 ± 7,8 anos (38-57). O tempo médio decorrido entre os primeiros sintomas até o diagnóstico clínico foi de 3,5 ± 1,7y (1-5). Três casos-índices eram membros de famílias brasileiras, sendo duas delas do interior do Estado de Minas Gerais e outra da fronteira entre este Estado e o de São Paulo enquanto o quarto paciente era um imigrante palestino. História de consanguinidade da geração parental foi evidente em dois casos e, aparentemente negativa, em um dos casos do Estado de Minas Gerais e no palestino, regiões/populações historicamente associadas com prevalência aumentada de consanguinidade. Em geral, todos pacientes foram submetidos a pelo menos um procedimento cirúrgico pela PHO. VAPs diferentes, em homozigose, foram identificadas no gene SLCO2A1: caso 1 (c.563 A>G; p.Q188R; éxon 4); caso 2 (c.1259G>T, p.C420F; rs 387907295; éxon 9); caso 3 (c.526G>A; p.A176T; éxon 4) e caso 4 (c.310G>T; p.G104*; éxon 3). As VAPs encontradas nos casos 1 e 3 são novas, a do caso 2 foi previamente descrita, em homozigose, em caso com PHO enquanto a variante nonsense somente havia sido relatada em 5 indivíduos, todos em heterozigose, a partir de bancos genômicos populacionais. Avaliação clínica e/ou radiológica foi conduzida em 14 familiares heterozigotos das 3 famílias brasileiras e fenótipo brando com paquidermia e periostose leve foi documentada na mãe do caso 2 (86 anos) e no pai (73 anos) do caso 3 enquanto hipocratismo digital leve foi identificado em três membros da geração parental nas idades de 72, 73 e 81 anos. Conclusão: Duas novas variantes patogênicas e outra, pela primeira vez, em homozigose, foram associadas ao fenótipo de PHO, ampliando o registro de VAP no gene SLCO2A1. Um padrão de herança autossômica recessiva foi definido para os quatro casos-índices com forma completa de PHO. A análise expandida do fenótipo de familiares heterozigotos para VAP no gene SLCO2A1 resultou na identificação de forma frusta e indolente de PHO em quatro idosos. Nossos achados, em associação com evidências recentes revisitadas, ressaltam a existência de um mecanismo adicional de herança autossômica dominante associado ao gene SLCO2A1, que resultam em penetrância global baixa e, aparentemente, crescente com a idade, além de heterogeneidade clínica, com predominância de fenótipos mais brandos do que vistos em pacientes portadores de VAP em homozigose ou em heterozigose composta. Estudos com casuísticas maiores poderão ampliar o conhecimento sobre a penetrância e o fenótipo de casos heterozigotos para VAP no gene SLCO2A1Introduction: Primary hypertrophic osteoarthropathy (PHO) or Pachydermoperiostosis (PDP) is a rare genetic disease affecting bones and skin. Cases with pathogenic allelic variants (PAV) in the germline of the SLCO2A1 and HPGD genes exhibit an autosomal recessive inheritance pattern, whereas the etiology of the autosomal dominant inheritance form was recently associated with germline PAV, in heterozygosity, in the SLCO2A1 gene. The penetrance of PHO in individuals heterozygous for this gene is unknown since clinical evaluation of these cases is still very limited. Brazilian cases with PHO have been rarely reported in contrast to numerous reports and patient series reported on other continents, mainly in Asia. No evaluation of the HPGD (2008) and SLCO2A1 (2012) genes has been conducted in PHO cases in Brazil since their association with the disease. Objectives: a. To describe the phenotype and investigate germline PAV in the HPGD and SLCO2A1 genes of four unrelated patients diagnosed with PHO; b. to promote screening and genetic counseling of relatives at risk; c. to expand information on the phenotype and penetrance of PHO in carriers of heterozygous PAV. Methods: Sanger sequencing of the coding regions and intron-exon boundaries of the HPGD and SLCO2A1 genes. Results: The four unrelated patients presented with the complete clinical form of PHO due to the combined presence of pachydermia, with cutis verticis gyrata (CVG), pronounced periostosis of long bones, and digital clubbing. The mean ages at onset of first symptoms, clinical diagnosis, and genetic diagnosis were, respectively, 18.5 ± 2.7 years (16-22), 22 ± 3.4 years (18-26), and 47.5 ± 7.8 years (38-57). The mean time elapsed between the first symptoms and clinical diagnosis was 3.5 ± 1.7 years (1-5). Three index cases were members of Brazilian families, two from the interior of the state of Minas Gerais and one from the border between this state and São Paulo, while the fourth patient was a Palestinian immigrant. History of parental consanguinity was evident in two cases and apparently negative in one of the cases from Minas Gerais and in the Palestinian, regions/populations historically associated with increased consanguinity prevalence. Overall, all patients underwent at least one surgical procedure for PHO. Different PAVs, in homozygosity, were identified in the SLCO2A1 gene: case 1 (c.563 A>G; p.Q188R; exon 4); case 2 (c.1259G>T, p.C420F; rs 387907295; exon 9); case 3 (c.526G>A; p.A176T; exon 4); and case 4 (c.310G>T; p.G104*; exon 3). The PAVs found in cases 1 and 3 are novel, that of case 2 was previously described in homozygosity in a case with PHO, while the nonsense variant had only been reported in 5 individuals, all in heterozygosity, from population genomic banks. Clinical and/or radiological evaluation was conducted on 14 heterozygous relatives of the 3 Brazilian families, and a mild phenotype with pachydermia and mild periostosis was documented in the mother of case 2 (86 years) and the father (73 years) of case 3, while mild digital clubbing was identified in three members of the parental generation at the ages of 72, 73, and 81 years. Conclusion: Two new pathogenic variants and another, for the first time, in homozygosity, were associated with the PHO phenotype, expanding the record of PAVs in the SLCO2A1 gene. An autosomal recessive inheritance pattern was defined for the four index cases with the complete form of PHO. Expanded analysis of the phenotype of heterozygous relatives for PAV in the SLCO2A1 gene resulted in the identification of a mild and indolent form of PHO in four elderly individuals. Our findings, in association with recent revisited evidence, highlight the existence of an additional autosomal dominant inheritance mechanism associated with the SLCO2A1 gene, resulting in overall low penetrance and apparently increasing with age, as well as clinical heterogeneity, with a predominance of milder phenotypes than those seen in patients with homozygous or compound heterozygous PAV. Studies with larger casuistries may expand knowledge about the penetrance and phenotype of heterozygous cases for PAV in the SLCO2A1 geneBiblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPLourenço Junior, Delmar MunizArcanjo, Adriano Miguel2024-10-16info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/5/5135/tde-17022025-101454/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2025-02-27T19:30:02Zoai:teses.usp.br:tde-17022025-101454Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212025-02-27T19:30:02Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false |
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Análise dos genes HPGD e SLCO2A1 em pacientes com Paquidermoperiostose Arcanjo, Adriano Miguel Cutis verticis girata Cutis verticis gyrata Diagnóstico molecular Gene SLCO2A1 Molecular diagnosis Osteoartropatia hipertrófica primária Pachydermoperiostosis Paquidermoperiostose Primary hypertrophic Sequenciamento genético Sequencing |
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Introdução: A Osteoartropatia hipertrófica primária (PHO) ou Paquidermoperiostose (PDP) é uma doença genética rara que afeta ossos e pele. Casos com variantes alélicas patogênicas (VAP) germinativas nos genes SLCO2A1 e HPGD apresentam padrão de herança autossômica recessiva enquanto que a etiologia da forma de herança autossômica dominante foi, muito recentemente, associada com VAP germinativas, em heterozigose, no gene SLCO2A1. A penetrância da PHO em indivíduos heterozigotos para este gene é desconhecida uma vez que a avaliação clínica destes casos é, ainda, muito limitada. Casos autóctones do Brasil com PHO foram raramente reportados na literatura contrastando com inúmeros relatos e séries de pacientes reportados em outros continentes, principalmente da Ásia. Nenhuma avaliação dos genes HPGD (2008) e SLCO2A1 (2012) foi conduzida em casos com PHO no Brasil desde a associação deles com a doença. Objetivos: a. Descrever o fenótipo e investigar VAP germinativas nos genes HPGD e SLCO2A1 de quatro pacientes não relacionados com diagnóstico de PHO; b. promover o rastreamento e aconselhamento genético de familiares sob risco; c. expandir informações sobre o fenótipo e a penetrância de PHO em portadores de VAP em heterozigose. Métodos: Sequenciamento Sanger das regiões codificadoras e fronteiras íntron-éxon dos genes HPGD e SLCO2A1. Resultados: Os quatro pacientes não relacionados apresentavam a forma clínica completa de PHO pela presença combinada de paquidermia, com cutis verticis girata (CVG), periostose pronunciada de ossos longos e baqueteamento digital. A idade média de aparecimento dos primeiros sintomas, ao diagnóstico clínico e genético foram, respectivamente 18,5 ± 2,7 anos (16-22), 22 ± 3,4 anos (18-26) e 47,5 ± 7,8 anos (38-57). O tempo médio decorrido entre os primeiros sintomas até o diagnóstico clínico foi de 3,5 ± 1,7y (1-5). Três casos-índices eram membros de famílias brasileiras, sendo duas delas do interior do Estado de Minas Gerais e outra da fronteira entre este Estado e o de São Paulo enquanto o quarto paciente era um imigrante palestino. História de consanguinidade da geração parental foi evidente em dois casos e, aparentemente negativa, em um dos casos do Estado de Minas Gerais e no palestino, regiões/populações historicamente associadas com prevalência aumentada de consanguinidade. Em geral, todos pacientes foram submetidos a pelo menos um procedimento cirúrgico pela PHO. VAPs diferentes, em homozigose, foram identificadas no gene SLCO2A1: caso 1 (c.563 A>G; p.Q188R; éxon 4); caso 2 (c.1259G>T, p.C420F; rs 387907295; éxon 9); caso 3 (c.526G>A; p.A176T; éxon 4) e caso 4 (c.310G>T; p.G104*; éxon 3). As VAPs encontradas nos casos 1 e 3 são novas, a do caso 2 foi previamente descrita, em homozigose, em caso com PHO enquanto a variante nonsense somente havia sido relatada em 5 indivíduos, todos em heterozigose, a partir de bancos genômicos populacionais. Avaliação clínica e/ou radiológica foi conduzida em 14 familiares heterozigotos das 3 famílias brasileiras e fenótipo brando com paquidermia e periostose leve foi documentada na mãe do caso 2 (86 anos) e no pai (73 anos) do caso 3 enquanto hipocratismo digital leve foi identificado em três membros da geração parental nas idades de 72, 73 e 81 anos. Conclusão: Duas novas variantes patogênicas e outra, pela primeira vez, em homozigose, foram associadas ao fenótipo de PHO, ampliando o registro de VAP no gene SLCO2A1. Um padrão de herança autossômica recessiva foi definido para os quatro casos-índices com forma completa de PHO. A análise expandida do fenótipo de familiares heterozigotos para VAP no gene SLCO2A1 resultou na identificação de forma frusta e indolente de PHO em quatro idosos. Nossos achados, em associação com evidências recentes revisitadas, ressaltam a existência de um mecanismo adicional de herança autossômica dominante associado ao gene SLCO2A1, que resultam em penetrância global baixa e, aparentemente, crescente com a idade, além de heterogeneidade clínica, com predominância de fenótipos mais brandos do que vistos em pacientes portadores de VAP em homozigose ou em heterozigose composta. Estudos com casuísticas maiores poderão ampliar o conhecimento sobre a penetrância e o fenótipo de casos heterozigotos para VAP no gene SLCO2A1 |
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