Efeito da edição gênica e modulação da expressão de MIR146B no câncer de tiroide.

Bibliographic Details
Main Author: Inez, Daniel Casartelli de Santa
Publication Date: 2021
Format: Master thesis
Language: por
Source: Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
Download full: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42134/tde-15122022-100429/
Summary: MicroRNAs (miRNAs) são pequenos RNAs não codificantes que regulam a expressão de mRNAs alvo e são comumente desregulados no câncer. No câncer de tireoide, miR-146b é o miRNA mais superexpresso, estando associado à oncogênese e agressividade tumoral, levando à características clínicas e patológicas de pior prognóstico. Desta forma, visamos compreender o papel de miR-146b em um modelo agressivo de câncer de tireoide usando a metodologia de edição genica CRISPR/Cas9n. A linhagem KTC2 (carcinoma anaplásico humano) que expressa um alto nível de miR-146b foi cotransfectada com plasmídeos pSp-Cas9n-miR-146b-guiaA-puromicina e pSp-Cas9n-miR-146b-guiaB-GFP, contendo RNAs guia projetados para flanquear a região do precursor de miR-146b, impedindo a formação do pré-miR. Após a transfecção, foram selecionados dois clones, KTC2-Cl1 e KTC2-Cl3, e uma linha celular controle, KTC2-CTR, cotransfectada com ambos os plasmídeos sem RNA guia. Após a seleção dos clones e confirmação da edição de MIR146B pelo sequenciamento da região alvo, a expressão de miR-146b foi analisada por qPCR a partir do RNA total extraído, e seguida de ensaios de contagem celular, viabilidade, migração, formação de colônias e xenotransplante em camundongos imunossuprimidos. As linhagens KTC2 Cl1 e Cl3 apresentaram diminuição na expressão de miR-146b em relação ao controle, apresentando também redução na proliferação, viabilidade celular, migração e formação de colônias. E ainda, no experimento de xenotransplante, não houve crescimento tumoral das células KTC2-Cl1, injetadas no flanco de camundongos nude. Dessa forma, a modulação da expressão de miR-146b por edição genica utilizando CRISPR/Cas9n mostrou-se eficiente e constitui uma ferramenta molecular para o entendimento do papel dos miRNAs no câncer de tireoide.
id USP_8ff68f41e1455c557e291ae3e2ee4df3
oai_identifier_str oai:teses.usp.br:tde-15122022-100429
network_acronym_str USP
network_name_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository_id_str 2721
spelling Efeito da edição gênica e modulação da expressão de MIR146B no câncer de tiroide.Effect of gene editing and expression modulation of MIR146B in thyroid cancer.Anaplastic thyroid cancerCâncer anaplásico de tiroideCRISPR/CasCRISPR/CasEdição gênicaGene editingMicroRNAMicroRNAmiR-146bmiR-146bMicroRNAs (miRNAs) são pequenos RNAs não codificantes que regulam a expressão de mRNAs alvo e são comumente desregulados no câncer. No câncer de tireoide, miR-146b é o miRNA mais superexpresso, estando associado à oncogênese e agressividade tumoral, levando à características clínicas e patológicas de pior prognóstico. Desta forma, visamos compreender o papel de miR-146b em um modelo agressivo de câncer de tireoide usando a metodologia de edição genica CRISPR/Cas9n. A linhagem KTC2 (carcinoma anaplásico humano) que expressa um alto nível de miR-146b foi cotransfectada com plasmídeos pSp-Cas9n-miR-146b-guiaA-puromicina e pSp-Cas9n-miR-146b-guiaB-GFP, contendo RNAs guia projetados para flanquear a região do precursor de miR-146b, impedindo a formação do pré-miR. Após a transfecção, foram selecionados dois clones, KTC2-Cl1 e KTC2-Cl3, e uma linha celular controle, KTC2-CTR, cotransfectada com ambos os plasmídeos sem RNA guia. Após a seleção dos clones e confirmação da edição de MIR146B pelo sequenciamento da região alvo, a expressão de miR-146b foi analisada por qPCR a partir do RNA total extraído, e seguida de ensaios de contagem celular, viabilidade, migração, formação de colônias e xenotransplante em camundongos imunossuprimidos. As linhagens KTC2 Cl1 e Cl3 apresentaram diminuição na expressão de miR-146b em relação ao controle, apresentando também redução na proliferação, viabilidade celular, migração e formação de colônias. E ainda, no experimento de xenotransplante, não houve crescimento tumoral das células KTC2-Cl1, injetadas no flanco de camundongos nude. Dessa forma, a modulação da expressão de miR-146b por edição genica utilizando CRISPR/Cas9n mostrou-se eficiente e constitui uma ferramenta molecular para o entendimento do papel dos miRNAs no câncer de tireoide.MicroRNAs (miRNAs) are small non-coding RNAs that regulate the expression of target mRNAs and are commonly deregulated in cancer. In thyroid cancer, miR-146b is the most overexpressed miRNA, associated with oncogenesis and tumor aggressiveness, leading to clinical and pathological characteristics of worse prognosis. Therefore, we aim to understand the role of miR-146b in an aggressive model of thyroid cancer using the CRISPR/Cas9n gene editing methodology. The KTC2 strain (human anaplastic carcinoma) expressing a high level of miR-146b was cotransfected with plasmids pSp-Cas9n-miR-146b-guideA-puromycin and pSp-Cas9n-miR-146b-guideB-GFP, containing guide RNAs designed to flank the precursor region of miR-146b, preventing pre-miR formation. Following the transfection, two clones were selected, KTC2-Cl1 and KTC2-Cl3, and also a control cell line, KTC2-CTR, cotransfected with both plasmids with no guide RNA. After selection of clones and MIR146B editing confirmed by sequencing, miR-146b expression was analyzed by real-time PCR from the total RNA extracted, and cell counting, viability, migration, colony and xenotransplantation assays were performed. The KTC2 Cl1 and Cl3 strains showed a decrease in the expression of miR-146b in relation to the control, also showing reduced proliferation, cell viability, migration, and colony formation. Furthermore, in the xenograph experiment, no tumor growth was observed of the KTC2-Cl1 cells, injected into the flank of nude mice. Thus, a modulation of miR-146b expression by gene editing using CRISPR / Cas9n proved to be efficient as a molecular tool for understanding the role of miRNAs in thyroid cancer.Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USPFuziwara, Cesar SeigiKimura, Edna TerukoInez, Daniel Casartelli de Santa2021-12-08info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttps://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42134/tde-15122022-100429/reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USPinstname:Universidade de São Paulo (USP)instacron:USPLiberar o conteúdo para acesso público.info:eu-repo/semantics/openAccesspor2024-08-01T20:20:03Zoai:teses.usp.br:tde-15122022-100429Biblioteca Digital de Teses e Dissertaçõeshttp://www.teses.usp.br/PUBhttp://www.teses.usp.br/cgi-bin/mtd2br.plvirginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.bropendoar:27212024-08-01T20:20:03Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)false
dc.title.none.fl_str_mv Efeito da edição gênica e modulação da expressão de MIR146B no câncer de tiroide.
Effect of gene editing and expression modulation of MIR146B in thyroid cancer.
title Efeito da edição gênica e modulação da expressão de MIR146B no câncer de tiroide.
spellingShingle Efeito da edição gênica e modulação da expressão de MIR146B no câncer de tiroide.
Inez, Daniel Casartelli de Santa
Anaplastic thyroid cancer
Câncer anaplásico de tiroide
CRISPR/Cas
CRISPR/Cas
Edição gênica
Gene editing
MicroRNA
MicroRNA
miR-146b
miR-146b
title_short Efeito da edição gênica e modulação da expressão de MIR146B no câncer de tiroide.
title_full Efeito da edição gênica e modulação da expressão de MIR146B no câncer de tiroide.
title_fullStr Efeito da edição gênica e modulação da expressão de MIR146B no câncer de tiroide.
title_full_unstemmed Efeito da edição gênica e modulação da expressão de MIR146B no câncer de tiroide.
title_sort Efeito da edição gênica e modulação da expressão de MIR146B no câncer de tiroide.
author Inez, Daniel Casartelli de Santa
author_facet Inez, Daniel Casartelli de Santa
author_role author
dc.contributor.none.fl_str_mv Fuziwara, Cesar Seigi
Kimura, Edna Teruko
dc.contributor.author.fl_str_mv Inez, Daniel Casartelli de Santa
dc.subject.por.fl_str_mv Anaplastic thyroid cancer
Câncer anaplásico de tiroide
CRISPR/Cas
CRISPR/Cas
Edição gênica
Gene editing
MicroRNA
MicroRNA
miR-146b
miR-146b
topic Anaplastic thyroid cancer
Câncer anaplásico de tiroide
CRISPR/Cas
CRISPR/Cas
Edição gênica
Gene editing
MicroRNA
MicroRNA
miR-146b
miR-146b
description MicroRNAs (miRNAs) são pequenos RNAs não codificantes que regulam a expressão de mRNAs alvo e são comumente desregulados no câncer. No câncer de tireoide, miR-146b é o miRNA mais superexpresso, estando associado à oncogênese e agressividade tumoral, levando à características clínicas e patológicas de pior prognóstico. Desta forma, visamos compreender o papel de miR-146b em um modelo agressivo de câncer de tireoide usando a metodologia de edição genica CRISPR/Cas9n. A linhagem KTC2 (carcinoma anaplásico humano) que expressa um alto nível de miR-146b foi cotransfectada com plasmídeos pSp-Cas9n-miR-146b-guiaA-puromicina e pSp-Cas9n-miR-146b-guiaB-GFP, contendo RNAs guia projetados para flanquear a região do precursor de miR-146b, impedindo a formação do pré-miR. Após a transfecção, foram selecionados dois clones, KTC2-Cl1 e KTC2-Cl3, e uma linha celular controle, KTC2-CTR, cotransfectada com ambos os plasmídeos sem RNA guia. Após a seleção dos clones e confirmação da edição de MIR146B pelo sequenciamento da região alvo, a expressão de miR-146b foi analisada por qPCR a partir do RNA total extraído, e seguida de ensaios de contagem celular, viabilidade, migração, formação de colônias e xenotransplante em camundongos imunossuprimidos. As linhagens KTC2 Cl1 e Cl3 apresentaram diminuição na expressão de miR-146b em relação ao controle, apresentando também redução na proliferação, viabilidade celular, migração e formação de colônias. E ainda, no experimento de xenotransplante, não houve crescimento tumoral das células KTC2-Cl1, injetadas no flanco de camundongos nude. Dessa forma, a modulação da expressão de miR-146b por edição genica utilizando CRISPR/Cas9n mostrou-se eficiente e constitui uma ferramenta molecular para o entendimento do papel dos miRNAs no câncer de tireoide.
publishDate 2021
dc.date.none.fl_str_mv 2021-12-08
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42134/tde-15122022-100429/
url https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42134/tde-15122022-100429/
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.relation.none.fl_str_mv
dc.rights.driver.fl_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
info:eu-repo/semantics/openAccess
rights_invalid_str_mv Liberar o conteúdo para acesso público.
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.coverage.none.fl_str_mv
dc.publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
publisher.none.fl_str_mv Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
dc.source.none.fl_str_mv
reponame:Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
instname:Universidade de São Paulo (USP)
instacron:USP
instname_str Universidade de São Paulo (USP)
instacron_str USP
institution USP
reponame_str Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
collection Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP
repository.name.fl_str_mv Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP - Universidade de São Paulo (USP)
repository.mail.fl_str_mv virginia@if.usp.br|| atendimento@aguia.usp.br||virginia@if.usp.br
_version_ 1826318686698340352