Calibração da taxa de evolução do DNA barcode em peixes teleostei

• Autor(a) principal: Santos, Karina Camargo Arroyo dos
• Data de Publicação: 2021
• Tipo de documento: Dissertação
• Idioma: por
• Título da fonte: Repositório Digital Unisa da Universidade Santo Amaro
• dARK ID: ark:/30103/0013000001gs3
• Texto Completo: http://dspace.unisa.br/handle/123456789/879
• topic: Relógio Molecular; Citocromo Oxidase C Subunidade 1; COI; Taxa de Substituição Molecular

O presente estudo busca avaliar o gene Citocromo Oxidase C subunidade I (COI ou DNA Barcode) como potencial marcador de relógio molecular em Teleostei, tal como avaliar as interferências nas taxas de evolução nucleotídicas que esse gene está sujeito a depender das variáveis ecológicas e sistemáticas. Para estimar essa taxa de evolução foram buscadas na literatura árvores filogenéticas robustas nas quais foram empregadas técnicas de relógio molecular. Foram realizadas análises com dados de peixes marinhos e peixes dulcícolas coracoides. As sequências de COI das espécies foram obtidas no GenBank buscando a maior representatividade dos táxons das topologias referidas. Para ambas as análises o COI demonstrou estar saturado para grupos mais antigos, indicando que este tipo de análise deve ser feita para grupos mais recentes. Para obter as taxas do COI foi usado o programa Beast, sendo inserido neste as matrizes com as sequências, as arvores filogenéticas e pontos de calibração obtidos pelos artigos utilizados. Os resultados apontaram taxas de evolução com COI semelhante para os dois grupos de peixes, 1,17%/Ma em peixes marinhos e 1,05%/Ma em coracoides. Os valores encontrados foram validados em dois eventos geológicos conhecidos, a formação do Ístimo do Panamá e da cachoeira das Sete Quedas, relevando datas de divergência coerente com a literatura de 3,2 Ma e 1,6 Ma respectivamente. Não descartamos a possibilidade que fatores como temperatura e tamanho populacional possa influenciar nas taxas de evolução, visto que a taxa de evolução do COI em outro grupos pode ser bastante distintas. Os resultados encontrados nos dão indícios da possibilidade de se usar taxas evolutivas do COI para realizar relógios moleculares e trazer luz a eventos históricos pouco conhecidos e entender o processo de evolução, com a ressalva de se utilizar as taxas para linhagens próximas.