Isolamento, identificação e promoção de crescimento de bactérias diazotróficas em diferentes genótipos do complexo Saccharum

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Main Author: Guimarães, Nathalia de França
Publication Date: 2020
Format: Doctoral thesis
Language: por
Source: Repositório Institucional da UFRRJ
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Summary: Bactérias descritas como promotoras de crescimento vegetal podem influenciar no desenvolvimento de cultivares de cana-de-açúcar através de vários mecanismos, como fixação biológica de nitrogênio; pela solubilização de nutrientes; pela síntese de sideróforos; aumento da síntese de hormônios de crescimento vegetal; atuar no controle biológico de patógenos e no aumento da resistência a estresses bióticos e abióticos. Diante disso, esse estudo teve como objetivo de avaliar a promoção de crescimento de bactérias diazotróficas inoculadas em 20 cultivares pertencentes a oito espécies pertencentes ao “Complexo Saccharum”, e a partir de amostras radiculares, isolar e caracterizar bactérias destas plantas crescidas em substrato estéril. Diversos experimentos foram conduzidos em casa de vegetação utilizando os cultivares: Bourbon Sur, NG27-1124, Bamboo Rose, IJ76-315, Branca, Q44830, Biscuit e IN845 (Saccharum officinarum), Q45416 (Saccharum spp.), US72-1319 (Saccharum spontaneum), IJ76-414, IM76-228 (Saccharum robustum); White Pararia (Saccharum barberi), Maneria (Saccharum sinense), Fiji 15 (Miscanthus sp.) e IJ76-364, IJ76-358, IJ76- 359, IJ76-381, IJ76-384 (Erianthus arundinaceus). Os materiais estudados foram coletados no banco de germoplasma da Embrapa Agrobiologia. Os experimentos utilizaram o delineamento em blocos casualizados (DBC) em esquema fatorial duplo (2x2) com cinco repetições. Os fatores foram: ausência ou presença de inoculação com cinco estirpes de bactérias diazotróficas: Gluconacetobacter diazotrophicus; Herbaspirillum seropedicae; H. rubrisubalbicans; Paraburkholderia tropica e Nitrospirillum amazonense; e ausência ou não de tratamento térmico curto (TT) (52 °C por 30 min). Os mini-toletes (uma gema), tratados ou não com termoterapia e inoculados ou não, foram dispostos em caixa contendo substrato estéril para avaliar a brotação além de parâmetros biométricos de crescimento e analise da arquitetura radicular em oito genótipos usando o software WinRhizo Pro®. A partir do tecido radicular retirados do tratamento controle foram isoladas 88 estirpes bacterianos que formaram 18 agrupamentos usando caracteres morfológicos. Representantes destes grupos foram avaliados para identificação filogenética pelo sequenciamento da 16S, além de avaliar características fisiológicas de promoção de crescimento. Os genótipos Fiji 15, IM76-228, NG27-1124, IJ76-381, IJ76-414, Biscuit e IJ76-384 tiveram estímulo quando realizada a inoculação com a mistura das cinco bactérias supracitadas aumentando seu percentual de brotações. Os genótipos mais afetados pela termoterapia foram os genótipos Biscuit, IN845, Maneria, Bourbon Sur e NG27-1124. O genótipo IJ76-381 quando não submetido ao tratamento térmico, aumentou em até 31% em massa fresca de parte aérea. Os grupamentos formados apresentaram crescimento rápido variando de 5 a 7 dias, colonias de coloração amarelada, azulada ou esbranquiçada, gomosas e de caráter acidificante ou alcalino. A caracterização molecular apresentou grande diversidade de espécies sendo 16 Gram negativas e duas Gram positivas, ambas do gênero Bacillus. Entre as Gram-negativas o gênero Stenotrophomonas foi observado em três estirpes.
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spelling Guimarães, Nathalia de FrançaReis, Veronica Massenahttps://orcid.org/0000-0003-2149-7725http://lattes.cnpq.br/9099587982889283Alves, Bruno José Rodrigueshttps://orcid.org/0000-0002-5356-4032http://lattes.cnpq.br/5238072607952859Reis, Veronica Massenahttps://orcid.org/0000-0003-2149-7725http://lattes.cnpq.br/9099587982889283Jesus, Ederson da Conceiçãohttps://orcid.org/0000-0002-2687-8976http://lattes.cnpq.br/8253292050291316Rouws, Luc Felicianus Mariehttps://orcid.org/0000-0002-4634-5501http://lattes.cnpq.br/4500797890789377Soares, Luís Henrique de Barroshttp://lattes.cnpq.br/2263477131913713Araújo, Adelson Paulo dehttps://orcid.org/0000-0002-4106-6175http://lattes.cnpq.br/5394022232015318http://lattes.cnpq.br/60492577007723052025-04-03T12:38:31Z2025-04-03T12:38:31Z2020-02-28GUIMARÃES, Nathalia de França. Isolamento, identificação e promoção de crescimento de bactérias diazotróficas em diferentes genótipos do complexo Saccharum. 2020. 83 f. Tese (Doutorado em Agronomia, Ciência do Solo) - Instituto de Agronomia, Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro, Seropédica, 2020.https://rima.ufrrj.br/jspui/handle/20.500.14407/20776Bactérias descritas como promotoras de crescimento vegetal podem influenciar no desenvolvimento de cultivares de cana-de-açúcar através de vários mecanismos, como fixação biológica de nitrogênio; pela solubilização de nutrientes; pela síntese de sideróforos; aumento da síntese de hormônios de crescimento vegetal; atuar no controle biológico de patógenos e no aumento da resistência a estresses bióticos e abióticos. Diante disso, esse estudo teve como objetivo de avaliar a promoção de crescimento de bactérias diazotróficas inoculadas em 20 cultivares pertencentes a oito espécies pertencentes ao “Complexo Saccharum”, e a partir de amostras radiculares, isolar e caracterizar bactérias destas plantas crescidas em substrato estéril. Diversos experimentos foram conduzidos em casa de vegetação utilizando os cultivares: Bourbon Sur, NG27-1124, Bamboo Rose, IJ76-315, Branca, Q44830, Biscuit e IN845 (Saccharum officinarum), Q45416 (Saccharum spp.), US72-1319 (Saccharum spontaneum), IJ76-414, IM76-228 (Saccharum robustum); White Pararia (Saccharum barberi), Maneria (Saccharum sinense), Fiji 15 (Miscanthus sp.) e IJ76-364, IJ76-358, IJ76- 359, IJ76-381, IJ76-384 (Erianthus arundinaceus). Os materiais estudados foram coletados no banco de germoplasma da Embrapa Agrobiologia. Os experimentos utilizaram o delineamento em blocos casualizados (DBC) em esquema fatorial duplo (2x2) com cinco repetições. Os fatores foram: ausência ou presença de inoculação com cinco estirpes de bactérias diazotróficas: Gluconacetobacter diazotrophicus; Herbaspirillum seropedicae; H. rubrisubalbicans; Paraburkholderia tropica e Nitrospirillum amazonense; e ausência ou não de tratamento térmico curto (TT) (52 °C por 30 min). Os mini-toletes (uma gema), tratados ou não com termoterapia e inoculados ou não, foram dispostos em caixa contendo substrato estéril para avaliar a brotação além de parâmetros biométricos de crescimento e analise da arquitetura radicular em oito genótipos usando o software WinRhizo Pro®. A partir do tecido radicular retirados do tratamento controle foram isoladas 88 estirpes bacterianos que formaram 18 agrupamentos usando caracteres morfológicos. Representantes destes grupos foram avaliados para identificação filogenética pelo sequenciamento da 16S, além de avaliar características fisiológicas de promoção de crescimento. Os genótipos Fiji 15, IM76-228, NG27-1124, IJ76-381, IJ76-414, Biscuit e IJ76-384 tiveram estímulo quando realizada a inoculação com a mistura das cinco bactérias supracitadas aumentando seu percentual de brotações. Os genótipos mais afetados pela termoterapia foram os genótipos Biscuit, IN845, Maneria, Bourbon Sur e NG27-1124. O genótipo IJ76-381 quando não submetido ao tratamento térmico, aumentou em até 31% em massa fresca de parte aérea. Os grupamentos formados apresentaram crescimento rápido variando de 5 a 7 dias, colonias de coloração amarelada, azulada ou esbranquiçada, gomosas e de caráter acidificante ou alcalino. A caracterização molecular apresentou grande diversidade de espécies sendo 16 Gram negativas e duas Gram positivas, ambas do gênero Bacillus. Entre as Gram-negativas o gênero Stenotrophomonas foi observado em três estirpes.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPESBacteria described as plant growth promoters can influence the development of sugarcane cultivars through various mechanisms, such as biological nitrogen fixation, nutrient solubilization, siderophore synthesis, increased synthesis of plant growth hormones, biological control of pathogens, and increased resistance to biotic and abiotic stresses. Therefore, this study aimed to evaluate the growth promotion of diazotrophic bacteria inoculated in 20 cultivars belonging to eight species of the "Saccharum Complex" and to isolate and characterize bacteria from these plants grown in sterile substrate from root samples. Several greenhouse experiments were conducted using the cultivars: Bourbon Sur, NG27-1124, Bamboo Rose, IJ76-315, Branca, Q44830, Biscuit, and IN845 (Saccharum officinarum), Q45416 (Saccharum spp.), US72-1319 (Saccharum spontaneum), IJ76-414, IM76-228 (Saccharum robustum); White Pararia (Saccharum barberi), Maneria (Saccharum sinense), Fiji 15 (Miscanthus sp.), and IJ76-364, IJ76-358, IJ76-359, IJ76-381, IJ76-384 (Erianthus arundinaceus). The materials studied were collected from the Embrapa Agrobiologia germplasm bank. The experiments used a randomized block design (RBD) in a double factorial (2x2) with five repetitions. The factors were: absence or presence of inoculation with five strains of diazotrophic bacteria: Gluconacetobacter diazotrophicus; Herbaspirillum seropedicae; H. rubrisubalbicans; Paraburkholderia tropica; and Nitrospirillum amazonense; and absence or presence of short-term heat treatment (52 °C for 30 min). The mini-stems (one bud), treated or not with thermotherapy and inoculated or not, were placed in a box containing a sterile substrate to evaluate sprouting, as well as biometric growth parameters and analysis of root architecture in eight genotypes using WinRhizo ProTM software. From the root tissue removed from the control treatment, 88 bacterial strains were isolated, which formed 18 clusters using morphological characters. Representatives of these groups were evaluated for phylogenetic identification by sequencing the 16S, in addition to evaluating physiological characteristics of growth promotion. The genotypes Fiji 15, IM76- 228, NG27-1124, IJ76-381, IJ76-414, Biscuit, and IJ76-384 were stimulated when inoculated with the mixture of the five bacteria as mentioned earlier, increasing their percentage of sprouting. The genotypes most affected by thermotherapy were the genotypes Biscuit, IN845, Maneria, Bourbon Sur, and NG27-1124. The genotype IJ76-381, when not subjected to thermotherapy, increased fresh shoot mass by up to 31%. The formed clusters showed rapid growth ranging from 5 to 7 days, colonies with yellow, blue, or whitish coloring, gum-like texture, and acidifying or alkaline characters. Molecular characterization showed a great diversity of species, with 16 Gram-negative and two Gram-positive, both from the Bacillus genus. Among the Gram-negative bacteria, the Stenotrophomonas genus was observed in three strains.porUniversidade Federal Rural do Rio de JaneiroPrograma de Pós-Graduação em Agronomia - Ciência do SoloUFRRJBrasilInstituto de AgronomiaAgronomiaGênero SaccharumBactérias endofíticasInteração planta-bactériaTermoterapiaSaccharum generaEndofitica bacteriaPlant-bacteria interactionTermotherapyIsolamento, identificação e promoção de crescimento de bactérias diazotróficas em diferentes genótipos do complexo SaccharumIsolamento, identificação e promoção de crescimento de bactérias diazotróficas em diferentes genótipos do complexo Saccharuminfo:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/doctoralThesisAIZAWA, T.; VE, N. B.; NAKAJIMA, M.; SUNAIRI, M. Burkholderia heleia sp. nov., a nitrogen-fixing bacterium isolated from an aquatic plant, Eleocharis dulcis, that grows in highly acidic swamps in actual acid sulfate soil areas of Vietnam. 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Guimarães, Nathalia de França
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description Bactérias descritas como promotoras de crescimento vegetal podem influenciar no desenvolvimento de cultivares de cana-de-açúcar através de vários mecanismos, como fixação biológica de nitrogênio; pela solubilização de nutrientes; pela síntese de sideróforos; aumento da síntese de hormônios de crescimento vegetal; atuar no controle biológico de patógenos e no aumento da resistência a estresses bióticos e abióticos. Diante disso, esse estudo teve como objetivo de avaliar a promoção de crescimento de bactérias diazotróficas inoculadas em 20 cultivares pertencentes a oito espécies pertencentes ao “Complexo Saccharum”, e a partir de amostras radiculares, isolar e caracterizar bactérias destas plantas crescidas em substrato estéril. Diversos experimentos foram conduzidos em casa de vegetação utilizando os cultivares: Bourbon Sur, NG27-1124, Bamboo Rose, IJ76-315, Branca, Q44830, Biscuit e IN845 (Saccharum officinarum), Q45416 (Saccharum spp.), US72-1319 (Saccharum spontaneum), IJ76-414, IM76-228 (Saccharum robustum); White Pararia (Saccharum barberi), Maneria (Saccharum sinense), Fiji 15 (Miscanthus sp.) e IJ76-364, IJ76-358, IJ76- 359, IJ76-381, IJ76-384 (Erianthus arundinaceus). Os materiais estudados foram coletados no banco de germoplasma da Embrapa Agrobiologia. Os experimentos utilizaram o delineamento em blocos casualizados (DBC) em esquema fatorial duplo (2x2) com cinco repetições. Os fatores foram: ausência ou presença de inoculação com cinco estirpes de bactérias diazotróficas: Gluconacetobacter diazotrophicus; Herbaspirillum seropedicae; H. rubrisubalbicans; Paraburkholderia tropica e Nitrospirillum amazonense; e ausência ou não de tratamento térmico curto (TT) (52 °C por 30 min). Os mini-toletes (uma gema), tratados ou não com termoterapia e inoculados ou não, foram dispostos em caixa contendo substrato estéril para avaliar a brotação além de parâmetros biométricos de crescimento e analise da arquitetura radicular em oito genótipos usando o software WinRhizo Pro®. A partir do tecido radicular retirados do tratamento controle foram isoladas 88 estirpes bacterianos que formaram 18 agrupamentos usando caracteres morfológicos. Representantes destes grupos foram avaliados para identificação filogenética pelo sequenciamento da 16S, além de avaliar características fisiológicas de promoção de crescimento. Os genótipos Fiji 15, IM76-228, NG27-1124, IJ76-381, IJ76-414, Biscuit e IJ76-384 tiveram estímulo quando realizada a inoculação com a mistura das cinco bactérias supracitadas aumentando seu percentual de brotações. Os genótipos mais afetados pela termoterapia foram os genótipos Biscuit, IN845, Maneria, Bourbon Sur e NG27-1124. O genótipo IJ76-381 quando não submetido ao tratamento térmico, aumentou em até 31% em massa fresca de parte aérea. Os grupamentos formados apresentaram crescimento rápido variando de 5 a 7 dias, colonias de coloração amarelada, azulada ou esbranquiçada, gomosas e de caráter acidificante ou alcalino. A caracterização molecular apresentou grande diversidade de espécies sendo 16 Gram negativas e duas Gram positivas, ambas do gênero Bacillus. Entre as Gram-negativas o gênero Stenotrophomonas foi observado em três estirpes.
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