Uncoupling heart and liver laterality events during embryogenesis

Detalhes bibliográficos
Autor(a) principal: Sampaio, Pedro Rafael Martins de Almeida
Data de Publicação: 2021
Idioma: eng
Título da fonte: Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
Texto Completo: http://hdl.handle.net/10362/119445
Resumo: RESUMO:Uma característica distintiva e essencial do corpo dos vertebrados é a pronunciada assimetria dos órgãos internos em relação ao eixo esquerda-direito. A decisão de que órgãos deverão ser formados do lado esquerdo ou do lado direito é estabelecida cedo durante o desenvolvimento do embrião. Este processo é iniciado num órgão especializado, chamado de Organizador esquerda-direita, também conhecido como nó em mamíferos ou vesícula de Kupffer em peixes. À superficie de cada uma das células deste órgão existe um cílio móvel ou imóvel, uma estrutura semelhante a um cabelo com um comprimento aproximado de 5µm. Enquanto que os cílios móveis do Organizador desempenham um papel crucial ao gerarem um fluxo de fluído direccional da direita para a esquerda, os cílios imóveis são considerados como potenciais sensores deste mesmo fluxo. Este evento desencadea uma resposta assimétrica de elevação de cálcio intracelular do lado esquerdo do Organizador, iniciando assim uma cascata molecular de expressão de genes da via de sinalização Nodal. Dand5, que codifica um antagonista do Nodal, é o primeiro gene a ser assimetricamente expresso, no lado direito da região do Organizador. Como resultado, o Nodal, um factor secretado da família TGF-β, torna-se activo apenas do lado esquerdo do Organizador. Devido a um mecanismo de auto-activação, a expressão assimétrica de Nodal é depois propagada anterior e posteriormente para a mesoderme lateral esquerda. Esta porção do tecido embrionário irá dar origem ao coração, vasos sanguíneos e glóbulos vermelhos. Adicionalmente, à mesoderme, o ligando Nodal também afecta o processo de especificação e desenvolvimento da endoderme, que por sua vez vai formar outros órgãos viscerais como o fígado ou o pâncreas. No entanto, os passos iniciais do estabelecimento da lateralidade ainda não são bem entendidos. A natureza do sinal que é produzido pelo fluxo de fluídos no Organizador é ainda hoje debatida. Duas teorias alternativas e não exclusivas foram propostas: o fluxo actua como força hidrodinâmica que desencadeia vias mecano-sensoriais ou, alternativamente, o fluxo como veículo de moléculas sinalizadoras que são integradas pelas células do lado esquerdo. Estudos realizados em ratinho e no peixe medaka descobriram que o complexo proteíco Pkd1l1-Pkd2 é expresso nos cílios do Organizador e é necessário para o correcto estabelecimento da lateralidade. Enquanto que a Pkd2 designa um canal catiónico nãoselectivo de cálcio, a Pkd1l1 é considerada como um receptor transmembranar mecanosensorial. Nos rins, o complexo Pkd2-Pkd1 demonstrou ter a capacidade de sentir o stress mecânico realizado pelo fluxo de urina, e de induzir sinais intracelulares de cálcio, que juntos estão envolvidos na regulação da diferenciação, crescimento e apoptose das células renais. Pkd2 e o seu parceiro Pkd1l1 também foram propostos como o complexo mecanosensor responsável pela detecção do fluxo no Organizador do ratinho, medaka e peixe-zebra e, deste modo, pelo transporte da sinalização molecular para os tecidos adjacentes. Apesar de ambos funcionarem como um complexo, foi demonstrado que a ausência do canal Pkd2 por si só é suficiente para inibir os potenciais de cálcio normalmente observados do lado esquerdo do Organizador. A interrupção da sinalização por cálcio afecta a expressão de genes da via Nodal, causando assim defeitos de lateralidade nos órgãos, tais como situs inversus que envolve a inversão total do posicionamento dos órgãos , e heterotaxia, onde um ou vários órgãos apresentam defeitos de lateralidade. Por definição estes padrões aberrantes de lateralidade, nem sempre envolvem os órgãos derivativos da mesoderme (coração) e da endoderme (sistema digestivo) simultaneamente, indicando que a posição dos órgãos internos torácicos e abdominais pode ser desacoplada molecularmente durante o desenvolvimento do embrião. Até agora, desconhece-se como o fluxo do Organizador pode estar a regular ambos os processos. Neste contexto, a disfunção ciliar tem também sido ligada a uma lista de doenças pleiotrópicas em humanos, referidas colectivamente como ciliopatias. Entre estas existe uma doença que envolve defeitos de motilidade ciliar, referida como discinesia ciliar primária (DCP), caracterizada por infecções recorrentes das vias respiratórias, sinusite, bronquiectasias e infertilidade masculina e feminina. Uma vez que o fluxo no Organizador é perturbado durante a embriogénese, aproximadamente 50% dos pacientes com DCP também apresentam defeitos de lateralidade. Em Portugal, até ao início da década de 2010, o diagnóstico desta doença não era realizado segundo as normas europeias, havendo grande risco de um diagnóstico inconclusivo ou errado para muitos destes doentes. De igual modo, o investimento feito para o estudo desta doença foi nulo ou muito reduzido, não havendo dados epidimiológicos ou patofisiológicos publicados que permitissem caracterizar a incidência desta doença na população portuguesa. Sumariamente, com este projecto de doutoramento focámo-nos em fornecer novos dados que ajudem à compreensão dos vários passos moleculares no estabelecimento de assimetria. Paralelalmente, documentamos a criação de um consórcio de várias entidades portuguesas que centralizam o diagnóstico da doença DCP na região de Lisboa, e possibilitam o estudo e caracterização das variantes fenotipicas e genéticas prevalentes no país. Primeiro explorámos a hipótese de que o estabelecimento de assimetria esquerda-direita ocorre exclusivamente através do canal catiónico Pkd2 (Capítulo 2). Uma das vantagens de usar o peixe-zebra para responder a esta pergunta é a capacidade de o manipular geneticamente em estadios de desenvolvimento precoce e ver o impacto de cada manipulação na arquitectura do Organizador (Vesícula de Kupffer), motilidade ciliar, padrão de fluxo de fluídos e posicionamento dos órgãos, tudo no mesmo embrião. Desse modo, utilizámos ferramentas genéticas para reprimir o mecanismo de sinalização de cálcio por redução da proteína Pkd2, e abolir o fluxo de fluídos no Organizador através do knockdown da Dnah7, uma proteína ciliar crucial para conferir movimento ao cílio. Em seguida, comparámos estes dois grupos ao nível da expressão génica de dand5 e lateralização dos órgãos. Os nossos resultados demonstram que a redução dos níveis da proteína Pkd2 resulta numa diminuição do comprimento ciliar, desarranjos da arquitectura do Organizador e dinâmica de fluxo anormal. A única abordagem que não afectou a arquitetura do Organizador foi quando reduzimos a Pkd2 exclusivamente das células precursoras do Organizador, no entanto, mesmo assim, foi observado um decréscimo do comprimento ciliar e velocidades de fluxo. Contudo, todas as manipulações realizadas resultaram em proporções semelhantes de defeitos de expressão de dand5 e da lateralidade dos órgãos. Assim, concluímos que a redução de Pkd2 conduz a defeitos esquerda-direita que não podem ser atribuídos exclusivamente ao seu papel putativo na mediação da mecanosensação porque ao modificar a arquitectura celular ou ao diminuir o comprimento ciliar, a ausência de Pkd2 afecta a dinâmica do fluxo no Organizador. De seguida analisámos em detalhe os passos que antecedem o estabelecimento de assimetria esquerda-direita. Apesar de todos os cílios do Organizador apresentarem competência para se tornarem móveis, apenas alguns adquirem esta funcionalidade. De acordo com resultados do nosso grupo, a decisão de móvel contra imóvel acontece através de um mecanismo mediado via sinalização Notch. Assim, observámos que apesar de a maioria dos cílios do Organizador se encontrar imóvel no seu início, estes tornam-se móveis ao longo do desenvolvimento, que consequentemente impacta na formação de um fluxo direccional e progressivamente mais forte. À luz destes resultados perguntámo-nos de qual terá de ser a força do fluxo para que a quebra da simetria inicie e em que estágio de desenvolvimento isto acontece. A fim de responder esta questão, implementámos uma estratégia inovadora que envolve a extracção mecânica do líquido do Organizador em cada fase somítica compreendida entre 3 e 12 sómitos, que equivale a um intervalo de tempo de 4 horas. Isto permitiu-nos não só abordar a importância do fluxo de fluídos ao longo de todas as fases de desenvolvimento do KV, mas também testar a importância do conteúdo do fluido. Assim, determinámos que o estabelecimento da lateralidade acontece entre os 3 e os 6 sómitos, numa janela de tempo de 1 hora e meia. Durante esses estágios de desenvolvimento o fluxo de líquido dentro do Organizador é direccional e existe um número semelhante entre cílios móveis e imóveis. A perturbação do fluxo direccional, principalmente na região anterior do Organizador, resulta numa expressão bilateral de dand5 e defeitos de lateralidade dos órgãos. Ao substituirmos o líquido presente no Organizador por uma solução tampão, observámos que não existe perturbação na determinação de lateralidade. Em conjunto, este resultados apoiam a hipótese mecano-sensora em detrimento da hipótese quemo-sensora. Adicionalmente, tanto o coração (derivado da mesoderme) como o fígado (derivado da endoderme) são igualmente afectados quando o fluxo é perturbado entre os 3 e os 6 sómitos, indicando que a sua dissociação só poderá ocorrer em fases de sinalização posteriores ao fluxo do Organizador. No Capítulo 3 relatamos uma análise comparativa entre um grupo de indivíduos saudáveis e um grupo de pacientes referidos para equipa portuguesa de diagnóstico da Discinésia Ciliar Primária (DCP). Este trabalho está integrado num estudo multidisciplinar que involve a implementação de um painel de testes para o diagnóstico e estudo da Discinésia Ciliar Primária, nomeadamente a medição do óxido nítrico nasal, microscopia electrónica, videomicroscopia de alta-velocidade, imunofluorescência e sequência genómica. O objectivo deste estudo foi determinar a gama de frequências e padrões de batimento ciliar num grupo controlo de voluntários saudáveis portugueses e num grupo de doentes portugueses com DCP. Nesse sentido, utilizámos a análise de vídeo-microscopia de alta velocidade (VMAV) para a caracterização do batimento ciliar em amostrais nasais colhidas dos indivíduos. A falta de ferramentas computacionais de livre acesso que permitissem a análise de grandes sequências de imagens obtidas por VMAV, levou-nos a criar um novo software para a detecção de frequências do batimento ciliar. Esta nova ferramenta, à qual chamámos de ‘CiliarMove’, foi validada contra o método convencional de observação directa. Demonstramos que o ‘CiliarMove’ poderá ser utilizada de forma fiável por outros centros clínicos ou de investigação em Portugal ou noutros países, para o auxílio do diagnóstico da DCP. Adicionalmente, identificámos novas variantes genéticas em doentes diagnosticados com DCP, e estabelecemos a correlação com o respectivo fenótipo ciliar. Acreditamos que no futuro, estes dados serão úteis para a criação de novas terapias direccionadas e para o melhoramento do diagnóstico desta doença. Com este trabalho identificámos de forma inequívoca qual a janela de tempo para a quebra de simetria no peixe-zebra, e caracterizámos os regimes de fluxo de fluídos no Organizador necessários para a determinação da lateralidade. Esta nova informação irá redireccionar como é que trabalhos futuros irão abordar o estudo dos eventos de quebra de simetria em peixezebra e possivelmente noutros animais modelo. Por outro lado, apresentamos uma novo grupo disciplinar para o diagnóstico da DCP, que revoluciona a compreensão da fisiopatologia e da abordagem diagnóstica desta doença em Portugal.
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spelling Uncoupling heart and liver laterality events during embryogenesisEmbriogéneseDiscinesia Ciliar Primária - diagnósticoEmbryogenesisPrimary Ciliary Dyskinesia - diagnosisCiências MédicasRESUMO:Uma característica distintiva e essencial do corpo dos vertebrados é a pronunciada assimetria dos órgãos internos em relação ao eixo esquerda-direito. A decisão de que órgãos deverão ser formados do lado esquerdo ou do lado direito é estabelecida cedo durante o desenvolvimento do embrião. Este processo é iniciado num órgão especializado, chamado de Organizador esquerda-direita, também conhecido como nó em mamíferos ou vesícula de Kupffer em peixes. À superficie de cada uma das células deste órgão existe um cílio móvel ou imóvel, uma estrutura semelhante a um cabelo com um comprimento aproximado de 5µm. Enquanto que os cílios móveis do Organizador desempenham um papel crucial ao gerarem um fluxo de fluído direccional da direita para a esquerda, os cílios imóveis são considerados como potenciais sensores deste mesmo fluxo. Este evento desencadea uma resposta assimétrica de elevação de cálcio intracelular do lado esquerdo do Organizador, iniciando assim uma cascata molecular de expressão de genes da via de sinalização Nodal. Dand5, que codifica um antagonista do Nodal, é o primeiro gene a ser assimetricamente expresso, no lado direito da região do Organizador. Como resultado, o Nodal, um factor secretado da família TGF-β, torna-se activo apenas do lado esquerdo do Organizador. Devido a um mecanismo de auto-activação, a expressão assimétrica de Nodal é depois propagada anterior e posteriormente para a mesoderme lateral esquerda. Esta porção do tecido embrionário irá dar origem ao coração, vasos sanguíneos e glóbulos vermelhos. Adicionalmente, à mesoderme, o ligando Nodal também afecta o processo de especificação e desenvolvimento da endoderme, que por sua vez vai formar outros órgãos viscerais como o fígado ou o pâncreas. No entanto, os passos iniciais do estabelecimento da lateralidade ainda não são bem entendidos. A natureza do sinal que é produzido pelo fluxo de fluídos no Organizador é ainda hoje debatida. Duas teorias alternativas e não exclusivas foram propostas: o fluxo actua como força hidrodinâmica que desencadeia vias mecano-sensoriais ou, alternativamente, o fluxo como veículo de moléculas sinalizadoras que são integradas pelas células do lado esquerdo. Estudos realizados em ratinho e no peixe medaka descobriram que o complexo proteíco Pkd1l1-Pkd2 é expresso nos cílios do Organizador e é necessário para o correcto estabelecimento da lateralidade. Enquanto que a Pkd2 designa um canal catiónico nãoselectivo de cálcio, a Pkd1l1 é considerada como um receptor transmembranar mecanosensorial. Nos rins, o complexo Pkd2-Pkd1 demonstrou ter a capacidade de sentir o stress mecânico realizado pelo fluxo de urina, e de induzir sinais intracelulares de cálcio, que juntos estão envolvidos na regulação da diferenciação, crescimento e apoptose das células renais. Pkd2 e o seu parceiro Pkd1l1 também foram propostos como o complexo mecanosensor responsável pela detecção do fluxo no Organizador do ratinho, medaka e peixe-zebra e, deste modo, pelo transporte da sinalização molecular para os tecidos adjacentes. Apesar de ambos funcionarem como um complexo, foi demonstrado que a ausência do canal Pkd2 por si só é suficiente para inibir os potenciais de cálcio normalmente observados do lado esquerdo do Organizador. A interrupção da sinalização por cálcio afecta a expressão de genes da via Nodal, causando assim defeitos de lateralidade nos órgãos, tais como situs inversus que envolve a inversão total do posicionamento dos órgãos , e heterotaxia, onde um ou vários órgãos apresentam defeitos de lateralidade. Por definição estes padrões aberrantes de lateralidade, nem sempre envolvem os órgãos derivativos da mesoderme (coração) e da endoderme (sistema digestivo) simultaneamente, indicando que a posição dos órgãos internos torácicos e abdominais pode ser desacoplada molecularmente durante o desenvolvimento do embrião. Até agora, desconhece-se como o fluxo do Organizador pode estar a regular ambos os processos. Neste contexto, a disfunção ciliar tem também sido ligada a uma lista de doenças pleiotrópicas em humanos, referidas colectivamente como ciliopatias. Entre estas existe uma doença que envolve defeitos de motilidade ciliar, referida como discinesia ciliar primária (DCP), caracterizada por infecções recorrentes das vias respiratórias, sinusite, bronquiectasias e infertilidade masculina e feminina. Uma vez que o fluxo no Organizador é perturbado durante a embriogénese, aproximadamente 50% dos pacientes com DCP também apresentam defeitos de lateralidade. Em Portugal, até ao início da década de 2010, o diagnóstico desta doença não era realizado segundo as normas europeias, havendo grande risco de um diagnóstico inconclusivo ou errado para muitos destes doentes. De igual modo, o investimento feito para o estudo desta doença foi nulo ou muito reduzido, não havendo dados epidimiológicos ou patofisiológicos publicados que permitissem caracterizar a incidência desta doença na população portuguesa. Sumariamente, com este projecto de doutoramento focámo-nos em fornecer novos dados que ajudem à compreensão dos vários passos moleculares no estabelecimento de assimetria. Paralelalmente, documentamos a criação de um consórcio de várias entidades portuguesas que centralizam o diagnóstico da doença DCP na região de Lisboa, e possibilitam o estudo e caracterização das variantes fenotipicas e genéticas prevalentes no país. Primeiro explorámos a hipótese de que o estabelecimento de assimetria esquerda-direita ocorre exclusivamente através do canal catiónico Pkd2 (Capítulo 2). Uma das vantagens de usar o peixe-zebra para responder a esta pergunta é a capacidade de o manipular geneticamente em estadios de desenvolvimento precoce e ver o impacto de cada manipulação na arquitectura do Organizador (Vesícula de Kupffer), motilidade ciliar, padrão de fluxo de fluídos e posicionamento dos órgãos, tudo no mesmo embrião. Desse modo, utilizámos ferramentas genéticas para reprimir o mecanismo de sinalização de cálcio por redução da proteína Pkd2, e abolir o fluxo de fluídos no Organizador através do knockdown da Dnah7, uma proteína ciliar crucial para conferir movimento ao cílio. Em seguida, comparámos estes dois grupos ao nível da expressão génica de dand5 e lateralização dos órgãos. Os nossos resultados demonstram que a redução dos níveis da proteína Pkd2 resulta numa diminuição do comprimento ciliar, desarranjos da arquitectura do Organizador e dinâmica de fluxo anormal. A única abordagem que não afectou a arquitetura do Organizador foi quando reduzimos a Pkd2 exclusivamente das células precursoras do Organizador, no entanto, mesmo assim, foi observado um decréscimo do comprimento ciliar e velocidades de fluxo. Contudo, todas as manipulações realizadas resultaram em proporções semelhantes de defeitos de expressão de dand5 e da lateralidade dos órgãos. Assim, concluímos que a redução de Pkd2 conduz a defeitos esquerda-direita que não podem ser atribuídos exclusivamente ao seu papel putativo na mediação da mecanosensação porque ao modificar a arquitectura celular ou ao diminuir o comprimento ciliar, a ausência de Pkd2 afecta a dinâmica do fluxo no Organizador. De seguida analisámos em detalhe os passos que antecedem o estabelecimento de assimetria esquerda-direita. Apesar de todos os cílios do Organizador apresentarem competência para se tornarem móveis, apenas alguns adquirem esta funcionalidade. De acordo com resultados do nosso grupo, a decisão de móvel contra imóvel acontece através de um mecanismo mediado via sinalização Notch. Assim, observámos que apesar de a maioria dos cílios do Organizador se encontrar imóvel no seu início, estes tornam-se móveis ao longo do desenvolvimento, que consequentemente impacta na formação de um fluxo direccional e progressivamente mais forte. À luz destes resultados perguntámo-nos de qual terá de ser a força do fluxo para que a quebra da simetria inicie e em que estágio de desenvolvimento isto acontece. A fim de responder esta questão, implementámos uma estratégia inovadora que envolve a extracção mecânica do líquido do Organizador em cada fase somítica compreendida entre 3 e 12 sómitos, que equivale a um intervalo de tempo de 4 horas. Isto permitiu-nos não só abordar a importância do fluxo de fluídos ao longo de todas as fases de desenvolvimento do KV, mas também testar a importância do conteúdo do fluido. Assim, determinámos que o estabelecimento da lateralidade acontece entre os 3 e os 6 sómitos, numa janela de tempo de 1 hora e meia. Durante esses estágios de desenvolvimento o fluxo de líquido dentro do Organizador é direccional e existe um número semelhante entre cílios móveis e imóveis. A perturbação do fluxo direccional, principalmente na região anterior do Organizador, resulta numa expressão bilateral de dand5 e defeitos de lateralidade dos órgãos. Ao substituirmos o líquido presente no Organizador por uma solução tampão, observámos que não existe perturbação na determinação de lateralidade. Em conjunto, este resultados apoiam a hipótese mecano-sensora em detrimento da hipótese quemo-sensora. Adicionalmente, tanto o coração (derivado da mesoderme) como o fígado (derivado da endoderme) são igualmente afectados quando o fluxo é perturbado entre os 3 e os 6 sómitos, indicando que a sua dissociação só poderá ocorrer em fases de sinalização posteriores ao fluxo do Organizador. No Capítulo 3 relatamos uma análise comparativa entre um grupo de indivíduos saudáveis e um grupo de pacientes referidos para equipa portuguesa de diagnóstico da Discinésia Ciliar Primária (DCP). Este trabalho está integrado num estudo multidisciplinar que involve a implementação de um painel de testes para o diagnóstico e estudo da Discinésia Ciliar Primária, nomeadamente a medição do óxido nítrico nasal, microscopia electrónica, videomicroscopia de alta-velocidade, imunofluorescência e sequência genómica. O objectivo deste estudo foi determinar a gama de frequências e padrões de batimento ciliar num grupo controlo de voluntários saudáveis portugueses e num grupo de doentes portugueses com DCP. Nesse sentido, utilizámos a análise de vídeo-microscopia de alta velocidade (VMAV) para a caracterização do batimento ciliar em amostrais nasais colhidas dos indivíduos. A falta de ferramentas computacionais de livre acesso que permitissem a análise de grandes sequências de imagens obtidas por VMAV, levou-nos a criar um novo software para a detecção de frequências do batimento ciliar. Esta nova ferramenta, à qual chamámos de ‘CiliarMove’, foi validada contra o método convencional de observação directa. Demonstramos que o ‘CiliarMove’ poderá ser utilizada de forma fiável por outros centros clínicos ou de investigação em Portugal ou noutros países, para o auxílio do diagnóstico da DCP. Adicionalmente, identificámos novas variantes genéticas em doentes diagnosticados com DCP, e estabelecemos a correlação com o respectivo fenótipo ciliar. Acreditamos que no futuro, estes dados serão úteis para a criação de novas terapias direccionadas e para o melhoramento do diagnóstico desta doença. Com este trabalho identificámos de forma inequívoca qual a janela de tempo para a quebra de simetria no peixe-zebra, e caracterizámos os regimes de fluxo de fluídos no Organizador necessários para a determinação da lateralidade. Esta nova informação irá redireccionar como é que trabalhos futuros irão abordar o estudo dos eventos de quebra de simetria em peixezebra e possivelmente noutros animais modelo. Por outro lado, apresentamos uma novo grupo disciplinar para o diagnóstico da DCP, que revoluciona a compreensão da fisiopatologia e da abordagem diagnóstica desta doença em Portugal.ABSTRACT: A distinctive and essential characteristic of the vertebrate body is the pronounced asymmetry of the internal organs in relation to the left-right axis. The decision of which organs should be formed on the left or right side is established early during embryo development. This process is initiated in a specialized organ, called the left-right Organizer, also known as node in mammals or Kupffer's Vesicle in fish. At the surface of each cell of this organ there is a moving or immotile cilium, a hair-like structure approximately 5µm long. While the Organizer's motile cilia play a crucial role in generating right-to-left directional fluid flow, immotile cilia are considered potential sensors of this same flow. This event triggers an asymmetric intracellular calcium elevation response on the left side of the Organizer, thus initiating a molecular cascade of gene expression from the Nodal signalling pathway. Dand5, which encodes a Nodal antagonist, is the first gene to be asymmetrically expressed on the right side of the Organizer. As a result, Nodal, a secreted factor from the TGF-β family, becomes active only on the left side of the Organizer. Due to a self-activation mechanism, the asymmetric expression of Nodal is then propagated anteriorly and posteriorly to the left Lateral Plate Mesoderm. This portion of the embryonic tissue will give rise to the heart, blood vessels and red blood cells. In addition to the mesoderm, the ligand Nodal also affects the specification and development process of the endoderm, which in turn will form other visceral organs such as the liver and the pancreas. However, the initial steps of laterality establishment are not yet well understood. The nature of the signal that is produced by the Organizer’s fluid flow is still debated today. Two alternative and non-exclusive theories have been proposed: flow acts as a hydrodynamic force that triggers mechanosensory pathways or, alternatively, flow operates as a vehicle of signaling molecules that are integrated by the cells on the left side. Studies developed on mice and medaka fish have found that the Pkd2-Pkd1l1 protein complex is expressed in the Organizer's cilia and is necessary for the correct establishment of laterality. While Pkd2 is defined as a non-selective cationic calcium channel, Pkd1l1 is considered a mechanosensory transmembrane receptor. In the kidneys, the Pkd2-Pkd1 complex has been shown to have the ability to sense the mechanical stress performed by the urine flow, and to induce intracellular calcium signals, which are involved in the regulation of kidney cell differentiation, growth and apoptosis. Pkd2 and its partner Pkd1l1 were also proposed as the mechano-sensor complex responsible for detecting the flow in the Organizer of mice, medaka and zebrafish and thus, transporting the molecular signalling to the adjacent tissues. Although both proteins function as a complex, it has been demonstrated that the absence of the Pkd2 channel alone is sufficient to inhibit the calcium potentials normally observed on the left side of the Organizer. The interruption of calcium signalling affects the expression of Nodal pathway genes, thus causing laterality defects in the organs, such as situs inversus, which involves the total inversion of organ positioning, and heterotaxia, in which one or several organs have laterality defects. By definition, these aberrant laterality patterns do not always involve the derived organs of the mesoderm (heart) and endodermis (digestive system) simultaneously, indicating that the position of the internal thoracic and abdominal organs can be molecularly decoupled during embryo development. So far, it is unknown how the flow of the Organizer may be regulating both processes. In this context, ciliary dysfunction has also been linked to a list of human pleiotropic diseases, collectively referred as ciliopathies. Among these there is a disease involving cilia motility defects, referred to as primary ciliary dyskinesia (PCD), characterized by recurrent airway infections, sinusitis, bronchiectasis and male and female infertility. Since the flow in the Organizer is disturbed during embryogenesis, approximately 50% of patients with PCD also have laterality defects. In Portugal, until the early 2010s, the diagnosis of this disease was not performed according to the European guidelines and there was a greater risk of an inconclusive or wrong diagnosis for many of these patients. Also, the investment made for the study of this disease was low or inexistence, with no published epidemiological or pathophysiological data available to characterize the incidence of this disease in the Portuguese population. In summary, with this PhD project we focused on providing new data to help understanding the various molecular steps in establishing asymmetry. In parallel, we have documented the creation of a consortium formed by several Portuguese entities that centralize the diagnosis of PCD disease in the Lisbon region, and enable the study and characterization of the phenotypic and genetic variants prevalent in the country. First, we explored the hypothesis that the establishment of left-right asymmetry occurs exclusively through the cationic channel Pkd2 (Chapter 2). One of the advantages of using the zebrafish to answer this question is the ability to genetically manipulate in stages of early development and see the impact of each manipulation on the Organizer's (Kupffer's Vesicle) architecture, ciliary motility, fluid flow pattern and organ positioning, all in the same embryo. Thus, we used genetic tools to suppress the calcium signalling mechanism, by reducing the Pkd2 protein, and abolish fluid flow in the Organizer through knockdown of Dnah7, a ciliary protein that is essential for conferring movement to the cilium. We then compared these two groups at the level of dand5 gene expression and organ lateralization. We show that reduction in Pkd2 protein levels results in a decrease in ciliary length, disarrangements of the Organizer architecture and abnormal flow dynamics. The only approach that did not affect Organizer architecture was by reducing Pkd2 exclusively from the Organizer's precursor cells, however, a decrease in ciliary length and flow velocities were still observed. Nevertheless, all the manipulations performed resulted in similar proportions of dand5 expression and organ laterality defects. Therefore, we concluded that the reduction of Pkd2 leads to left-right defects that cannot be exclusively attributed to its putative role in the mediation of the mechano-sensation because by modifying the cellular architecture or by decreasing the ciliary length, the absence of Pkd2 affects the flow dynamics in the Organizer. Next, we analyzed in detail the steps that precede the establishment of left-right asymmetry. Although all the Organizer's cilia are competent to become motile, only a few acquire this feature. According to results from our group, the decision between motile and immotile is made through a Notch signalling-mediated mechanism. We have observed that although most of the Organizer's cilia are immotile at the beginning, they become motile throughout the development, which consequently impacts on the formation of a directional and progressively stronger flow. Facing these results, we wondered how fast fluid flow would have to be in order to symmetry breaking to happen and at what stage of development this would occur. In order to answer this question, we have implemented a novel strategy that involves the mechanical extraction of the Organizer's liquid at each somatic stage between 3 to 12, which is equivalent to a time interval of 4 hours. This allowed us not only to address the importance of fluid flow throughout all stages of KV development, but also to test the importance of fluid content. We determined that the establishment of laterality takes place between 3 and 6 somite stage, in a time window of 1 and a half hours. During these stages of development, the fluid flow within the Organizer is directional and there is a similar number between motile and immotile cilia. The disruption of directional flow, especially at the anterior region of the Organizer, results in a bilateral expression of dand5 and organ laterality defects. By replacing the liquid in the Organizer with a buffer solution, we have observed that there is no disruption in the laterality determination. Together, these results support the mechanosensory hypothesis rather than the chemosensory hypothesis. Additionally, both heart (derived from the mesoderm) and liver (derived from the endoderm) are equally affected when flow is disturbed between 3 and 6 somite stage, indicating that their uncoupling can only occur in signalling pathways downstream of flow. In Chapter 3, we report a comparative analysis between a group of healthy individuals and a group of patients referred to the Portuguese Primary Ciliary Diskinesia (PCD) diagnostic team. This work is part of a multidisciplinary study involving the implementation of a test panel for the diagnosis and study of Primary Ciliary Dyskinesia, including measurement of nasal nitric oxide, electron microscopy, high-speed videomicroscopy, immunofluorescence and genomic sequence. The aim of this study was to determine the range of frequencies and patterns of ciliary beating in a control group of healthy Portuguese volunteers and in a group of Portuguese patients with PCD. We used high-speed video microscopy analysis (HVMA) to characterize the ciliary function in nasal samples collected from the individuals. The lack of open access computational tools that allow the analysis of large sequences of images obtained by HVMA led us to create a new software capable of detecting of ciliary beat frequencies. This new tool, which we called 'CiliarMove', was validated against the conventional method of direct observation. We have demonstrated that the 'CiliarMove' can be reliably used by other clinical or research centres in Portugal or other countries, to aid the PCD diagnosis. In addition, we have identified new genetic variants in patients diagnosed with PCD and established the respective correlation with their ciliary phenotype. We believe that, in the future, these data will be useful for the creation of new targeted therapies and for the improvement of this disease diagnosis. With this work, we have unequivocally identified the time window for symmetry breakage in zebrafish and characterized the fluid flow regimes in the Organizer necessary for determining laterality. This new information will redirect how future work will address the study of symmetry breaking events in zebrafish and possibly other animal models. On the other hand, we present a new disciplinary group for the diagnosis of PCD, which revolutionizes the understanding of the pathophysiology and diagnostic approach of this disease in Portugal.Lopes, Susana SantosTelley, IvoRUNSampaio, Pedro Rafael Martins de Almeida2022-05-06T00:31:25Z2021-05-062021-06-172021-05-06T00:00:00Zdoctoral thesisinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfapplication/octet-streamhttp://hdl.handle.net/10362/119445TID:101512848enginfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)instname:FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiainstacron:RCAAP2024-05-22T17:53:55Zoai:run.unl.pt:10362/119445Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireinfo@rcaap.ptopendoar:https://opendoar.ac.uk/repository/71602025-05-28T17:25:00.390087Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) - FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiafalse
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Ciências Médicas
topic Embriogénese
Discinesia Ciliar Primária - diagnóstico
Embryogenesis
Primary Ciliary Dyskinesia - diagnosis
Ciências Médicas
description RESUMO:Uma característica distintiva e essencial do corpo dos vertebrados é a pronunciada assimetria dos órgãos internos em relação ao eixo esquerda-direito. A decisão de que órgãos deverão ser formados do lado esquerdo ou do lado direito é estabelecida cedo durante o desenvolvimento do embrião. Este processo é iniciado num órgão especializado, chamado de Organizador esquerda-direita, também conhecido como nó em mamíferos ou vesícula de Kupffer em peixes. À superficie de cada uma das células deste órgão existe um cílio móvel ou imóvel, uma estrutura semelhante a um cabelo com um comprimento aproximado de 5µm. Enquanto que os cílios móveis do Organizador desempenham um papel crucial ao gerarem um fluxo de fluído direccional da direita para a esquerda, os cílios imóveis são considerados como potenciais sensores deste mesmo fluxo. Este evento desencadea uma resposta assimétrica de elevação de cálcio intracelular do lado esquerdo do Organizador, iniciando assim uma cascata molecular de expressão de genes da via de sinalização Nodal. Dand5, que codifica um antagonista do Nodal, é o primeiro gene a ser assimetricamente expresso, no lado direito da região do Organizador. Como resultado, o Nodal, um factor secretado da família TGF-β, torna-se activo apenas do lado esquerdo do Organizador. Devido a um mecanismo de auto-activação, a expressão assimétrica de Nodal é depois propagada anterior e posteriormente para a mesoderme lateral esquerda. Esta porção do tecido embrionário irá dar origem ao coração, vasos sanguíneos e glóbulos vermelhos. Adicionalmente, à mesoderme, o ligando Nodal também afecta o processo de especificação e desenvolvimento da endoderme, que por sua vez vai formar outros órgãos viscerais como o fígado ou o pâncreas. No entanto, os passos iniciais do estabelecimento da lateralidade ainda não são bem entendidos. A natureza do sinal que é produzido pelo fluxo de fluídos no Organizador é ainda hoje debatida. Duas teorias alternativas e não exclusivas foram propostas: o fluxo actua como força hidrodinâmica que desencadeia vias mecano-sensoriais ou, alternativamente, o fluxo como veículo de moléculas sinalizadoras que são integradas pelas células do lado esquerdo. Estudos realizados em ratinho e no peixe medaka descobriram que o complexo proteíco Pkd1l1-Pkd2 é expresso nos cílios do Organizador e é necessário para o correcto estabelecimento da lateralidade. Enquanto que a Pkd2 designa um canal catiónico nãoselectivo de cálcio, a Pkd1l1 é considerada como um receptor transmembranar mecanosensorial. Nos rins, o complexo Pkd2-Pkd1 demonstrou ter a capacidade de sentir o stress mecânico realizado pelo fluxo de urina, e de induzir sinais intracelulares de cálcio, que juntos estão envolvidos na regulação da diferenciação, crescimento e apoptose das células renais. Pkd2 e o seu parceiro Pkd1l1 também foram propostos como o complexo mecanosensor responsável pela detecção do fluxo no Organizador do ratinho, medaka e peixe-zebra e, deste modo, pelo transporte da sinalização molecular para os tecidos adjacentes. Apesar de ambos funcionarem como um complexo, foi demonstrado que a ausência do canal Pkd2 por si só é suficiente para inibir os potenciais de cálcio normalmente observados do lado esquerdo do Organizador. A interrupção da sinalização por cálcio afecta a expressão de genes da via Nodal, causando assim defeitos de lateralidade nos órgãos, tais como situs inversus que envolve a inversão total do posicionamento dos órgãos , e heterotaxia, onde um ou vários órgãos apresentam defeitos de lateralidade. Por definição estes padrões aberrantes de lateralidade, nem sempre envolvem os órgãos derivativos da mesoderme (coração) e da endoderme (sistema digestivo) simultaneamente, indicando que a posição dos órgãos internos torácicos e abdominais pode ser desacoplada molecularmente durante o desenvolvimento do embrião. Até agora, desconhece-se como o fluxo do Organizador pode estar a regular ambos os processos. Neste contexto, a disfunção ciliar tem também sido ligada a uma lista de doenças pleiotrópicas em humanos, referidas colectivamente como ciliopatias. Entre estas existe uma doença que envolve defeitos de motilidade ciliar, referida como discinesia ciliar primária (DCP), caracterizada por infecções recorrentes das vias respiratórias, sinusite, bronquiectasias e infertilidade masculina e feminina. Uma vez que o fluxo no Organizador é perturbado durante a embriogénese, aproximadamente 50% dos pacientes com DCP também apresentam defeitos de lateralidade. Em Portugal, até ao início da década de 2010, o diagnóstico desta doença não era realizado segundo as normas europeias, havendo grande risco de um diagnóstico inconclusivo ou errado para muitos destes doentes. De igual modo, o investimento feito para o estudo desta doença foi nulo ou muito reduzido, não havendo dados epidimiológicos ou patofisiológicos publicados que permitissem caracterizar a incidência desta doença na população portuguesa. Sumariamente, com este projecto de doutoramento focámo-nos em fornecer novos dados que ajudem à compreensão dos vários passos moleculares no estabelecimento de assimetria. Paralelalmente, documentamos a criação de um consórcio de várias entidades portuguesas que centralizam o diagnóstico da doença DCP na região de Lisboa, e possibilitam o estudo e caracterização das variantes fenotipicas e genéticas prevalentes no país. Primeiro explorámos a hipótese de que o estabelecimento de assimetria esquerda-direita ocorre exclusivamente através do canal catiónico Pkd2 (Capítulo 2). Uma das vantagens de usar o peixe-zebra para responder a esta pergunta é a capacidade de o manipular geneticamente em estadios de desenvolvimento precoce e ver o impacto de cada manipulação na arquitectura do Organizador (Vesícula de Kupffer), motilidade ciliar, padrão de fluxo de fluídos e posicionamento dos órgãos, tudo no mesmo embrião. Desse modo, utilizámos ferramentas genéticas para reprimir o mecanismo de sinalização de cálcio por redução da proteína Pkd2, e abolir o fluxo de fluídos no Organizador através do knockdown da Dnah7, uma proteína ciliar crucial para conferir movimento ao cílio. Em seguida, comparámos estes dois grupos ao nível da expressão génica de dand5 e lateralização dos órgãos. Os nossos resultados demonstram que a redução dos níveis da proteína Pkd2 resulta numa diminuição do comprimento ciliar, desarranjos da arquitectura do Organizador e dinâmica de fluxo anormal. A única abordagem que não afectou a arquitetura do Organizador foi quando reduzimos a Pkd2 exclusivamente das células precursoras do Organizador, no entanto, mesmo assim, foi observado um decréscimo do comprimento ciliar e velocidades de fluxo. Contudo, todas as manipulações realizadas resultaram em proporções semelhantes de defeitos de expressão de dand5 e da lateralidade dos órgãos. Assim, concluímos que a redução de Pkd2 conduz a defeitos esquerda-direita que não podem ser atribuídos exclusivamente ao seu papel putativo na mediação da mecanosensação porque ao modificar a arquitectura celular ou ao diminuir o comprimento ciliar, a ausência de Pkd2 afecta a dinâmica do fluxo no Organizador. De seguida analisámos em detalhe os passos que antecedem o estabelecimento de assimetria esquerda-direita. Apesar de todos os cílios do Organizador apresentarem competência para se tornarem móveis, apenas alguns adquirem esta funcionalidade. De acordo com resultados do nosso grupo, a decisão de móvel contra imóvel acontece através de um mecanismo mediado via sinalização Notch. Assim, observámos que apesar de a maioria dos cílios do Organizador se encontrar imóvel no seu início, estes tornam-se móveis ao longo do desenvolvimento, que consequentemente impacta na formação de um fluxo direccional e progressivamente mais forte. À luz destes resultados perguntámo-nos de qual terá de ser a força do fluxo para que a quebra da simetria inicie e em que estágio de desenvolvimento isto acontece. A fim de responder esta questão, implementámos uma estratégia inovadora que envolve a extracção mecânica do líquido do Organizador em cada fase somítica compreendida entre 3 e 12 sómitos, que equivale a um intervalo de tempo de 4 horas. Isto permitiu-nos não só abordar a importância do fluxo de fluídos ao longo de todas as fases de desenvolvimento do KV, mas também testar a importância do conteúdo do fluido. Assim, determinámos que o estabelecimento da lateralidade acontece entre os 3 e os 6 sómitos, numa janela de tempo de 1 hora e meia. Durante esses estágios de desenvolvimento o fluxo de líquido dentro do Organizador é direccional e existe um número semelhante entre cílios móveis e imóveis. A perturbação do fluxo direccional, principalmente na região anterior do Organizador, resulta numa expressão bilateral de dand5 e defeitos de lateralidade dos órgãos. Ao substituirmos o líquido presente no Organizador por uma solução tampão, observámos que não existe perturbação na determinação de lateralidade. Em conjunto, este resultados apoiam a hipótese mecano-sensora em detrimento da hipótese quemo-sensora. Adicionalmente, tanto o coração (derivado da mesoderme) como o fígado (derivado da endoderme) são igualmente afectados quando o fluxo é perturbado entre os 3 e os 6 sómitos, indicando que a sua dissociação só poderá ocorrer em fases de sinalização posteriores ao fluxo do Organizador. No Capítulo 3 relatamos uma análise comparativa entre um grupo de indivíduos saudáveis e um grupo de pacientes referidos para equipa portuguesa de diagnóstico da Discinésia Ciliar Primária (DCP). Este trabalho está integrado num estudo multidisciplinar que involve a implementação de um painel de testes para o diagnóstico e estudo da Discinésia Ciliar Primária, nomeadamente a medição do óxido nítrico nasal, microscopia electrónica, videomicroscopia de alta-velocidade, imunofluorescência e sequência genómica. O objectivo deste estudo foi determinar a gama de frequências e padrões de batimento ciliar num grupo controlo de voluntários saudáveis portugueses e num grupo de doentes portugueses com DCP. Nesse sentido, utilizámos a análise de vídeo-microscopia de alta velocidade (VMAV) para a caracterização do batimento ciliar em amostrais nasais colhidas dos indivíduos. A falta de ferramentas computacionais de livre acesso que permitissem a análise de grandes sequências de imagens obtidas por VMAV, levou-nos a criar um novo software para a detecção de frequências do batimento ciliar. Esta nova ferramenta, à qual chamámos de ‘CiliarMove’, foi validada contra o método convencional de observação directa. Demonstramos que o ‘CiliarMove’ poderá ser utilizada de forma fiável por outros centros clínicos ou de investigação em Portugal ou noutros países, para o auxílio do diagnóstico da DCP. Adicionalmente, identificámos novas variantes genéticas em doentes diagnosticados com DCP, e estabelecemos a correlação com o respectivo fenótipo ciliar. Acreditamos que no futuro, estes dados serão úteis para a criação de novas terapias direccionadas e para o melhoramento do diagnóstico desta doença. Com este trabalho identificámos de forma inequívoca qual a janela de tempo para a quebra de simetria no peixe-zebra, e caracterizámos os regimes de fluxo de fluídos no Organizador necessários para a determinação da lateralidade. Esta nova informação irá redireccionar como é que trabalhos futuros irão abordar o estudo dos eventos de quebra de simetria em peixezebra e possivelmente noutros animais modelo. Por outro lado, apresentamos uma novo grupo disciplinar para o diagnóstico da DCP, que revoluciona a compreensão da fisiopatologia e da abordagem diagnóstica desta doença em Portugal.
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