PCR-RFLP e genotipagem de echinococcus granulosus
Main Author: | |
---|---|
Publication Date: | 2009 |
Other Authors: | , , |
Language: | por |
Source: | Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) |
Download full: | http://hdl.handle.net/10400.11/636 |
Summary: | A hidatidose é uma zoonose, causada pelo helminta Echinococcus granulosus, presente de um modo geral, em todo o globo terrestre tendo na região mediterrânica uma elevada importância. Estão descritos, para esta espécie, 10 genótipos (G1 a G10) em saúde pública ligados a diferentes hospedeiros intermediários. Das técnicas de biologia molecular utilizadas para a genotipagem do E. granulosus, umas mostraram-se mais específicas e sensíveis que outras. Assim, neste estudo, pretende-se avaliar a PCR-RFLP na genotipagem de amostras de E. granulosus provenientes de Portugal. MATERIAL E MÉTODOS Foram obtidos 30 quistos hidáticos de ovinos e bovinos parasitados com E. granulosus e procedeu-se à extracção da areia hidática contida nos quistos. Foi extraído o DNA do parasita a partir da areia hidática e amplificada a região ITS-1 com três pares de “primers” diferentes (Eg16-PCR, Eg9-PCR e ITS-1-PCR). Foram aplicadas enzimas de restrição (Alu I, Cfo I, Msp I e Rsa I) a estes produtos de amplificação, os quais foram visualizados em electroforese em gel de agarose a 2,5%. Foi ainda amplificado o gene citocromo oxidase sub-unidade I (COI) e sequenciado. As sequências obtidas foram comparadas com algumas existentes no GenBank. RESULTADOS Foram obtidos produtos de amplificação para as reacções Eg16-PCR, Eg9-PCR e ITS-1-PCR. A eficiência de reacção foi de 100% para as primeiras duas PCR e cerca de 60% para a ITS-1-PCR. Foram obtidos diferentes padrões de corte, no produto amplificado, consoante a enzima usada. CONCLUSÕES Foram encontradas algumas divergências no padrão de corte com a mesma enzima, tendo sido essas amostras amplificadas para o gene COI e sequenciadas para determinar o genótipo em questão. Verificou-se, em todas as amostras que suscitaram dúvidas com a aplicação das enzimas de restrição, que se estava perante o genótipo G1. Assim, podemos concluir que para a genotipagem da espécie E. granulosus é necessário associar à técnica PCR-RFLP uma técnica mais específica, o que está de acordo com o mencionado por Villalobos et al. (2007) e Manterola et al. (2008) |
id |
RCAP_c18f905b54260a5d9014bbca57062dbc |
---|---|
oai_identifier_str |
oai:repositorio.ipcb.pt:10400.11/636 |
network_acronym_str |
RCAP |
network_name_str |
Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) |
repository_id_str |
https://opendoar.ac.uk/repository/7160 |
spelling |
PCR-RFLP e genotipagem de echinococcus granulosusPCR-RFLPEchinococcusGenotipagemPortugalEstirpe G1A hidatidose é uma zoonose, causada pelo helminta Echinococcus granulosus, presente de um modo geral, em todo o globo terrestre tendo na região mediterrânica uma elevada importância. Estão descritos, para esta espécie, 10 genótipos (G1 a G10) em saúde pública ligados a diferentes hospedeiros intermediários. Das técnicas de biologia molecular utilizadas para a genotipagem do E. granulosus, umas mostraram-se mais específicas e sensíveis que outras. Assim, neste estudo, pretende-se avaliar a PCR-RFLP na genotipagem de amostras de E. granulosus provenientes de Portugal. MATERIAL E MÉTODOS Foram obtidos 30 quistos hidáticos de ovinos e bovinos parasitados com E. granulosus e procedeu-se à extracção da areia hidática contida nos quistos. Foi extraído o DNA do parasita a partir da areia hidática e amplificada a região ITS-1 com três pares de “primers” diferentes (Eg16-PCR, Eg9-PCR e ITS-1-PCR). Foram aplicadas enzimas de restrição (Alu I, Cfo I, Msp I e Rsa I) a estes produtos de amplificação, os quais foram visualizados em electroforese em gel de agarose a 2,5%. Foi ainda amplificado o gene citocromo oxidase sub-unidade I (COI) e sequenciado. As sequências obtidas foram comparadas com algumas existentes no GenBank. RESULTADOS Foram obtidos produtos de amplificação para as reacções Eg16-PCR, Eg9-PCR e ITS-1-PCR. A eficiência de reacção foi de 100% para as primeiras duas PCR e cerca de 60% para a ITS-1-PCR. Foram obtidos diferentes padrões de corte, no produto amplificado, consoante a enzima usada. CONCLUSÕES Foram encontradas algumas divergências no padrão de corte com a mesma enzima, tendo sido essas amostras amplificadas para o gene COI e sequenciadas para determinar o genótipo em questão. Verificou-se, em todas as amostras que suscitaram dúvidas com a aplicação das enzimas de restrição, que se estava perante o genótipo G1. Assim, podemos concluir que para a genotipagem da espécie E. granulosus é necessário associar à técnica PCR-RFLP uma técnica mais específica, o que está de acordo com o mencionado por Villalobos et al. (2007) e Manterola et al. (2008)Repositório Científico do Instituto Politécnico de Castelo BrancoBeato, SílviaCalado, ManuelaClemente, IsabelGrácio, Maria Amélia2011-05-13T14:23:36Z20092009-01-01T00:00:00Zconference objectinfo:eu-repo/semantics/publishedVersionapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10400.11/636porinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)instname:FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiainstacron:RCAAP2025-02-26T14:06:07Zoai:repositorio.ipcb.pt:10400.11/636Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireinfo@rcaap.ptopendoar:https://opendoar.ac.uk/repository/71602025-05-28T21:22:04.916167Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) - FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiafalse |
dc.title.none.fl_str_mv |
PCR-RFLP e genotipagem de echinococcus granulosus |
title |
PCR-RFLP e genotipagem de echinococcus granulosus |
spellingShingle |
PCR-RFLP e genotipagem de echinococcus granulosus Beato, Sílvia PCR-RFLP Echinococcus Genotipagem Portugal Estirpe G1 |
title_short |
PCR-RFLP e genotipagem de echinococcus granulosus |
title_full |
PCR-RFLP e genotipagem de echinococcus granulosus |
title_fullStr |
PCR-RFLP e genotipagem de echinococcus granulosus |
title_full_unstemmed |
PCR-RFLP e genotipagem de echinococcus granulosus |
title_sort |
PCR-RFLP e genotipagem de echinococcus granulosus |
author |
Beato, Sílvia |
author_facet |
Beato, Sílvia Calado, Manuela Clemente, Isabel Grácio, Maria Amélia |
author_role |
author |
author2 |
Calado, Manuela Clemente, Isabel Grácio, Maria Amélia |
author2_role |
author author author |
dc.contributor.none.fl_str_mv |
Repositório Científico do Instituto Politécnico de Castelo Branco |
dc.contributor.author.fl_str_mv |
Beato, Sílvia Calado, Manuela Clemente, Isabel Grácio, Maria Amélia |
dc.subject.por.fl_str_mv |
PCR-RFLP Echinococcus Genotipagem Portugal Estirpe G1 |
topic |
PCR-RFLP Echinococcus Genotipagem Portugal Estirpe G1 |
description |
A hidatidose é uma zoonose, causada pelo helminta Echinococcus granulosus, presente de um modo geral, em todo o globo terrestre tendo na região mediterrânica uma elevada importância. Estão descritos, para esta espécie, 10 genótipos (G1 a G10) em saúde pública ligados a diferentes hospedeiros intermediários. Das técnicas de biologia molecular utilizadas para a genotipagem do E. granulosus, umas mostraram-se mais específicas e sensíveis que outras. Assim, neste estudo, pretende-se avaliar a PCR-RFLP na genotipagem de amostras de E. granulosus provenientes de Portugal. MATERIAL E MÉTODOS Foram obtidos 30 quistos hidáticos de ovinos e bovinos parasitados com E. granulosus e procedeu-se à extracção da areia hidática contida nos quistos. Foi extraído o DNA do parasita a partir da areia hidática e amplificada a região ITS-1 com três pares de “primers” diferentes (Eg16-PCR, Eg9-PCR e ITS-1-PCR). Foram aplicadas enzimas de restrição (Alu I, Cfo I, Msp I e Rsa I) a estes produtos de amplificação, os quais foram visualizados em electroforese em gel de agarose a 2,5%. Foi ainda amplificado o gene citocromo oxidase sub-unidade I (COI) e sequenciado. As sequências obtidas foram comparadas com algumas existentes no GenBank. RESULTADOS Foram obtidos produtos de amplificação para as reacções Eg16-PCR, Eg9-PCR e ITS-1-PCR. A eficiência de reacção foi de 100% para as primeiras duas PCR e cerca de 60% para a ITS-1-PCR. Foram obtidos diferentes padrões de corte, no produto amplificado, consoante a enzima usada. CONCLUSÕES Foram encontradas algumas divergências no padrão de corte com a mesma enzima, tendo sido essas amostras amplificadas para o gene COI e sequenciadas para determinar o genótipo em questão. Verificou-se, em todas as amostras que suscitaram dúvidas com a aplicação das enzimas de restrição, que se estava perante o genótipo G1. Assim, podemos concluir que para a genotipagem da espécie E. granulosus é necessário associar à técnica PCR-RFLP uma técnica mais específica, o que está de acordo com o mencionado por Villalobos et al. (2007) e Manterola et al. (2008) |
publishDate |
2009 |
dc.date.none.fl_str_mv |
2009 2009-01-01T00:00:00Z 2011-05-13T14:23:36Z |
dc.type.driver.fl_str_mv |
conference object |
dc.type.status.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/publishedVersion |
status_str |
publishedVersion |
dc.identifier.uri.fl_str_mv |
http://hdl.handle.net/10400.11/636 |
url |
http://hdl.handle.net/10400.11/636 |
dc.language.iso.fl_str_mv |
por |
language |
por |
dc.rights.driver.fl_str_mv |
info:eu-repo/semantics/openAccess |
eu_rights_str_mv |
openAccess |
dc.format.none.fl_str_mv |
application/pdf |
dc.source.none.fl_str_mv |
reponame:Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) instname:FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia instacron:RCAAP |
instname_str |
FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
instacron_str |
RCAAP |
institution |
RCAAP |
reponame_str |
Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) |
collection |
Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) |
repository.name.fl_str_mv |
Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) - FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia |
repository.mail.fl_str_mv |
info@rcaap.pt |
_version_ |
1833599246245298176 |