Utilização de Danio rerio como modelo para a estimativa do intervalo post morten com base no estado de metilação

Bibliographic Details
Main Author: Pina, Rita Sabino Abrantes de
Publication Date: 2018
Format: Master thesis
Language: por
Source: Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
Download full: http://hdl.handle.net/10773/25408
Summary: O intervalo post mortem (IPM) descreve o período de tempo decorrido desde a morte até ao exame do cadáver. Uma estimativa precisa do IPM tem um grande impacto numa investigação criminal, no entanto, é uma tarefa bastante complexa, dada a influência de fatores intrínsecos e extrínsecos. Existem diversos métodos para a determinação de parâmetro, sendo eles baseados na anatomia patológica, bioquímica e entomologia. Uma vez que estas metodologias possuem baixa precisão e inúmeras limitações práticas, surgem os métodos genético-moleculares, baseados no estado de degradação dos ácidos nucleicos. A metilação do ADN é uma modificação epigenética estável e que varia ao longo do tempo, tornando-se útil para o desenvolvimento de um método de determinação do IPM. Foram analisados os níveis de metilação de um organismo modelo – peixe-zebra – ao longo do tempo decorrido desde a morte, no sentido de criar um modelo robusto para a estimativa do IPM. Neste estudo avaliou-se a variação ocorrida nos níveis de metilação global e na região promotora do gene EDARADD durante 6 intervalos post mortem (0h, 1h, 4h, 24h, 48h e 72h). Diversos parâmetros foram otimizados entre os quais a amostragem, extração e amplificação de ADN genómico de peixe-zebra. Na análise da metilação global, observou-se um aumento dos níveis nos intervalos post mortem iniciais, seguido de uma diminuição abrupta até às 48h post mortem. Foi possível diferenciar as amostras consoante o IPM a que pertenciam através da amplificação por q-PCR da região promotora do gene EDARADD seguida de análise HRM.
id RCAP_5df31d2b795b6d2510ea53ccf2ebe02c
oai_identifier_str oai:ria.ua.pt:10773/25408
network_acronym_str RCAP
network_name_str Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
repository_id_str https://opendoar.ac.uk/repository/7160
spelling Utilização de Danio rerio como modelo para a estimativa do intervalo post morten com base no estado de metilaçãoIntervalo post mortem (IPM)EpigenéticaMetilação do ADNPeixe-zebraq-PCRHigh Resolution Melting (HRM)Genética ForenseO intervalo post mortem (IPM) descreve o período de tempo decorrido desde a morte até ao exame do cadáver. Uma estimativa precisa do IPM tem um grande impacto numa investigação criminal, no entanto, é uma tarefa bastante complexa, dada a influência de fatores intrínsecos e extrínsecos. Existem diversos métodos para a determinação de parâmetro, sendo eles baseados na anatomia patológica, bioquímica e entomologia. Uma vez que estas metodologias possuem baixa precisão e inúmeras limitações práticas, surgem os métodos genético-moleculares, baseados no estado de degradação dos ácidos nucleicos. A metilação do ADN é uma modificação epigenética estável e que varia ao longo do tempo, tornando-se útil para o desenvolvimento de um método de determinação do IPM. Foram analisados os níveis de metilação de um organismo modelo – peixe-zebra – ao longo do tempo decorrido desde a morte, no sentido de criar um modelo robusto para a estimativa do IPM. Neste estudo avaliou-se a variação ocorrida nos níveis de metilação global e na região promotora do gene EDARADD durante 6 intervalos post mortem (0h, 1h, 4h, 24h, 48h e 72h). Diversos parâmetros foram otimizados entre os quais a amostragem, extração e amplificação de ADN genómico de peixe-zebra. Na análise da metilação global, observou-se um aumento dos níveis nos intervalos post mortem iniciais, seguido de uma diminuição abrupta até às 48h post mortem. Foi possível diferenciar as amostras consoante o IPM a que pertenciam através da amplificação por q-PCR da região promotora do gene EDARADD seguida de análise HRM.The post mortem interval (PMI) describes the period of time elapsed from the time of death. A precise estimation of PMI has a strong impact in a crime investigation; however it is a complex task due to the influence of intrinsic and extrinsic factors. There are several methods for PMI determination including pathological, biochemical and entomological. Those methodologies have low precision and several practical limitations leading to emergence of genetic-molecular methods based on the degradation of nucleic acids. DNA methylation is a stable and time-varying epigenetic modification, making it useful for the development of a method to determining PMI. Thus, the methylation levels of a model organism – zebrafish – were analysed during the time since death, in order to create a robust model for the PMI estimation. In this study, we evaluated the variation in global methylation levels and at the promoter region of EDARADD gene during 6 post mortem intervals (0h, 1h, 4h, 24h, 48h e 72h). We performed an optimization of several parameters such us sampling, extraction and amplification of zebrafish genomic DNA. An increase of global methylation levels in the initial post-mortem intervals was observed, followed by an abrupt decrease until 48h post-mortem. Following of the amplification of EDARADD’s promoter region by q-PCR and HRM analysis, it was possible to differentiate the samples according to relative PMI.2019-12-20T00:00:00Z2018-12-18T00:00:00Z2018-12-18info:eu-repo/semantics/publishedVersioninfo:eu-repo/semantics/masterThesisapplication/pdfhttp://hdl.handle.net/10773/25408TID:202233014porPina, Rita Sabino Abrantes deinfo:eu-repo/semantics/openAccessreponame:Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)instname:FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiainstacron:RCAAP2024-05-06T04:19:17Zoai:ria.ua.pt:10773/25408Portal AgregadorONGhttps://www.rcaap.pt/oai/openaireinfo@rcaap.ptopendoar:https://opendoar.ac.uk/repository/71602025-05-28T14:04:23.884853Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) - FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologiafalse
dc.title.none.fl_str_mv Utilização de Danio rerio como modelo para a estimativa do intervalo post morten com base no estado de metilação
title Utilização de Danio rerio como modelo para a estimativa do intervalo post morten com base no estado de metilação
spellingShingle Utilização de Danio rerio como modelo para a estimativa do intervalo post morten com base no estado de metilação
Pina, Rita Sabino Abrantes de
Intervalo post mortem (IPM)
Epigenética
Metilação do ADN
Peixe-zebra
q-PCR
High Resolution Melting (HRM)
Genética Forense
title_short Utilização de Danio rerio como modelo para a estimativa do intervalo post morten com base no estado de metilação
title_full Utilização de Danio rerio como modelo para a estimativa do intervalo post morten com base no estado de metilação
title_fullStr Utilização de Danio rerio como modelo para a estimativa do intervalo post morten com base no estado de metilação
title_full_unstemmed Utilização de Danio rerio como modelo para a estimativa do intervalo post morten com base no estado de metilação
title_sort Utilização de Danio rerio como modelo para a estimativa do intervalo post morten com base no estado de metilação
author Pina, Rita Sabino Abrantes de
author_facet Pina, Rita Sabino Abrantes de
author_role author
dc.contributor.author.fl_str_mv Pina, Rita Sabino Abrantes de
dc.subject.por.fl_str_mv Intervalo post mortem (IPM)
Epigenética
Metilação do ADN
Peixe-zebra
q-PCR
High Resolution Melting (HRM)
Genética Forense
topic Intervalo post mortem (IPM)
Epigenética
Metilação do ADN
Peixe-zebra
q-PCR
High Resolution Melting (HRM)
Genética Forense
description O intervalo post mortem (IPM) descreve o período de tempo decorrido desde a morte até ao exame do cadáver. Uma estimativa precisa do IPM tem um grande impacto numa investigação criminal, no entanto, é uma tarefa bastante complexa, dada a influência de fatores intrínsecos e extrínsecos. Existem diversos métodos para a determinação de parâmetro, sendo eles baseados na anatomia patológica, bioquímica e entomologia. Uma vez que estas metodologias possuem baixa precisão e inúmeras limitações práticas, surgem os métodos genético-moleculares, baseados no estado de degradação dos ácidos nucleicos. A metilação do ADN é uma modificação epigenética estável e que varia ao longo do tempo, tornando-se útil para o desenvolvimento de um método de determinação do IPM. Foram analisados os níveis de metilação de um organismo modelo – peixe-zebra – ao longo do tempo decorrido desde a morte, no sentido de criar um modelo robusto para a estimativa do IPM. Neste estudo avaliou-se a variação ocorrida nos níveis de metilação global e na região promotora do gene EDARADD durante 6 intervalos post mortem (0h, 1h, 4h, 24h, 48h e 72h). Diversos parâmetros foram otimizados entre os quais a amostragem, extração e amplificação de ADN genómico de peixe-zebra. Na análise da metilação global, observou-se um aumento dos níveis nos intervalos post mortem iniciais, seguido de uma diminuição abrupta até às 48h post mortem. Foi possível diferenciar as amostras consoante o IPM a que pertenciam através da amplificação por q-PCR da região promotora do gene EDARADD seguida de análise HRM.
publishDate 2018
dc.date.none.fl_str_mv 2018-12-18T00:00:00Z
2018-12-18
2019-12-20T00:00:00Z
dc.type.status.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/masterThesis
format masterThesis
status_str publishedVersion
dc.identifier.uri.fl_str_mv http://hdl.handle.net/10773/25408
TID:202233014
url http://hdl.handle.net/10773/25408
identifier_str_mv TID:202233014
dc.language.iso.fl_str_mv por
language por
dc.rights.driver.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
eu_rights_str_mv openAccess
dc.format.none.fl_str_mv application/pdf
dc.source.none.fl_str_mv reponame:Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
instname:FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia
instacron:RCAAP
instname_str FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia
instacron_str RCAAP
institution RCAAP
reponame_str Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
collection Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP)
repository.name.fl_str_mv Repositórios Científicos de Acesso Aberto de Portugal (RCAAP) - FCCN, serviços digitais da FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia
repository.mail.fl_str_mv info@rcaap.pt
_version_ 1833594266292584448