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“... com ferramentas como Hisat2, Samtools, R, AgriGO e Blast2GO. Em concordância com outros estudos publicados...”
Análise da expressão diferencial de Glycine max sob condição de infestação com Piezodorus guildinii
Dissertação
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“... microssatélites LEI0161 e ADL0371 (33,595,706-42,632,651 pb). O programa SAMtools foi utilizado na identificação...”
Identificação de polimorfismos em região do cromossomo 3 da galinha associado ao desempenho de deposição de gordura
Dissertação
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“.... , Foram identificados 722.832 SNPs e 63.727 INDELs para os 18 animais por meio do programa SAMtools, e após...”
Identificação de polimorfismos em região do cromossomo 2 da galinha associado a deposição de músculo
Dissertação
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“... E. guineensis genome using BWA software. The SAMtools software package was used to identify SNPs. The gene...”
Caracterização de sítios polimórficos e sequências repetitivas, e estabelecimento de coleção nuclear de caiaué [Elaeis oleifera (Kunth) Cortés]
Dissertação
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“..., SAMTools e BEDTools. Em seguida, avaliou-se a variação gênica utilizando a medida de entropia sendo...”
Ferramenta e análise de BIG data aplicadas a leishmaniose tegumentar: aspectos clínicos e genômicos
Tese
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“..., and the consensus sequences were obtained with SAMtools mpileup option. The transposable elements were...”
Caracterização da região Bru1 no genoma da cultivar RB867515 (Saccharum spp.) utilizando sequenciamento de nova geração
Dissertação
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“... performed with FasQc and Trimmomatic. We assembled the reads using dipSPAdes and used blastn and Samtools...”
Sequenciamento e caracterização parcial do genoma de cagaiteira (Eugenia dysenterica DC.)
Dissertação
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“... performed using the SAMtools software. The identification of the sugarcane clones was done by calculating...”
Avaliação da tecnologia Oxford Nanopore para análise de identidade genética de clones de cana-de-açúcar (Saccharum spp.)
Dissertação