Novas matrizes moleculares para o desenvolvimento de antibióticos a partir da resistência exibida por Actinobactérias

• Ano de defesa: 2023
• Autor(a) principal: Oliveira, Raul Vítor Ferreira de
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
• Palavras-chave em Português: Antibiotic resistance; Genome mining; Mineração Genômica; Natural products; Produtos Naturais; Resistência a antibióticos
• Link de acesso: https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-19092023-153712/

A resistência aos antibióticos é um problema mundial que provocou em 2019 cerca de 1,27 milhões de mortes, mais do que a AIDS ou a malária. Apesar dessa ameaça a saúde global a adoção de novos antibióticos na clínica permanece estagnada desde o fim da Era de Ouro dos Antibióticos no final dos anos 70. Considerando essa crescente ameaça, torna-se urgente a descoberta de novas moléculas bioativas para tratar o número crescente de infecções por bactérias multirresistentes. Para isso pesquisas se voltam novamente para o estudo do metabolismo secundário de bactérias, especialmente as do filo Actinobactéria. O acesso a novas técnicas de sequenciamento e ferramentas de análise genômica, contribui bastante para acelerar a descoberta de novas moléculas a partir da informação genômica contida no DNA das bactérias. O presente trabalho buscou explorar a vasta riqueza da biodiversidade do ambiente marinho do litoral brasileiro para triar organismos com novos grupamentos de genes biossintéticos, capazes de produzir antibióticos de interesse clinico das classes dos glicopeptídeos e ansamicinas. Para tal foram utilizadas duas estratégias para triagem: a resistência do produtor a classe de antibiótico buscada e a verificação de atividade antimicrobiana contra patógenos clinicamente relevantes. Foram triadas 650 bactérias cultivadas em meio ISP2 com a adição dos antibióticos vancomicina (10&#956g/ml), teicoplanina (10&#956g/ml) e rifampicina (40&#956g/ml). Após essa etapa buscou-se identificar a presença dos genes fundamentais de biossíntese e resistência para esses antibióticos nas bactérias resistentes. Foram obtidas amplificações positivas para as cepas BRB014, BRB040 e BRB042 para o gene rifK, central para biossíntese de ansamicinas. Juntamente com os resultados de atividade antimicrobiana optou-se por sequenciar o genoma de BRB040. A partir da análise dos dados genômicos de BRB 040 foram encontradas evidências de que dois agrupamentos de genes de biossíntese ainda não descritos e candidatos a serem produtores de novas moléculas antimicrobianas.