Avaliação da expressão de genes da via de Weimberg sobre o catabolismo de xilose na linhagem produtora de PHAMCL Pseudomonas sp. LFM046.

• Ano de defesa: 2017
• Autor(a) principal: Sarmiento, Juan Camilo Roncallo
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
• Palavras-chave em Português: Pseudomonas sp.; Análise de balanço de fluxos; Catabolismo de xilose; Engenharia metabólica; Flux balance analysis; LFM046; Metabolic engineering; Via de Weimberg; Weinberg pathway; Xylose catabolism
• Link de acesso: http://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/42/42132/tde-10052017-163350/

Polihidroxialcanoatos (PHA) são polímeros biodegradáveis, biocompatíveis e podem ser produzidos a partir de matérias primas renováveis. Pseudomonas sp. é capaz de produzir PHA com composição monomérica variada e com teor controlável, o que confere grande variedade de aplicações. Flux Balance Analysis (FBA) foi utilizado no ambiente Matlab pelo uso do software COBRA. Para a análise foi necessário construir um core de Pseudomonas pela modificação dum core de E. coli, e assim fosse possível obter um modelo mais aproximado. Como resultado foi gerada uma rede metabólica viável contendo os genes da via de Weimberg de C. crescentus no core construído. Paralelamente, a Pseudomonas sp. LFM046 foi repicada sucessivas vezes em meio mineral (MM). Testes simples foram feitos para verificar o perfil das colônias isoladas, além de amplificar e sequenciar o gene 16S rDNA. O resultado do BLAST foi uma identidade de 99% com o gene da Pseudomonas sp. IPT 046, confirmando que a bactéria pertence a género Pseudomonas e tem a capacidade de consumir xilose.