Genômica comparativa de tripanossomatídeos portadores de endossimbiontes e sua implicação no genoma de Angomonas ambiguus

• Ano de defesa: 2018
• Autor(a) principal: Morais, Anderson Carvalho
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
• Palavras-chave em Português: Genomas; Genômica
• Link de acesso: https://teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-20230725-114614/

Genômica comparativa de tripanossomatídeos portadores de endossimbiontes e sua implicação no genoma de Angomonas ambiguus', 'Tripanossomatídeos hospedeiros de endossimbiontes (SHT) possuem características únicas, em aspectos morfológicos, bioquímicos e moleculares, quando comparados a tripanossomatídeos regulares. Dentre as sete espécies conhecidas atualmente, só Angomonas ambiguus (Filo Euglenozoa; Família Trypanosomatidae) parece apresentar uma incongruência evolutiva entre os genomas do hospedeiro (núcleo) e seu endossimbionte (TPE), uma BETA-proteobactéria. Para entender esta incoerência, dentre outros aspectos genômicos e evolutivos, este trabalho iniciou uma análise comparativa entre os genomas de seis espécies de SHTs e seus respectivos TPEs, através de ferramentas de bioinformática. Com os genomas sequenciados e montados, foram preditos e anotados os genes de rRNAs, tRNAs e codifcadores de proteínas; identifcados os genes ortólogos, com objetivo de realizar uma comparação do conteúdo gênico, e também para realizar a comparação posterior por meio de inferência flogenética por máxima verossimilhança entre todos os grupos ortólogos encontrados entre A. ambiguus, A. deanei, A. desouzai, Strigomonas Galati, S. oncopelti e S. culicis, e entre os respectivos endossimbiontes. Foram feitas também análises flogenômicas através da construção de superárvores. O genoma do endossimbionte é bem reduzido, com perda no conteúdo GCe de genes ortólogos, como visto em os outros TPEs. A anotação funcional dos genes a partir das vias metabólicas do KEGG e utilizando o programa ASGARD mostrou que o TPE contribui fornecendo genes para completar muitas das vias de aminoácidos do SHT, como em alguns aminoácidos essenciais, tal qual prolina, arginina, valina, leucina, e outros não essenciais, comprovando a relação mutualística entre endossimbionte e hospedeiro, como é visto em outros trabalhos. Também, comprovou-se por flogenia multigênica que A. ambiguus está mais relacionada com A. desouzai, enquanto Candidatus Kinetoplastibacterium crithidii ‘amb’ está diretamente relacionado com o endossimbionte de A. deanei. No caso das espécies do gênero Strigomonas, cada fagelado possui sua própria espécie de endossimbionte, em perfeita coespeciação. O que provavelmente aconteceu foi a hibridização entre as espécies A. desouzai e A. deanei, permanecendo o núcleo da primeira e o endossimbionte da segunda espécie.