Detalhes bibliográficos
Ano de defesa: |
2020 |
Autor(a) principal: |
Villavicencio, Bianca |
Orientador(a): |
Verli, Hugo |
Banca de defesa: |
Não Informado pela instituição |
Tipo de documento: |
Tese
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Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
Idioma: |
por |
Instituição de defesa: |
Não Informado pela instituição
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Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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Departamento: |
Não Informado pela instituição
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País: |
Não Informado pela instituição
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Palavras-chave em Português: |
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Link de acesso: |
http://hdl.handle.net/10183/257954
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Resumo: |
O estudo de sistemas moleculares através de metodologias computacionais tem ganhado destaque no meio científico. Em particular, a busca do entendimento da estrutura e dinâmica de peptídeos mostra-se promissor, pois, apesar de serem tradicionalmente considerados sistemas de baixa estabilidade conformacional, suas características os tornam moléculas com um grande potencial biotecnológico e terapêutico. Dentre as modificações que podem ser feitas para interferir na manutenção estrutural de peptídeos estão a adição de restritores conformacionais, como grampos olefínicos, e a adição de açúcares, como a S-glicosilação. Neste trabalho, investigou-se o impacto dessas modificações em peptídeos através de simulações por dinâmica molecular. O tratamento de peptídeos grampeados por diferentes campos de força mostrou que o campo de força GROMOS54A7 apresentou melhor desempenho, mas ainda não reproduz na totalidade os efeitos observados experimentalmente. As simulações de peptídeos antimicrobianos S-glicosilados indicam que essa modificação incomum tem um impacto na flexibilidade do peptídeo, o que pode ter um impacto direto em sua atividade. Nos dois casos, seja com grampos olefínicos, seja com S-glicosilação, é possível antecipar o efeito conformacional dessas modificações em peptídeos. A obtenção de informações estruturais in silico permite a redução de custos associados ao desenvolvimento de peptídeos modificados e contribui para a possível modulação de processos biológicos de forma controlada e eficiente. |