Bioinformática estrutural aplicada ao estudo de peptídeos de interesse farmacológico e biotecnológico

• Ano de defesa: 2020
• Autor(a) principal: Villavicencio, Bianca
• Orientador(a): Verli, Hugo
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Palavras-chave em Português: Peptídeos; Bioinformática estrutural
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/10183/257954

O estudo de sistemas moleculares através de metodologias computacionais tem ganhado destaque no meio científico. Em particular, a busca do entendimento da estrutura e dinâmica de peptídeos mostra-se promissor, pois, apesar de serem tradicionalmente considerados sistemas de baixa estabilidade conformacional, suas características os tornam moléculas com um grande potencial biotecnológico e terapêutico. Dentre as modificações que podem ser feitas para interferir na manutenção estrutural de peptídeos estão a adição de restritores conformacionais, como grampos olefínicos, e a adição de açúcares, como a S-glicosilação. Neste trabalho, investigou-se o impacto dessas modificações em peptídeos através de simulações por dinâmica molecular. O tratamento de peptídeos grampeados por diferentes campos de força mostrou que o campo de força GROMOS54A7 apresentou melhor desempenho, mas ainda não reproduz na totalidade os efeitos observados experimentalmente. As simulações de peptídeos antimicrobianos S-glicosilados indicam que essa modificação incomum tem um impacto na flexibilidade do peptídeo, o que pode ter um impacto direto em sua atividade. Nos dois casos, seja com grampos olefínicos, seja com S-glicosilação, é possível antecipar o efeito conformacional dessas modificações em peptídeos. A obtenção de informações estruturais in silico permite a redução de custos associados ao desenvolvimento de peptídeos modificados e contribui para a possível modulação de processos biológicos de forma controlada e eficiente.