Detalhes bibliográficos
| Ano de defesa: |
2023 |
| Autor(a) principal: |
Santos, Alicia Camacho dos |
| Orientador(a): |
Eberlin, Marcos Nogueira |
| Banca de defesa: |
Não Informado pela instituição |
| Tipo de documento: |
Dissertação
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| Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
| Idioma: |
por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Presbiteriana Mackenzie
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: |
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| Link de acesso: |
https://dspace.mackenzie.br/handle/10899/31883
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Resumo: |
A COVID-19 é uma doença respiratória causada pelo vírus SARS-CoV-2, que se disseminou rapidamente gerando uma crise em escala global. A testagem em massa e diagnóstico na fase inicial da doença são medidas necessárias no combate da disseminação do vírus. Atualmente, o teste padrão ouro para diagnóstico da doença é a técnica de reação em cadeia da polimerase de transcrição reversa em tempo real (RT-qPCR, do inglês reverse transcription- quantitative polymerase chain reaction), o qual possui limitações em relação a sensibilidade, disponibilidade de insumos e até tempo prolongado de realização. Nesse contexto, torna-se relevante o desenvolvimento de novos testes que permitam a obtenção do diagnóstico de modo confiável e rápido. O objetivo desse projeto foi identificar assinaturas moleculares para o diagnóstico da COVID-19 em amostras de urina, utilizando o sistema MasSpec Pen acoplado a um espectrômetro de massas. Foram analisadas 236 amostras de urina por esse sistema, sendo 133 amostras de pacientes hospitalizados com sintomas da COVID-19 e 103 amostras de voluntários saudáveis. Para análise estatística dos dados, foi usada regressão LASSO (método de regressão penalizado, para seleção de variáveis) e o recurso de validação cruzada leave-one out. O classificador estatístico foi construído com base nos perfis de metabólitos das amostras de pacientes hospitalizados com diagnóstico positivo pelo teste de RT-qPCR, e voluntários assintomáticos com resultados negativo. Obteve-se parâmetros de sensibilidade de (100% e 89%), especificidade (100% e 96%), e acurácia (100% e 94%) nos conjuntos de treinamento e validação, respectivamente. O modelo também foi testado em dois conjuntos de amostras retidas, compostos por amostras de pacientes internados com sintomas da COVID-19 mas com diagnóstico negativo (N=23), e amostras que não atenderam aos critérios do período de coleta em relação ao início dos sintomas e data da coleta do swab para o RT-qPCR (N=71). Esses dados sugerem a análise da urina com a MasSpec Pen e Espectrometria de massas como uma metodologia promissora para diagnóstico rápido da COVID-19, com poucas etapas de pré processamento, sem a necessidade de reagentes caros e com elevada sensibilidade e especificidade. |
