Acessando o microbioma da rizosfera de cana-de-açúcar em cultivo orgânico comparado ao convencional

• Ano de defesa: 2019
• Autor(a) principal: Campanari, Maria Fernanda Zaneli [UNESP]
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
• Palavras-chave em Português: Metagenômica; Rizosfera; Cana-de-açúcar; Ecologia microbiana; Sequenciamento de nucleotídeos em larga escala; Whole-metagenome shotgun; plant-associated microbiome; plant growth promoting rhizobacteria
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/183634

O cultivo intensivo agrícola, apesar de altamente produtivo, possui diversos pontos questionáveis, como suplementação acentuada de insumos sintéticos, além da aplicação de defensivos para o controle de pragas que muitas vezes são danosos ao meio ambiente. Como alternativa, a agricultura orgânica propõe uma forma de manejo menos agressiva, que promove o uso sustentável dos recursos naturais renováveis, como o aproveitamento de resíduos orgânicos, além de possuir um maior valor agregado no produto final. No presente estudo, investigamos por meio de uma abordagem metagenômica os efeitos do manejo (orgânico ou convencional) na microbiota da rizosfera de cana-de-açúcar, região da planta que notoriamente causa um grande impacto no seu desenvolvimento e produtividade. Identificamos a abundância maior na rizosfera com manejo orgânico de porções genômicas que codificam enzimas associadas ao metabolismo do nitrogênio e enxofre, sendo que estes são nutrientes fundamentais para o sucesso da planta e assim, seu desenvolvimento e produtividade em campo. Contraditoriamente, encontramos também que os genomas da microbiota orgânica possuem conteúdo ligado a um potencial mais acentuado para a degradação de compostos xenobióticos, que são ativamente aplicados no manejo convencional. De acordo com nossa predição, os microrganismos dessa microbiota poderiam realizar sua completa mineralização, o que é muito favorável na remoção desses resíduos no ambiente. Esses achados indicam que há um potencial único para exploração do cultivo orgânico, além da capacidade de fornecer alimentos livres de agroquímicos por meio de um manejo que propende causar um menor impacto ao ambiente agroecológico. Consideramos, com base nos resultados, que esse ambiente pode ser uma fonte de bioprospecção de microrganismos associados aos ciclos de nutrientes, como N e S, além de potenciais degradadores de xenobióticos para biorremediação.