Comunidades de bactérias endofíticas e epifíticas associadas à cana-de-açúcar e prospecção de promotores de crescimento em plantas

• Ano de defesa: 2020
• Autor(a) principal: Sierra, Luis Guillermo Teheran
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
• Palavras-chave em Português: Amplicon; Culturômica; PGPB; Saccharum sp.; Simbiose; Culturomics; Symbiosis
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/194186

As bactérias associadas a plantas constituem apenas um dos grupos que conformam o microbioma, o qual é responsável pela nutrição, saúde e homeostase geral da planta. A prospecção de bactérias com traços de promoção de crescimento é uma alternativa para o aproveitamento do microbioma cultivável das plantas e é a principal fonte dos microrganismos benéficos usados como inoculantes. O presente estudo teve como objetivo investigar as comunidades de bactérias associadas aos diferentes tecidos (ambientes) de cana-de-açúcar sob duas formas de cultivo contrastantes, na forma de comunidades, tanto endofíticas como epifíticas, com capacidade de promoção de crescimento vegetal. Foram prospectadas 944 comunidades usando um meio de cultura proposto pelo grupo para conformar um banco de comunidades. Posteriormente foram testadas com experimentos in planta usando a gramínea Cynodon dactylon (grama bermuda). Posteriormente foram feitos testes de seleção baseados em características fenotípicas tais como a produção de ácido indol-acético - AIA e a capacidade de solubilização de fosfatos. Um grupo final de 17 comunidades foi caracterizado em profundidade, na busca de traços de promoção de crescimento vegetal em Brachiaria ruziziensis e outras características fisiológicas. Para identificar os membros das comunidades selecionadas, foi amplificada e sequenciada a região hipervariável V3-V4 do gene 16s rDNA na plataforma Illumina, acessando a abundância e riqueza de espécies em cada uma delas, potencial metabólico e redes de co-ocorrência, chegando no final, na identificação de 34 gêneros e 24 espécies distribuídas entre os filos Proteobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes e Actinobacteria. Foram identificados ademais, vários gêneros com alto nível de centralidade nas análises de redes: Chryseobacterium, Leucobacter e Pseudomonas. Finalmente foram classificadas as melhores cinco comunidades promotoras de crescimento em plantas a partir das análises e testes realizados, das quais, quatro vêm de cana-de-açúcar convencional e uma de cultura orgânica, quatro de colmo, e uma de folha. Das cinco, três pertencem ao nicho endofítico e dois epifíticos, as quais tem potencial para serem exploradas como inoculantes biológicos.