Análise de associação genômica para características de produção em búfalos de leite

• Ano de defesa: 2020
• Autor(a) principal: Roldan Montes, Valentina [UNESP]
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
• Palavras-chave em Português: Gwas; Leite; SNPs
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/202710

A busca por animais com maior potencial de produção e maior eficiência reprodutiva tem contribuído para a implementação de diferentes tipos de programas de seleção. Com a genômica, torna-se possível a seleção dos animais sem a necessidade de mensuração de seus próprios fenótipos e/ou de seus parentes, e tem-se, também, a possibilidade de realizar a busca de genes ou regiões cromossômicas envolvidas com a expressão das características, por meio do estudo de associação genômica ampla (GWAS). A GWAS tem como objetivo associar regiões do genoma com fenótipos de interesse, identificar possíveis regiões de maior efeito sobre a característica e, posteriormente, investigar as funções biológicas dos genes que foram encontrados nestas regiões, visando assim, aumentar a compreensão da influência genética sobre a expressão fenotípica. O objetivo desse trabalho foi identificar regiões genômicas associadas com as características de produção de leite (PL), produção de gordura (PG), produção de proteína (PP), e produção de mozzarella (PMZ), mediante análise de duas diferentes abordagens: regressão single-SNP e Bayes C, Em adição diferenciar os genes encontrados nessas regiões que podem auxiliar na interpretação da expressão e fisiologia da característica. Foram utilizados dados fenotípicos e genotípicos provenientes da primeira lactação de 4068, 372, 488, 482 búfalas da raça Murrah pertencentes ao programa de controle leiteiro de bubalinos mantidos pelo Departamento de Zootecnia da UNESP∕Jaboticabal, SP. No estudo de associação genômica ampla, foram identificadas algumas regiões cromossômicas polimórficas, sendo identificados 53 marcadores SNPs em comuns em ambas abordagens (Bayes C, regressão single-SNP), 30 SNPs para gordura, 18 para proteína e 5 para mozzarella. 9, 5 e 3 SNPs significativos para produção de gordura, proteína e mozzarella respetivamente pela abordagem Bayes C. 4 e 1 SNPs significativo para produção de gordura e proteína pela abordagem regressão single-SNP. Assim, os resultados têm permitido identificar diferentes regiões que continham genes importantes em diferentes processos biológicos e funções moleculares associadas pelo menos com um QTL, principalmente nos BBU6, BBU9, BBU3, BBU5 encontrassem os genes CRTC2, ILF2, RPS27, RHOBTB3, S100A1, S100A13, TRNAG-CCC, com efeito sob as diferentes características de qualidade do leite em búfalas avaliadas nessa pesquisa.