Identificação de marcadores químicos por metabolômica e por rede de moléculas relacionados a resistência constitutiva à Xanthomonas citri subsp. citri em folhas de Citrus spp.

• Ano de defesa: 2022
• Autor(a) principal: Melo, Fernanda Pereira de Souza Rosa de
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Estadual Paulista (Unesp)
• Palavras-chave em Português: Cancro cítrico; Citrus sinensis; Flavonoides; Marcadores químicos; Resistência à patógenos; Noxa; Produtos agricolas
• Link de acesso: http://hdl.handle.net/11449/234684

Citrus compõem um dos maiores produtos agrícolas de valor agregado no Brasil, movimentando bilhões de dólares por ano, fomentando a economia do país e causando grande impacto social. No entanto, os pomares de Citrus são vulneráveis a patógenos, como por exemplo a bactéria gram-negativa Xanthomonas citri subsp citri (Xcc), agente causador do cancro cítrico. Algumas espécies são consideradas resistentes, todavia, estudos que associam metabólitos especializados à resistência, são escassos. Neste estudo, para identificar marcadores químicos relacionados à resistência, investigamos o metaboloma foliar de 17 variedades comerciais de Citrus com diferentes graus de suscetibilidade e resistência. Preparamos extratos foliares e analisamos por cromatografia líquida de ultra-eficiência acoplada a espectrometria de alta-resolução (UHPLC-HRMS/MS) utilizando um método genérico para se obter uma visão ampla do metaboloma. Variações no fingerprint químico foram investigadas através de análises multivariadas utilizando os dados de LC-MS1. Os dados de MS/MS foram organizados na forma de rede de moléculas evidenciando as famílias estruturais. Os compostos foram anotados na rede por meio de comparação dos espectros experimentais com uma base de espectros in silico de produtos naturais seguido de ponderação taxonômica dos candidatos. Marcadores químicos da resistência foram selecionados a partir de uma rede de moléculas multi-informativa, após a integração dos resultados estatísticos da metabolômica. Isto nos deu uma análise complementar à estatística clássica para a visualização de dados de metabolômica e seleção de marcadores químicos. Seguindo esta abordagem, anotamos 1618 compostos de Citrus, pertencentes a 112 classes químicas normalizadas via ClassyFire. Selecionamos 12 metabólitos como potenciais marcadores químicos de resistência para duas espécies: Citrus reticulata (Ponkan e Satsuma) e Citrus japonica (Kumquat), majoritariamente da classe dos flavonoides, sendo eles: 5,3'-dihidroxi-6,7,8,4'-tetrametoxiflavona, Isoscutelareina 7,8-dimetil éter, 4-O- (beta-D-glucopiranosil) -D-ribitol, Hesperetina 7- (2,6-diramnosilglucosídeo), Ácido 1,4-Dicafeoilquínico, 4,7-Dimetil-6,7-dihidro-5H-2-pirindina, 5,7,3'-trihidroxiflavona, Herclavina, Apigenina 7-O-neohesperidosídeo, 3,7 (11) -Eudesmadien-2-ona, Digicitrina, 2- (1,3-Benzodioxol-5-il) -5,7-di-hidroxi-4H-1-benzopiran-4-ona. Nosso fluxo de trabalho possibilitou verificar variações do metaboloma de várias espécies que puderam ser correlacionadas com a resistência à patógenos. Tais metabólitos podem ser utilizados como marcadores químicos para direcionar a seleção de novas variedades mais resistentes e como alvo de estudos para o desenvolvimento de novos produtos naturais para o controle do cancro cítrico.