Diversidade de genes codificadores de enzimas do metabolismo secundário no microbioma do trato gastrointestinal de bovino da raça Nelore

• Ano de defesa: 2014
• Autor(a) principal: Freitas, Fernanda de Souza
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Viçosa
• Palavras-chave em Português: Nelore (Zebu); Bovino; Policetídeo sintases; Peptídeo sintetases não ribossomais; Metabolismo secundário; Microbiologia Agrícola
• Link de acesso: http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/6296

O estudo da diversidade de peptídeo sintetases não ribossomais (NRPS) e policetídeo sintases (PKS) de origem microbiana em ambientes naturais é uma importante ferramenta para a busca de metabólitos secundários de interesse industrial. Essa informação, aliada à descoberta da capacidade dos micro- organismos anaeróbios em sintetizar metabólitos secundários, torna o microbioma do trato gastrointestinal (TGI) do bovino da raça Nelore, caracterizado recentemente, um ambiente em potencial para a bioprospecção desses compostos. O objetivo desse estudo foi determinar a existência e diversidade de genes codificadores de PKS e NRPS no microbioma do TGI do bovino da raça Nelore por PCR-DGGE e pela construção e sequenciamento de bibliotecas de clones. Foram identificados genes codificadores de NRPS nos microbiomas do rúmen, retículo e omaso de um bovino da raça Nelore. A análise da PCR-DGGE demonstrou a variação da diversidade e da composição desses genes ao longo das comunidades analisadas. Os maiores índices de riqueza e diversidade foram encontrados na amostra da fração sólida do rúmen. Contudo, a maior parte das UTOs é compartilhada pelas quatro comunidades. A análise filogenética das sequências de aminoácidos dos domínios de adenilação (domínios A) das NRPS indica que as NRPS identificadas agrupam-se com peptídeo sintetases não caracterizadas de Butyrivibrio proteoclasticus B316, de Clostridium bolteae, de Coprococcus catus GD/7 e de Xanthomonas citri. As sequências traduzidas obtidas apresentaram entre 37 e 91 % de identidade em relação às depositadas no GenBank. A baixa identidade das sequências codificadoras do domínio A das NRPS, obtidas a partir do microbioma do TGI do bovino da raça Nelore, em relação a sequências depositadas no banco de dados do NCBI, indicaram que esse microbioma abriga um potencial inexplorado para a bioprospecção de novos produtos.