Padrões moleculares, diversidade genética e mapa parcial de ligação do cafeeiro

• Ano de defesa: 2001
• Autor(a) principal: Cabral, Terezinha Aparecida Teixeira
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Viçosa
• Palavras-chave em Português: Coffea arabica L.; Ciências Agrárias
• Link de acesso: http://www.locus.ufv.br/handle/123456789/11066

Cinqüenta e dois primers arbitrários foram utilizados para avaliar a reprodutibilidade e a influência do número de marcadores RAPD ( Random Amplified Polymorphic DNA) na estimação de distâncias genéticas entre 40 acessos do gênero Coffea do banco de germoplasma da UFV/EPAMIG (incluindo 4 espécies diferentes). A técnica RAPD mostrou-se adequada para a estimação de distâncias genéticas (complemento de Jaccard) entre acessos de Coffea, obtendo-se nível de reprodutibilidade de 76,88%. O número de locos não influenciou a formação dos grupos principais, mas influenciou a ordenação dos acessos dentro dos subgrupos. Para a caracterização molecular de 18 clones diferenciadores de raças de Hemileia vastatrix foram utilizados 35 primers da Operon Technologies, Inc. Os 35 primers identificaram 158 locos polimórficos. O agrupamento, utilizando o método UPGMA, foi realizado com base na matriz de valores de dissimilaridades (complemento de Jaccard), e os grupos formados foram compatíveis com as informações disponíveis na literatura sobre a origem genealógica. A técnica RAPD foi eficaz na caracterização dos clones diferenciadores, produzindo marcas específicas para cada clone. O mapa parcial de ligação gênica para Coffea arabica L. foi construído a partir de uma população segregante RC 1 obtida do cruzamento entre Mundo Novo (IAC 464-18) e Híbrido de Timor (CIFC 2570), sendo este último utilizado como genitor recorrente. Foram obtidos 93 marcadores RAPD, dos quais 87 (93,5%) apresentaram segregação 1:1 (P>0,01), quatro (4,4%) segregação 2:1 (P>0,05) e dois (2,2%) segregação 5:1 (P>0,05). Para construção do mapa, foram utilizados os 87 marcadores que segregaram 1:1, sendo que cinco não mostraram -se ligados aos grupos formados. Oitenta e dois marcadores RAPD resultaram em oito grupos de ligação cobrindo 540,6 cM. O s grupos obtidos tiveram uma boa densidade de marcadores, exceto dois grupos. O maior intervalo entre dois marcadores foi 36.4 cM, e 94,5% dos intervalos não excederam a 20 cM. O tamanho dos grupos de ligação apresentou alta correlação com o número de marcadores (r=0,887), indicando distribuição aleatória dos marcadores nos grupos. O número de grupos de ligação é inferior ao correspondente número haplóide de cromossomos (22) e, portanto, o genoma da espécie foi parcialmente explorado e muitas regiões ainda não foram identificadas.