Expressão gênica em bibliotecas de cDNA de pele de bovinos F2 (Holandês × Gir) infestados com o carrapato Riphicephalus (Boophilus) microplus
Ano de defesa: | 2009 |
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Autor(a) principal: | |
Orientador(a): | |
Banca de defesa: | |
Tipo de documento: | Tese |
Tipo de acesso: | Acesso aberto |
Idioma: | por |
Instituição de defesa: |
Universidade Federal de Viçosa
BR Genética e Melhoramento de Animais Domésticos; Nutrição e Alimentação Animal; Pastagens e Forragicul Doutorado em Zootecnia UFV |
Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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Departamento: |
Não Informado pela instituição
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País: |
Não Informado pela instituição
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Palavras-chave em Português: | |
Link de acesso: | http://locus.ufv.br/handle/123456789/1721 |
Resumo: | A resistência bovina ao carrapato Riphicephalus (Boophilus) microplus é herdável e está principalmente associada a animais zebu (Bos indicus), embora esteja também presente em menor nível em algumas raças taurinas (B. taurus). A elucidação da resistência genética é um dos fatores mais promissores para reduzir as perdas de produção e diminuir o custo de controle desse parasita na pecuária bovina tropical. Com o intuito de caracterizar genes funcionais envolvidos na resistência/susceptibilidade dos bovinos ao carrapato, duas bibliotecas de cDNA foram construídas a partir de pele de animais F2 (Holandês × Gir) resistentes e susceptíveis infestados com larvas de R. microplus. Foram sequenciadas 4.070 etiquetas de sequência expressa (EST - Expressed Sequence Tag) geradas a partir de amostras de pele de bovinos F2 (Holandês × Gir) infestados com o carrapato R. microplus. Do total de EST geradas para as duas bibliotecas, foram obtidas 2.700 sequências de alta qualidade. Os resultados do agrupamento geraram um conjunto não- redundante de 1.292 sequências únicas. Cerca de 790 destas sequências compartilharam similaridade significativa com sequências de proteínas conhecidas e 502 destas não apresentaram similaridade com sequências de proteínas presentes no banco de proteínas não-redundante (NCBI - National Center of Biotechnology Information). A análise do perfil funcional dos transcritos permitiu identificar 54 termos de ontologia gênica (GO-terms) significativamente (P<0,01) representados nos conjuntos de dados de res e sus quando comparadas ao genoma de B. Taurus. Foi estimada a porcentagem de genes presentes nos conjuntos de dados de ESTs. As predições para cobertura gênica foram de 49% (RES) e 40% (SUS). QRT-PCR foi usada para determinar o nível de expressão de quatro genes identificados nas bibliotecas de cDNA. As expressões relativas dos genes S100A7, TPT1, TRV6 e CST6 foram 2,01 (±0.6), 1,32 (±0.9), 1,53 (±1.2), 2,03 (±0.6), respectivamente. Esses resultados indicam que esses transcritos foram diferencialmente expressos (P=0.001) em lesões de pele de animais susceptíveis. No entanto, a expressão aumentada desses genes não parece conferir proteção aos animais suscetíveis à infestação com carrapato. Até o momento, nenhum estudo de genômica funcional com animais cruzados (Holandês × Gir) tem sido relatado. Os transcritos gerados neste estudo podem contribuir de forma substancial para o melhor entendimento da genômica funcional da interação parasita-hospedeiro neste tecido. |