Viabilidade de estudos de expressa-o genica a partir de material obtido por punção aspirativa por agulha fina em linfomas não-Hodgkin

• Ano de defesa: 2008
• Autor(a) principal: Corbi, Fernanda Cristina [UNIFESP]
• Tipo de documento: Dissertação
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP)
• Palavras-chave em Português: Linfoma não Hodgkin; Expressão Gênica; Biópsia por Agulha
• Link de acesso: http://repositorio.unifesp.br/handle/11600/24128

Recentemente, a punção aspirativa por agulha fina (PAAF) vem sendo utilizada como método para a obtenção de material para estudos de expressão gênica em alguns tipos de linfoma, na tentativa de substituir o banco de tumores a partir de tecido fresco congelado. Objetivos: Avaliar a quantidade e a qualidade do RNA obtido a partir de punção aspirativa de linfonodos por PAAF em linfomas nãoHodgkin e desenvolver estratégias para suprir eventuais falhas do método proposto, melhorando a qualidade e/ou a quantidade do material obtido por PAAF. Material e Métodos: A casuística foi constituída pelos pacientes com diagnóstico de LNH admitidos no Hospital São Paulo entre março de 2006 e dezembro de 2007, e que apresentaram linfonodomegalia periférica passível de punção. O grupo controle foi constituído por amígdalas (tecido linfóide reacional) de crianças submetidas à amigdalectomia no Hospital São Paulo. As punções foram realizadas com citoaspirador (amostra A) e seringa e agulha (amostra B). O RNA foi transcrito com o kit Superscript (Invitrogen) e a qualidade foi verificada a partir da amplificação de fragmentos de 155pb do gene β-ACTINA e de 311 pb do gene NOTCH-2. Resultados: Foram analisados 26 casos de LNH (52 amostras) e 10 amígdalas (20 amostras). A quantidade de RNA nas amostras de amígdalas obtidas com citoaspirador (A) variou de <1,0 a 6,2 µg. Nas amostras obtidas com seringa e agulha (B), a quantidade de RNA variou de <1,0 a 4,7µg. A quantidade de RNA nas amostras de LNH obtidas com citoaspirador (A) variou de <1,0 a 6,5 µg. Nas amostras obtidas com seringa e agulha (B) a quantidade de RNA variou de <1,0 a 5,5 µg. Em 19 (95%) das amostras de amígdalas conseguimos amplificar o fragmento do gene NOTCH-2. Na única amostra de controle em que não foi possível amplificar o gene NOTCH-2, houve amplificação do fragmento do gene β- ACTINA (155 pb). Nas amostras de LNH, conseguimos amplificar o fragmento do gene NOTCH-2 em apenas em 24 (46%) espécimens, mas conseguimos amplificar o fragmento do gene β-ACTINA em 51 (98%) delas. Na tentativa de aumentar a quantidade de RNA disponível em cada amostra, padronizamos a técnica de poliA PCR, que consiste na amplificação global de cDNAs poliadenilados. Conseguimos evidenciar aumento de 10 vezes na quantidade de cDNA na maioria dos casos e controles. A eficiência da reação foi verificada através da amplificação do fragmento do gene β-ACTINA, onde 100% dos controles e dos casos foram amplificados, e também do fragmento de 298 pb do gene PGK, onde 100% dos controles e 77% dos casos foram amplificados. Quando utilizamos o produto da reação de poliA PCR comparados com amostras de cDNA (cDNA versus cDNA poliA) através da técnica de Real Time PCR, conseguimos demonstrar equivalência nas amplificações em 100% das 15 amostras avaliadas, utilizando dois genes alvo e um gene constitutivo. Conclusão: Nossos resultados demonstram que a PAAF, tanto com o citoaspirador quanto com seringa e agulha, é uma boa fonte de pequena quantidade de RNA, mas suficiente para amplificar fragmentos de genes de aproximadamente 150 pb em mais de 95% das amostras. Através da técnica de poliA PCR conseguimos aumentar significativamente a quantidade de material genômico, obtendo resultados equivalentes ao uso de cDNA não amplificado, para futuros estudos de expressão gênica.