Detalhes bibliográficos
| Ano de defesa: |
2021 |
| Autor(a) principal: |
Romagnoli, Camila Lopes [UNIFESP] |
| Orientador(a): |
Não Informado pela instituição |
| Banca de defesa: |
Não Informado pela instituição |
| Tipo de documento: |
Tese
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| Tipo de acesso: |
Acesso aberto |
| Idioma: |
por |
| Instituição de defesa: |
Universidade Federal de São Paulo
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| Programa de Pós-Graduação: |
Não Informado pela instituição
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| Departamento: |
Não Informado pela instituição
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| País: |
Não Informado pela instituição
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| Palavras-chave em Português: |
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| Link de acesso: |
https://hdl.handle.net/11600/62359
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Resumo: |
A família Mycobacteriaceae é composta majoritariamente por bactérias saprofíticas e potencialmente patogênicas, encontradas em diversos ambientes naturais e artificiais, como sistemas de tratamento e distribuição de água. São capazes de sobreviver e multiplicar-se sob variáveis condições de temperatura, pH, oxigênio, o que atribui a essas bactérias a característica de serem ubíquas. Nosso grupo de pesquisa tem estudado a diversidade destas bactérias e seu potencial de biodegradar substratos de interesse industrial. O objetivo geral deste trabalho foi estudar uma coleção de isolados bacterianos pertencentes aos gêneros Mycobacterium, Mycolicibacter, Mycobacteroides e Mycolicibacterium para posicioná-los filogeneticamente, verificar a existência de novas espécies e avaliar o potencial de degradação de pectina, amido e carboximetilcelulose (CMC). Sequências de três genes (hsp65, rpoB V e 16S rRNA) foram utilizadas para realizar uma análise filogenética concatenada para 198 isolados com identificação inconclusiva, e os resultados apontaram para a existência de novas espécies. Assim, os genomas de cinco isolados (MYC017, MYC098, MYC101, MYC123 e MYC340) foram sequenciados e analisados. Os resultados das análises genômicas e filogenéticas confirmaram a existência de quatro novas espécies do gênero Mycolicibacter, para as quais foram realizados testes fenotípicos, bioquímicos e de susceptibilidade a antimicrobianos para caracterização e proposição de novas espécies. Adicionalmente, todos os isolados da coleção foram analisados por testes de triagem fenotípica qualitativa para avaliar a habilidade de degradação de pectina, amido e carboximetilcelulose. Os resultados revelaram a presença de bactérias com capacidade de degradar os substratos analisados, sendo que cinco isolados identificados como Mycolicibacterium austroafricanum (MYC038, MYC040, MYC211, MYC221 e MYC223) foram selecionados para avaliação de crescimento na presença de cada substrato como fonte única de carbono e para ter os genomas sequenciados para a busca de genes potencialmente envolvidos nas vias catabólicas de interesse. Foi possível encontrar dois genes potencialmente envolvidos na degradação de pectina (pel1 e kdgA), cinco de amido (malL, malQ, amyL, glgX2 e treX) e três de celulose (cel6, blgB e CBD2). Os resultados aqui apresentados contribuem para a taxonomia da família Mycobacteriaceae, em especial para o gênero Mycolicibacter, bem como para o conhecimento relacionado ao metabolismo de substratos de interesse industrial por parte de isolados de M. austroafricanum. |
