Análise molecular e citogenômica de elementos de transposição no grupo Dichotomius (Luederwaldtínia) sericeus (Coleoptera: Scarabaeidae)

• Ano de defesa: 2018
• Autor(a) principal: AMORIM, Igor Costa de
• Tipo de documento: Tese
• Tipo de acesso: Acesso aberto
• Idioma: por
• Instituição de defesa: Universidade Federal de Pernambuco; UFPE; Brasil; Programa de Pos Graduacao em Genetica
• Palavras-chave em Português: Citogenética; Filogenia molecular; Transposons de DNA
• Link de acesso: https://repositorio.ufpe.br/handle/123456789/32200

Em Dichotomius, o mapeamento de sequências repetitivas de DNA revelou uma dinâmica da heterocromatina constitutiva (HC), em relação à composição e localização cromossômica das sequências presentes na HC. Os objetivos deste estudo foram isolar, caracterizar e mapear elementos de transposição (TE) no grupo D. (L.) sericeus, visando verificar o papel desses TEs e se eles estão relacionados com a variação na composição e localização das sequências da HC. Além disso, visamos compreender a história evolutiva desses elementos. O isolamento dos elementos, sequenciamento NGS, caracterização por diferentes abordagens e Hibridização in situ fluorescente foram realizados. Os resultados revelaram elementos com domínios conservados de 11 superfamílias, seis retrotransposons e cinco transposons de DNA. Os mais conservados foram: Copia, Gypsy, PiggyBac e Tc1-Mariner. Também foram identificados TEs degenerados. A análise filogenética dos elementos conservados sugeriu eventos de transferência horizontal para sete TEs de três superfamílias entre diferentes táxons, incluindo cnidários, platelmintos e nematelmintos. Adicionalmente, foi observada herança vertical em diferentes elementos. O mapeamento cromossômico populacional foi realizado para os TEs DsTc1_5, DsPogo_8 e DgmarMITE. Variação na localização e abundância foram observados, sugerindo atividade desses elementos. Devido à natureza degenerada, o DgmarMITE possui mobilidade in trans, utilizando a transposase de elementos proximamente relacionados ou não. A predominância dos elementos encontrados na eucromatina sugere que eles podem estar inseridos em regiões intergênicas, em pseudogenes e/ou relacionados a modificações na estrutura e expressão dos genes. Além disso, esses elementos não estão relacionados diretamente com a variabilidade das sequências repetitivas da HC.